Klasifikace virů

Klasifikace virů je vzhledem k rozmanitosti a proměnlivosti virů problematičtější než klasifikace buněčných organismů. Proto existuje více možných přístupů a z nich vzniklých klasifikačních systémů.

Nejstarší klasifikační systémy virů vycházely z klasifikace napadaných organismů. Byla to například Holmesova klasifikace z roku 1948. Aplikovala linnéovskou biologickou nomenklaturu a členila viry na fágy (napadají bakterie), fytofágy (napadají rostliny) a zoofágy (napadají živočichy).

Později se viry začaly klasifikovat podle strukturních fyzikálních a chemických vlastností, jako je nosič genetické informace (RNA nebo DNA), velikost, tvar a symetrie kapsidy apod. K takovým klasifikačním systémům patří například hierarchická klasifikace LHT z roku 1962, dnes již zastaralá a nepoužívaná.

Aktuální snahou tvůrců biologických klasifikačních systémů je přirozenost z hlediska fylogenetické příbuznosti. O tu se snaží podrobný, každoročně aktualizovaný systém Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV).

V současnosti se stále používá také zjednodušená klasifikace podle nosiče genetické informace a způsobu jejího přepisu, takzvaná Baltimorova klasifikace z roku 1971. V některých aspektech je však již neslučitelná s moderní fylogenetickou klasifikací ICTV.

Vzhledem k tomu, že není známo příliš mnoho typů subvirových činitelů (viroidy, satelitní viry včetně virofágů, satelitní nukleové kyseliny včetně virusoidů, viriformy^{[pozn. 1]}), dlouho pro ně neexistoval odpovídající systém a byly klasifikovány pouze podle nosiče genetické informace, případně její velikosti. Výjimkou byl klasifikační systém viroidů podle Florese (Ricardo Flores, 1947–2020) z roku 1998,^[2] revidovaný Dienerem (Theodor Otto Diener, 1921–2023) v roce 2001,^[3] používající čeledi a rody. Později byl včleněn do systému ICTV, do kterého jsou od roku 2015 zahrnuty i vybrané satelitní viry (včetně virofágů) a satelitní nukleové kyseliny, a od roku 2021 též explicitně uváděné viriformy (dříve klasifikované jako viry).^[1]

Systém ICTV

Mezinárodní komise pro klasifikaci virů (International Committee on Taxonomy of Viruses – ICTV) klasifikuje jednotlivé druhy virů podobně jako buněčné organismy do říší, kmenů (případně i podkmenů), tříd, řádů (podřádů), čeledí (podčeledí) a rodů (podrodů). Nejvyšším taxonem, nadřazeným říším, je realm^{[pozn. 2]}. Systém ICTV důsledně používá metagenomický přístup.^[9]^[4] Snahou je přitom respektovat fylogenetickou příbuznost, tedy na základě genetické informace sdružovat taxony dané úrovně do skupin, u kterých lze předpokládat společného předka.

Standardními příponami v taxonomii jsou:^[1]

u virů (včetně satelitních virů a retrotranspozonů)
- pro realm: -viria
- pro říši: -virae
- pro kmen: -viricota
- pro podkmen: -virales
- pro třídu: -viricetes
- pro řád: -virales
- pro podřád: -virineae
- pro čeleď: -viridae
- pro podčeleď: -virinae
- pro rod a podrod: -virus;
u viroidů:
- pro čeleď: -viroidae
- pro rod: -viroid;
u viriforem:
- pro čeleď: -viriformidae
- pro rod: -viriform;
u satelitních nukleových kyselin:
- pro čeleď: -satellitidae
- pro podčeleď: -satellitinae
- pro rod: -satellite.

Virologická nomenklatura dlouho neměla předepsáno binomiální názvosloví pro druhy. Diskuse o jeho potřebnosti s cílem odstranit nejednotný přístup (názvy virových druhů byly tvořeny mnoha různými způsoby, vedoucími k výsledným jednoslovným až šestislovným názvům)^[10] vedly ke změně názvoslovného kódu, který od března 2021 pro nově navrhovaná druhová jména požaduje dvouslovné pojmenování s tím, že první jméno je totožné s pojmenováním rodu. (I u některých starších názvů postupně probíhá přejmenování na dvouslovné.)^[1]

Podle názvoslovného kódu ICTV se názvy všech vyšších taxonů píší stejně jako jména druhů kurzívou s velkým počátečním písmenem.^[1]

Aktuální klasifikace byla přijata v srpnu 2023 a ratifikována v dubnu 2024. Viry (druhy uznané ICTV) jsou systematicky kategorizovány do 6 realmů; vedle nich jedna třída, 22 čeledí a dva rody zůstávají nezařazeny.^[11]^[12]

