Dendrogram
Dendrogram je druh diagramu používaný ke znázornění jednotlivých kroků shlukové analýzy.
Při postupu výpočtu metodou aglomerativního dendrogramu vyjadřuje každý prvek samostatně na svislé ose. Horizontální osa vyjadřuje vzdálenost mezi jednotlivými shluky. Shluky se sjednocují podle nejkratší vzdálenosti (ať už měřeno Euklidovskou vzdáleností nebo jinou, či použitím jakékoliv metody počítání vzdáleností (nejbližšího souseda, nejvzdálenějšího, centroidní (těžiště) atd.)).
Svislou osou je možno hledat požadovanou míru shlukování. Dendrogram tak názorně ukazuje průběh celé analýzy a je tak možné výsledky procházet oběma směry – dopředným i zpětným a najít tak optimální výsledek.
Pro znázornění výsledků shlukové analýzy se používá také tzv. rampouchový diagram nebo tabulka s popisem jednotlivých a následných kroků.
Fylogenetický strom
Typicky se dendrogram využívá při znázorňování fylogenetického vývoje biologického druhu. Z tohoto znázornění se dobře určuje tzv. monofyletický (podle kladistů správně vytvořený) taxon – větev evolučního stromu, do které uvažujeme všechny poddruhy a nic navíc. Z této definice je například druh lidoopů nesprávně vytvořeným taxonem, protože uvažuje všechny velké opice, kromě člověka, přestože by měly být součástí taxonu všechny druhy sdílející společného předka.[1]
Reference
- ↑ FLEGR, Jaroslav. Zamrzlá evoluce. [s.l.]: Academia, 2008.
Externí odkazy
Obrázky, zvuky či videa k tématu Dendrogram na Wikimedia Commons
Média použitá na této stránce
Autor:
| This picture is a work by Emmanuel Douzery.
Please credit this with: Picture : Emmanuel Douzery in the immediate vicinity of the picture. If you use one of my works, please email me (account needed) or leave me a short message on my discussion page. It would be greatly appreciated! Do not copy this picture illegally by ignoring the terms of the license below, as it is not in the public domain. If you would like special permission to use, license, or purchase the picture, please contact me to negotiate terms. |
WPGMA dendrogram reconstructed from a distance matrix on 5 elements (a to e).