B-DNA
(c) Zephyris, CC BY-SA 3.0
B-DNA - detail
B-DNA je nejčastější druh dvoušroubovice DNA, který za normálních podmínek v buňkách zcela převažuje. Blíží se tradičnímu Watson-Crickovskému modelu dvoušroubovice. Dvoušroubovice B-DNA je pravotočivá, na jednu otáčku připadá cca 10,5 párů bází a průměr dvoušroubovice činí 2 nm.[1] Některé další helikální formy jsou ve srovnání s B-DNA zcela minoritní, ačkoliv zřejmě za určitých okolností mohou vznikat i v buňkách.
Porovnání s A-DNA a Z-DNA
| Atribut | A-DNA | B-DNA | Z-DNA |
| Točivá tendence šroubovice (chiralita) | pravotočivá | pravotočivá | levotočivá |
| Opakování | po každém páru | po každém páru | po každých dvou párech |
| Otočení po každém opakování | 32,7° | 34,3° | -60°/2 páry |
| Průměrný počet párů na jedno otočení šroubovice | 11 | 10,5 | 12 |
| Sklon páru k ose | 20° | −1,2° | -9° |
| Vzestup vůči ose na jeden pár | 2,3 Å (0,25 nm) | 3,32 Å (0,34 nm) | 3,8 Å (0,37 nm) |
| Vzestup vůči ose na jednu otočku | 28,2 Å (2,82 nm) | 33,2 Å (3,32 nm) | 45,6 Å (4,56 nm) |
| Průměr | 23 Å (2,3 nm) | 20 Å (2,0 nm) | 18 Å (1,8 nm) |
| Konformace nukleosidu | anti | anti | C: anti, G: syn |
| Konformace ribofuranózy | C3'-endo | C2'-endo | C: C2'-endo, G: C3'-endo |
Reference
- ↑ Vladimir N. Potaman; Richard R. Sinden. DNA: Alternative Conformations and Biology. [s.l.]: Landes Bioscience, Madame Curie Bioscience Database, 2000-. Dostupné online.
Externí odkazy
Obrázky, zvuky či videa k tématu B-DNA na Wikimedia Commons
Média použitá na této stránce
Bdna cropped.gif
Space-filling model animation of B-DNA, made with qutemol
Space-filling model animation of B-DNA, made with qutemol
A-DNA, B-DNA and Z-DNA.png
(c) Zephyris, CC BY-SA 3.0
From left to right, the structures of A-, B- and Z-DNA. The structure a DNA molecule depends on its environment. In aqueous enviromnents, including the majority of DNA in a cell, B-DNA is the most common structure. The A-DNA structure is dominates in dehydrated samples and is similar to the double-stranded RNA and DNA/RNA hybrids. Z-DNA is a rarer structure found in DNA bound to certain proteins.
(c) Zephyris, CC BY-SA 3.0
From left to right, the structures of A-, B- and Z-DNA. The structure a DNA molecule depends on its environment. In aqueous enviromnents, including the majority of DNA in a cell, B-DNA is the most common structure. The A-DNA structure is dominates in dehydrated samples and is similar to the double-stranded RNA and DNA/RNA hybrids. Z-DNA is a rarer structure found in DNA bound to certain proteins.