Homeodoména

Homeodoména ve vazbě na DNA

Homeodoména je strukturní doména proteinů o délce asi 60 aminokyselin, schopný se vázat na DNA. Byl objeven nejprve u octomilek, kde proteiny s touto doménou regulují embryonální vývoj (např. tzv. Hox geny), ale dnes je známo obrovské množství takových proteinů včetně asi 150 v lidském genomu. Důležitou součástí homeodomény je helix-turn-helix motiv, složený ze dvou alfa-helixů, z nichž jeden se váže na velký žlábek DNA. V rámci homeodomény se však vyskytuje i další stabilizační raménko, které kontaktuje malý žlábek DNA.[1] Homeodoména je kódována 180-bázovou oblastí genů, tzv. homeoboxem.[2]

Odkazy

Reference

  1. ↑ POLLARD, Thomas D; EARNSHAW, William C. Cell Biology. 2. vyd. [s.l.]: Saunders, 2007. ISBN 1416022554. S. 928. 
  2. ↑ Oxford dictionary of biochemistry and molecular biology; revised edition. Příprava vydání R. Cammack et al. New York: Oxford university press, 2006. ISBN 0-19-852917-1. 

Související články

Média použitá na této stránce

Homeodomain-dna-1ahd.png
Autor: Opabinia regalis, Licence: CC BY-SA 3.0
The Antennapedia homeodomain protein from Drosophila melanogaster bound to a DNA fragment, illustrating the binding interactions of the recognition helix and unstructured N-terminus with the DNA major and minor grooves.