Trubénky

Jak číst taxoboxTrubénky
alternativní popis obrázku chybí
Trubénka Monosiga brevicollis
Vědecká klasifikace
DoménaEukaryota
(nezařazeno)Opisthokonta
KmenChoanoflagellatea
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Trubénky (Choanoflagellatea) jsou drobná jednobuněčná eukaryota ze skupiny Opisthokonta příbuzná živočichům (Metazoa), která však mohou vytvářet i kolonie s různým stupněm specializace jednotlivých jedinců. Základní límečková buňka je válcovitého tvaru s jedním tlačným bičíkem a věnečkem z mikrovilů (patrně slouží k filtraci). Buňky mohou mít membranózní obal či loriku z křemitých tyčinek.

Trubénky mohou být jak sladkovodní, tak mořské, plovoucí i přisedlé. Některé mohou fungovat i jako bioindikátor čisté vody. Živí se jako filtrátoři (někdy se symbiotickými zelenými řasami).

Trubének (Choanoflagellatea) je známo více než 125 druhů.[1]

Organizace a komunikace buněk

  • několik jedinců na společné stopce bez dotyku a komunikace
  • plochý útvar, jedinci spojeni lepkavými límečky
  • „hrudka“, kde bičíkatí jedinci jsou na povrchu a nebičíkatí uvnitř

Fylogeneze

Na tuto kapitolu je přesměrováno heslo Choanozoa.
Podrobnější informace naleznete v článku Klasifikace eukaryot, oddílu Fylogenetické stromy.

Podle současných molekulárních analýz[2][3][4][5][6] jsou trubénky sesterskou skupinou živočichů (Metazoa), u živočišných hub můžeme nalézt choanocyty, které jsou velmi podobné límečkové buňce trubének. Trubénky a živočichové tvoří spolu s taxony plísňovky (Ichthyosporea), Filasterea a Pluriformea klad Holozoa v rámci opisthokont.

Všechny jmenované skupiny kromě živočichů byly spolu s nukleáriemi (Cristidiscoidea) a afelidiemi (Aphelida) slučovány do parafyletického kmene Choanozoa,[7] jehož definice prošla několika úpravami[8] a v poslední verzi v podstatě představuje skupinu Opisthokonta zbavenou dvou korunových kladů – živočichů (ve smyslu Metazoa) a vlastních hub (Eumycota).

V rámci fylogeneticky přirozených systémů jsou nukleárie dnes řazeny spolu s houbami (Fungi) do skupiny Holomycota (syn. Nucletmycea), která je sesterská holozoím. Afelidie jsou dokonce považovány za vnitřní skupinu hub.[2][9][10]

Pokud se v současné době jméno Choanozoa používá pro přirozenou, monofyletickou skupinu, tak buď jako heterotypické synonymum pro Choanoflagellata[11] nebo jako označení kladu spojujícího v sobě trubénky (Choanoflagellatea) a živočichy (Metazoa).

V původním, parafyletickém vymezení jsou Choanozoa nadále (rok 2021) uváděna v některých přehledových a databázových internetových projektech jako Species 2000/Catalogue of Life,[12] AlgaeBase[13] či World Register of Marine Species.[14]

Systém

Vnitřní systematika trubének (Choanoflagellatea) může vypadat například takto (NCBI Taxonomy Browswer)[15]:

  • řád Craspedida – bez křemičité loriky (přirozený taxon[16])
    • čeleď Salpingoecidae (přirozený taxon[16])
      • Bicosta
      • Choanoeca
      • Codosiga
      • Desmarella
      • Hartaetosiga
      • Lagenoeca
      • Microstomoeca
      • Monosiga (přisedlá solitérní)
      • Mylnosiga
      • Paramonosiga
      • Proterospongia (kolonie plovoucí)
      • Salpingoeca (v lorice organické) (nepřirozený taxon[16])
      • Sphaeroeca (kolonie až 500 µm)
      • Stagondoeca
  • řád Acanthoecida – s křemičitou lorikou (přirozený taxon[16])
    • čeleď Acanthoecidae (přirozený taxon,[16] ale jen v užším vymezení, minimálně bez rodů Crinolina, Pleurasiga[17])
      • Acanthoeca
      • Acanthoecopsis
      • Cosmoeca
      • Crinolina
      • Enibas
      • Helgoeca
      • Parvicorbicula
      • Pleurasiga
      • Polyoeca
      • Savillea
    • čeleď Stephanoecidae (nepřirozený taxon[16])
      • Acanthocorbis
      • Calliacantha
      • Diaphanoeca
      • Didymoeca
      • Stephanoeca

