Mikrosatelit

Ukázka STR profilu.

Mikrosatelit (též krátké tandemové repetice nebo také STR = short tandem repeats) je označení pro sekvence repetitivní DNA, složené z opakujících se jednotek o velikosti obvykle v rozmezí 2-5 nukleotidů.[1]

Charakteristika

Oligonukleotidové jednotky se v jednom mikrosatelitu mnohokrát opakují, přičemž počet opakování (tedy délka fragmentu) je unikátní pro každého jedince.[2] STR oblast se může u daného člověka nacházet buď v homozygotním nebo heterozygotním stavu v závislosti na délce opakujícího se fragmentu v obou alelách. V lidském genomu jsou STR oblasti rozmístěny na většině chromosomů a obvykle se nachází v oblastech tzv. intronů. [1][2]

Využití

Díky diverzitě mikrosatelitů v populaci je analýza STR oblastí jednou ze základních metod pro forenzní analýzu. Detekce je založena na amplifikaci cílených úseků pomocí PCR s následným rozdělením vzniklých fragmentů pomocí elektroforézy. Další využití nachází analýza STR oblastí v otázkách genetického mapování, testování diverzity lidské populace nebo v oblastech genealogie či testů otcovství. V laboratořích se krátké tandemové repetice často využívají pro autentifikaci buněčných linií. [1][2]

Reference

  1. ↑ a b c Background information on STRs. strbase.nist.gov [online]. [cit. 2022-04-30]. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2022-05-14. 
  2. ↑ a b c KODÍČEK, Milan; VALENTOVÁ, Olga. Biochemie: chemický pohled na biologický svět. 2. vyd. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, 2018. 408 s. ISBN 978-80-7592-013-3. S. 198. 

Literatura

  • KODÍČEK, Milan; VALENTOVÁ, Olga. Biochemie: chemický pohled na biologický svět. 2. vyd. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, 2018. 408 s. ISBN 978-80-7592-013-3. S. 198. 

Externí odkazy

Média použitá na této stránce

STR electropherogram of a three person mixture.jpg
An electropherogram of a three person mixture in a 5:2:1 ratio using the Applied Biosystem's Identifiler STR kit