DAPI
| DAPI | |
|---|---|
 Struktura | |
| Obecné | |
| Systematický název | 2-(4-amidinofenyl)-1H-indol-6-carboxamidin |
| Ostatní názvy | 4′,6-Diamidin-2-fenylindol |
| Anglický název | DAPI |
| Sumární vzorec | C16H15N5 |
| Vzhled | Žlutý až oranžový prášek |
| Identifikace | |
| Registrační číslo CAS | 28718-90-3 |
| PubChem | 2954 |
| ChEBI | 51231 |
| SMILES | [N@H]=C(N)c3ccc(c2cc1ccc(cc1n2)C(=[N@H])N)cc3 |
| Vlastnosti | |
| Molární hmotnost | 277.324 |
| Není-li uvedeno jinak, jsou použity jednotky SI a STP (25 °C, 100 kPa). | |
| Některá data mohou pocházet z datové položky. | |
DAPI (4',6-diamidin-2-fenylindol) je fluorescenční barvivo, které se pevně váže na AT bohaté oblasti v DNA.[1] DAPI se pro svou silnou fluorescenci a schopnost procházet buněčnou membránou běžně používá ve fluorescenční mikroskopii pro obarvení buněčných jader.
DAPI bylo poprvé syntetizováno roku 1971 v laboratoři Otto Danna při hledání léků proti trypanosomiáze, a i když jako lék nebylo používáno, výzkum DAPI ukázal, že se velmi silně váže na DNA a po vazbě fluoreskuje, což roku 1975 vedlo k objevu mitochondriální DNA při ultracentrifugaci.[2]
Mechanismus fluorescence
Po vazbě DAPI na DNA se až 20× zesiluje intenzita fluorescence, protože nedochází ke zhášení fluorescence molekulami vody v roztoku. Při vazbě na dvouvláknovou DNA má DAPI excitační maximum při 358 nm (ultrafialové světlo) a emisní maximum při 461 nm (modrá). DAPI se váže nejsilněji na úseky DNA bohaté na AT, kde se váže v poměru 1 molekula DAPI na 3 AT-páry.[1] Kromě toho se DAPI může vázat i na RNA, i když fluorescence je výrazně slabší a emisní maximum je posunuto k 500 nm.
Související články
- Barvení (biologie)
- Histologické preparáty
- Hoechstovo barvivo
Externí odkazy
Obrázky, zvuky či videa k tématu DAPI na Wikimedia Commons
Reference
V tomto článku byl použit překlad textu z článku DAPI na anglické Wikipedii.
- ↑ a b KAPUŚCIŃSKI, J.; SZER, W. Interactions of 4', 6-diamidine-2-phenylindole with synthetic polynucleotides.. Nucleic Acids Res. Aug 1979, roč. 6, čís. 11, s. 3519–34. PMID 493113.
- ↑ KAPUSCINSKI, J. DAPI: a DNA-specific fluorescent probe.. Biotech Histochem. Sep 1995, roč. 70, čís. 5, s. 220–33. PMID 8580206.
Média použitá na této stránce
a
This image is made from a Molecular Probes demo slide:
- Cells: bovine pulmonary arthery endothelial cells
- Blue: nucleus stained with DAPI
- Green: Tubulin (microtubles) stained with antibody Bodipy FL goat anti-mouse IgG (Indirect fluorescent antibody stain)
- Red: F-Actin stained with Texas Red X-Phalloidin
Autor: Richard Wheeler (Zephyris), Licence: CC BY-SA 3.0
DAPI (jedna z chemikálií používaných k barvení DNA, zde fialově) se vmezeřuje do malého žlábku DNA. Z PDB 1D30, vytvořeno pomocí PyMOL.
Struktura 4',6-diamidino-2-phenylindolu (DAPI)
Autor: Jakub Friedl, Licence: CC BY-SA 4.0
A pig oocyte taken from a young animal from a slaughterhouse. It is surrounded by small granulosa cells (most of them were removed). Colored with DAPI. Fluorescence microscopy. Objective lens 40x.