Gemmatimonadota

Jak číst taxoboxGemmatimonadetes
alternativní popis obrázku chybí
Vědecká klasifikace
Doménabakterie (Bacteria)
KmenGemmatimonadota
Zhang a kol. 2003
třídy

Gemmatimonadetes (Zhang a kol., 2003) Longimicrobia (Pascual a kol. 2016)

Některá data mohou pocházet z datové položky.

Bakteriální kmen Gemmatimonadota[1][2] byl formálně ustaven v roce 2003. Do současné doby obsahuje pouze pět popsaných druhů a dělí se do 2 tříd: Gemmatimonadetes a Longimicrobia. Jeho zástupci jsou aerobní a semiaerobní heterotrofní organismy. Gemmatimonadota jsou relativně běžnou složkou půdních mikrobiálních společenstev, kde tvoří 1–2 % přítomných bakterií. Nachází se také ve sladkých vodách, čistírnách odpadních vod a sedimentech.

Popsané druhy

První druh kmene Gemmatimonadota bakterie Gemmatimonas aurantiaca T-27T byla popsána roku 2003. Tato gramnegativní, tyčinkovitá a aerobní bakterie byla kultivován z aktivovaného kalu čističky odpadních vod.[3] Druhým popsaným druhem byla roku 2013 bakterie Gemmatirosa kalamazoonensis KBS708, která byla izolována z organicky obdělávané půdy v Michiganu v USA.[4]

Dalším popsaným druhem byla Gemmatimonas phototrophica AP64T, která byla roku 2014 izolována z mělkého sladkovodního jezera Tiān é hú nacházejícím se v čínské provincii Vnitřní Mongolsko[5]. Unikátní vlastností tohoto organismu je přítomnost fotosyntetických reakčních center. Tento organismus pravděpodobně získal své fotosyntetické geny horizontálním přenosem z fototrofních Proteobakterií. G. phototrophica je fakultativní fotoheterotrof. Pro svůj růst potřebuje přísun organických látek, ale je schopen pokrýt velkou část svých metabolických potřeb pomocí světelné energie.[6]

Bakterie Longimicrobium terrae CB-286315T byla izolována ze vzorku lesní půdy poblíž španělské Granady. Vzhledem ke své značné fylogenetické odlišnosti ustavila roku 2016 i novou třídu nazvanou Longimicrobia.[7] Posledním kultivovaným zástupcem Gemmatimonadota je Roseisolibacter agri AW1220T izolovaný ze zemědělské půdy v Namibii.[8]

Reference

  1. ↑ OREN, Aharon; GARRITY, George M. Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [online]. 2021-10-20 [cit. 2024-03-25]. Roč. 71, čís. 10. DOI 10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. (anglicky) 
  2. ↑ LPSN. Domain Bacteria. Dostupné online (anglicky)
  3. ↑ Zhang H, Sekiguchi Y, Hanada S, Hugenholtz P, Kim H, Kamagata Y, Nakamura K. Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gram-negative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov.. Int J Syst Evol Microbiol. 2003, roč. 53, čís. Pt 4, s. 1155–63. Dostupné v archivu pořízeném dne 2008-06-07.  Archivováno 7. 6. 2008 na Wayback Machine.
  4. ↑ DeBruyn J.M.; Fawaz M.N.; Peacock, A.D.; Dunlap J.R.; Nixon L.T.; Cooper K.E.; Radosevich M. Gemmatirosa kalamazoonesis gen. nov., sp. nov., a member of the rarelycultivated bacterial phylum Gemmatimonadetes.. J Gen Appl Microbiol. 2013, roč. 59, s. 305–312. 
  5. ↑ Zeng Y.; Selyanin V.; Lukeš M.; Dean J.; Kaftan D.; Feng F.; Koblížek M. Characterization of the microaerophilic, bacteriochlorophyll a-containing bacterium Gemmatimonas phototrophica sp. nov., and emended descriptions of the genus Gemmatimonas and Gemmatimonas aurantiaca.. Int J Syst Evol Microbiol. 2015, roč. 65, s. 2410–2419. 
  6. ↑ Zeng Y.; Feng F.; Medová H.; Dean J.; Koblížek M. Functional type 2 photosynthetic reaction centers found in the rare bacterial phylum Gemmatimonadetes.. Proc Natl Acad Sci USA. 2014, roč. 111, s. 7795–7800. 
  7. ↑ Pascual J.; García-López M.; Bills G.F.; Genilloud O. Longimicrobium terrae gen. nov., sp. nov., a novel oligotrophic bacterium of the underrepresented phylum Gemmatimonadetes isolated through a system of miniaturized diffusion chambers.. Int J Syst Evol Microbiol. 2016, roč. 66, s. 1976–1985. 
  8. ↑ PASCUAL, J., Foesel B.U., Geppert A., Huber K.J., Boedeker C., Luckner M., Wanner G., Overmann J. Roseisolibacter agri gen. nov., sp. nov., a novel slow-growing member of the under-represented phylum Gemmatimonadetes. Int J Syst Evol Microbiol. 2018, roč. 68, s. 1028–1036. 

Externí odkazy

Média použitá na této stránce

Information-silk.svg
Autor: , Licence: CC BY 2.5
A tiny blue 'i' information icon converted from the Silk icon set at famfamfam.com
Gemmatimonas aurantiaca.jpg
Autor: Satoshi Hanada, Licence: CC BY-SA 3.0
SEM image of Gemmatimonas aurantiaca. Bar = 1 micrometer.