DnaA

DNA-vazebná doména (C-terminální doména IV) proteinu DnaA

DnaA je protein, který se u E. coli (a dalších bakterií) váže na ori oblast (replikační počátek) jejich bakteriálního chromozomu. Tato vazba je zásadní pro spuštění replikace bakteriální DNA, protože DnaA způsobuje místní denaturaci DNA, což je nezbytné pro správnou funkci DNA polymerázy.[1] Tomu dále pomáhá helikáza DnaB, jenž se váže na DnaA a rozplétá dvoušroubovici DNA.[2][3]

DnaA je u E. coli protein o velikosti 52 kDa, přičemž na replikační počátek se zřejmě váže až 30 takových proteinů.[2] DnaA přitom zřejmě rozeznávají tzv. DnaA-box, který má konsenzuální sekvenci 5′-TT(A\T)TNCACA.[4] Pro správnou vazbu DnaA proteinů se spotřebovává energie z hydrolýzy ATP.

U jaderných organismů (zejména na modelovém organismu S. cerevisiae) se vyskytuje funkčně příbuzný komplex, označovaný jako ORC (origin-recognition complex).[5]

Odkazy

Reference

  1. ↑ POLLARD, Thomas D; EARNSHAW, William C. Cell Biology. 2. vyd. [s.l.]: Saunders, 2007. 928 s. ISBN 1416022554. 
  2. ↑ a b Oxford dictionary of biochemistry and molecular biology; revised edition. Příprava vydání R. Cammack et al. New York: Oxford university press, 2006. ISBN 0-19-852917-1. 
  3. ↑ SEITZ, H.; WEIGEL, C.; MESSER, W. The interaction domains of the DnaA and DnaB replication proteins of Escherichia coli. Mol Microbiol.. 2000, roč. 37, čís. 5, s. 1270–9. Dostupné online. ISSN 0950-382X. 
  4. ↑ RÉDEI, George P. Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics. 3rd Edition. vyd. [s.l.]: Springer, 2008. ISBN 978-1-4020-6753-2. 
  5. ↑ KAWAKAMI, H.; KATAYAMA, T. DnaA, ORC, and Cdc6: similarity beyond the domains of life and diversity. Biochem Cell Biol.. 2010, roč. 88, čís. 1, s. 49–62. Dostupné online. ISSN 1208-6002. 

Související články

  • DnaB
  • DnaC
  • DnaG

Média použitá na této stránce

PDB 1j1v EBI.jpg
Cartoon representation of the molecular structure of protein registered with 1j1v code.