Reference

  1. ↑ KING, Nicole, Westbrook, M.J.; Young, S.L.; Kuo, A.; Abedin, M.; Chapman, J.; Fairclough, S.; Hellsten, U.; Isogai, Y.; Letunic, I. The genome of the choanoflagellate Monosiga brevicollis and the origin of metazoans. Nature. 2008, svazek 451, čís. 7180, s. 783–788. DOI 10.1038/nature06617. PMID 18273011. (anglicky) 
  2. ↑ a b Sina M. Adl, Alastair G. B. Simpson, Mark A. Farmer, Robert A. Andersen, O. Roger Anderson, John A. Barta, Samual S. Bowser, Guy Bragerolle, Robert A. Fensome, Suzanne Fredericq, Timothy Y. James, Sergei Karpov, Paul Kugrens, John Krug, Christopher E. Lane, Louise A. Lewis, Jean Lodge, Denis H. Lynn, David G. Mann, Richard M. McCourt, Leonel Mendoza, Øjvind Moestrup, Sharon E. Mozley-Standridge, Thoams A. Nerad, Carol A. Shearer, Alexey V. Smirnov, Frederick W. Spiegel, Max F. J. R. Taylor. The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists. Journal of Eukaryotic Microbiology. 2005, roč. 52, čís. 5, s. 399–451. Dostupné v archivu pořízeném dne 2017-09-14.  Archivováno 14. 9. 2017 na Wayback Machine.
  3. ↑ SHALCHIAN-TABRIZI, Kamran; MINGE, Marianne A.; ESPELUND, Mari, Russell Orr, Torgeir Ruden, Kjetill S. Jakobsen, Thomas Cavalier-Smith. Multigene Phylogeny of Choanozoa and the Origin of Animals. S. 1–7, e2098. PLoS ONE [online]. 7. květen 2008 [cit. 2009-10-08]. Svazek 3, čís. 5, s. 1–7. Dostupné online. PDF [1]. (anglicky) 
  4. ↑ CAVALIER-SMITH, Thomas. Megaphylogeny, Cell Body Plans, Adaptive Zones: Causes and Timing of Eukaryote Basal Radiations. S. 26–33. Journal of eukaryotic microbiology [online]. 14. říjen 2008. Svazek 56, čís. 1, s. 26–33. Dostupné online. PDF [2]. ISSN 1550-7408. DOI 10.1111/j.1550-7408.2008.00373.x. (anglicky) 
  5. ↑ RUIZ-TRILLO, Iñaki; ROGER, Andrew J., Gertraud Burger, Michael W. Gray, B. Franz Lang. A Phylogenomic Investigation into the Origin of Metazoa. Molecular Biology and Evolution. 9. leden 2008, roč. 25, čís. 4, s. 664–672. Dostupné online [cit. 2009-10-08]. ISSN 1537-1719. DOI 10.1093/molbev/msn006. (anglicky) 
  6. ↑ ADL, Sina M., et al. The Revised Classification of Eukaryotes. S. 429–514. Journal of Eukaryotic Microbiology [online]. 28. září 2012. Svazek 59, čís. 5, s. 429–514. Dostupné online. PDF [3]. ISSN 1550-7408. DOI 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMID 23020233. (anglicky) 
  7. ↑ NITSCHE, Frank; CARR, Martin; ARNDT, Hartmut Arndt, LEADBEATER Barry S.C. Higher Level Taxonomy and Molecular Phylogenetics of the Choanoflagellatea. S. 26–33. Journal of eukaryotic microbiology [online]. 2. září 2011. Svazek 58, čís. 5, s. 26–33. Dostupné online. ISSN 1550-7408. DOI 10.1111/j.1550-7408.2011.00572.x. (anglicky) 
  8. ↑ CAVALIER-SMITH, Thomas. Early evolution of eukaryote feeding modes, cell structural diversity, and classification of the protozoan phyla Loukozoa, Sulcozoa, and Choanozoa. Kapitola Revision of Choanozoa, the ancestral opisthokont phylum, s. 153–156. European Journal of Protistology [online]. 19. říjen 2012. Svazek 49, čís. 2, s. 153–156. Dostupné online. ISSN 0932-4739. DOI 10.1016/j.ejop.2012.06.001. (anglicky) 
  9. ↑ Yu Liu; STEENKAMP, Emma T.; BRINKMANN, Henner, Lise Forget, Herve Philippe, B. Franz Lang. Phylogenomic analyses predict sistergroup relationship of nucleariids and Fungi and paraphyly of zygomycetes with significant support. S. 1–31. BMC Evolutionary Biology [online]. 25. listopad 2009 [cit. 2009-12-02]. 9 svazek, čís. 272, s. 1–31. Dostupné online. ISSN 1471-2148. DOI 10.1186/1471-2148-9-272. (anglicky) 
  10. ↑ WIJAYAWARDENE, Nalin N.; HYDE, Kevin D., Al-Ani L. K. T., Tedersoo L., Haelewaters D., Rajeshkumar K. C., Zhao R. L., Aptroot A., Leontyev D. V., Saxena R. K., Tokarev Y. S., Dai D. Q., Letcher P. M., Stephenson S. L., Ertz D., Lumbsch H. T., Kukwa M., Issi I. V., Madrid H., Phillips A. J. L., Selbmann L., Pfliegler W. P., Horváth E., Bensch K., Kirk P. M., Kolaříková K., Raja H. A., Radek R., Papp V., Dima B., Ma J., Malosso E., Takamatsu S., Rambold G., Gannibal P. B., Triebel D., Gautam A. K., Avasthi S., Suetrong S., Timdal E., Fryar S. C., Delgado G., Réblová M., Doilom M., Dolatabadi S., Pawłowska J., Humber R. A., Kodsueb R., Sánchez-Castro I., Goto B. T., Silva D. K. A., de Souza F. A., Oehl F., da Silva G. A., Silva I. R., Błaszkowski J., Jobim K., Maia L. C., Barbosa F. R., Fiuza P. O., Divakar P. K., Shenoy B. D., Castañeda-Ruiz R. F., Somrithipol S., Lateef A. A., Karunarathna S. C., Tibpromma S., Mortimer P. E., Wanasinghe D. N., Phookamsak R., Xu J., Wang Y., Tian F., Alvarado P., Li D. W., Kušan I., Matočec N., Maharachchikumbura S. S. N., Papizadeh M., Heredia G., Wartchow F., Bakhshi M., Boehm E., Youssef N., Hustad V. P., Lawrey J. D., Santiago A. L. C. M. A., Bezerra J. D. P., Souza-Motta C. M., Firmino A. L., Tian Q., Houbraken J., Hongsanan S., Tanaka K., Dissanayake A. J., Monteiro J. S., Grossart H. P., Suija A., Weerakoon G., Etayo J., Tsurykau A., Vázquez V., Mungai P., Damm U., Li Q. R., Zhang H., Boonmee S., Lu Y. Z., Becerra A. G., Kendrick B., Brearley F. Q., Motiejūnaitė J., Sharma B., Khare R., Gaikwad S., Wijesundara D. S. A., Tang L. Z., He M. Q., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Zhurbenko M. P., McKenzie E. H. C., Stadler M., Bhat D. J., Liu J. K., Raza M., Jeewon R., Nassonova E. S., Prieto M., Jayalal R. G. U., Erdoğdu M., Yurkov A., Schnittler M., Shchepin O. N., Novozhilov Y. K., Silva-Filho A. G. S., Liu P., Cavender J. C., Kang Y., Mohammad S., Zhang L. F., Xu R. F., Li Y. M., Dayarathne M. C., Ekanayaka A. H., Wen T. C., Deng C. Y., Pereira O. L., Navathe S., Hawksworth D. L., Fan X. L., Dissanayake L. S., Kuhnert E., Grossart H. P., Thines M. Outline of Fungi and fungus-like taxa. S. 1060–1456. Mycosphere [online]. Innovative Institute for Plant Health, Zhongkai University of Agriculture and Engineering, 18. březen 2020 [cit. 2020-09-05]. Svazek 11, čís. 1:8, s. 1060–1456. Dostupné online. ISSN 2077-7019. DOI 10.5943/mycosphere/11/1/8. (anglicky) 
  11. ↑ Schoch C. L., et al. NCBI Taxonomy: a comprehensive update on curation, resources and tools. Database (Oxford). Verze 2020: baaa062. Taxon: Choanoflagellata. Dostupné online (anglicky)
  12. ↑ Catalogue of Life Online database copyrighted by Species 2000 on behalf of the Catalogue of Life partners. Version 2020-12-01. Taxon Choanozoa. Dostupné online (anglicky)
  13. ↑ Guiry, M. D. & Guiry, G. M. 2021. AlgaeBase. World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway. https://www.algaebase.org; searched on 08 January 2021. Taxon Choanozoa. Dostupné online (anglicky)
  14. ↑ WoRMS Editorial Board (2021). World Register of Marine Species. Available from http://www.marinespecies.org at VLIZ. Accessed 2021-01-08. doi:10.14284/170. Taxon Choanozoa. Dostupné online (anglicky)
  15. ↑ Schoch C. L., et al. NCBI Taxonomy: a comprehensive update on curation, resources and tools. Database (Oxford). Verze 2020: baaa062. Taxon: Choanoflagellata. Dostupné online (anglicky)
  16. ↑ a b c d e f CARR, Martin; LEADBEATER, Barry S.C. Re-evaluating Loricate Choanoflagellate Phylogenetics: Molecular Evidence Points to the Paraphyly of Tectiform Species. Protist [online]. Elsevier GmbH, 2022-12. Roč. 173, čís. 6: 125924. ISSN 1434-4610. DOI 10.1016/j.protis.2022.125924. (anglicky) 
  17. ↑ CARR, Martin; LEADBEATER, Barry S.C. Re-evaluating Loricate Choanoflagellate Phylogenetics: Molecular Evidence Points to the Paraphyly of Tectiform Species. S. 125924. Protist [online]. Elsevier GmbH, 2022-12 [cit. 2023-02-28]. Roč. 173, čís. 6, s. 125924. Dostupné online. ISSN 1618-0941. DOI 10.1016/j.protis.2022.125924. PMID 36327744. (anglicky) 

Externí odkazy

Média použitá na této stránce

Information-silk.svg
Autor: , Licence: CC BY 2.5
A tiny blue 'i' information icon converted from the Silk icon set at famfamfam.com
Monosiga Brevicollis Phase.jpg
Autor: Stephen Fairclough, Licence: CC BY-SA 2.5
phase contrast image of Monosiga brevicollis, by Stephen Fairclough