Klasifikace virů dle ICTV zahrnuje také viroidy (nezařazené čeledi Avsunviroidae a Pospiviroidae), vybrané virofágy (třída Maveriviricetes realmu Varidnaviria) a jiné satelitní viry (např. v čeledi Parvoviridae realmu Monodnaviria, čeledích Tombusviridae a Virgaviridae a nezařazených rodech Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus realmu Riboviria, nebo čeledi Kolmioviridae realmu Ribozyviria^{[pozn. 3]}), retrotranspozony (čeledi Metaviridae a Pseudoviridae z řádu Ortervirales), viriformy (nezařazené čeledi Bartogtaviriformidae, Brachygtaviriformidae, Polydnaviriformidae, Rhodogtaviriformidae) a satelitní nukleové kyseliny (nezařazené čeledi Alphasatellitidae a Tolecusatellitidae). Z nově objevených (20. léta 21. století) viroidům podobných entit s kruhově uspořádaným genomem jsou v systému ICTV zařazeny na houbách hostující ambiviry^[13]^[14] (kmen Ambiviricota realmu Riboviria), ale dosud není definován taxon pro zařazení ucelené fylogenetické skupiny tzv. obelisků (popsaných teprve v r. 2024).^{[pozn. 4]}

V následujícím přehledu (do úrovně rodů) jsou navíc pro úplnost uvedeny i dosud neuznané navrhované taxony, vždy označené závorkou „(neuznaný/á)“. Návrh plyne z uvedené reference (zpravidla vědeckého periodika nebo webové složky ICTV s návrhy, u kterých dosud neskončil proces k jejich uznání^[18]). Taxony stejné úrovně jsou v rámci jednoho „rodičovského“ taxonu řazeny v souladu s ICTV dle anglické abecedy.^{[pozn. 5]}

Adnaviria

Realm: Adnaviria (1 říše)

Říše: Zilligvirae (1 kmen)
- Kmen: Taleaviricota (1 třída)
  - Třída: Tokiviricetes (3 řády)
    Řád: Ligamenvirales (3 čeledi)
    Čeleď: Lipothrixviridae (3 rody)
    Rod: Alphalipothrixvirus, Betalipothrixvirus, Deltalipothrixvirus
    Čeleď: Rudiviridae (7 rodů)
    Rod: Azorudivirus, Hoswirudivirus, Icerudivirus, Itarudivirus, Japarudivirus, Mexirudivirus, Usarudivirus
    Čeleď: Ungulaviridae (1 rod)
    Rod: Captovirus
    Řád: Maximonvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Ahmunviridae (1 rod)
    Rod: Yumkaaxvirus
    Řád: Primavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Tristromaviridae (2 rody)
    Rod: Alphatristromavirus, Betatristromavirus

Duplodnaviria

Realm: Duplodnaviria (1 říše)

Říše: Heunggongvirae (2 kmeny, 1 neuznaný kmen)
- Kmen (neuznaný): Mirusviricota^[19]^[20]^[21]
- Kmen: Peploviricota (1 třída)
  - Třída: Herviviricetes (1 řád)
    Řád: Herpesvirales (3 čeledi)
    Čeleď: Alloherpesviridae (4 rody)
    Rod: Batravirus, Cyvirus, Ictavirus, Salmovirus
    Čeleď: Malacoherpesviridae (2 rody)
    Rod: Aurivirus, Ostreavirus
    Čeleď: Orthoherpesviridae (3 podčeledi)
    Podčeleď: Alphaherpesvirinae (5 rodů)
    Rod: Iltovirus, Mardivirus, Scutavirus, Simplexvirus, Varicellovirus
    Podčeleď: Betaherpesvirinae (5 rodů)
    Rod: Cytomegalovirus, Muromegalovirus, Proboscivirus, Quwivirus, Roseolovirus
    Podčeleď: Gammaherpesvirinae (7 rodů)
    Rod: Bossavirus, Lymphocryptovirus, Macavirus, Manticavirus, Patagivirus, Percavirus, Rhadinovirus
- Kmen: Uroviricota (1 třída)
  - Třída: Caudoviricetes (7 řádů, 52 nezařazených čeledí, 54 nezařazených podčeledí, 601 nezařazených rodů, 1 neuznaný rod^{[pozn. 6]})^{[pozn. 7]}
    Rod: Abaiavirus, Abbeymikolonvirus, Abouovirus, Adaiavirus, Agmunavirus, Aguilavirus, Ahotrevirus, Akiravirus, Alachuavirus, Alcyoneusvirus, Alegriavirus, Alexandravirus, Amherstvirus, Amigovirus, Amiranvirus, Anamdongvirus, Anatolevirus, Andrewvirus, Andromedavirus, Anjalivirus, Anthonyvirus, Aokuangvirus, Appavirus, Apricotvirus, Aquaneticvirus, Aquingentivirus, Aramisvirus, Arawnvirus, Archimedesvirus, Armstrongvirus, Arvduovirus, Ashduovirus, Aspduovirus, Asteriusvirus, Astrithrvirus, Athenavirus, Atraxavirus, Attisvirus, Attoomivirus, Audreyjarvisvirus, Aurunvirus, Austintatiousvirus, Axeltriavirus, Ayohtrevirus, Aziravirus, Backyardiganvirus, Badaztecvirus, Baikalvirus, Baileybluvirus, Bakolyvirus, Bantamvirus, Barbavirus, Barnyardvirus, Bauervirus, Bcepfunavirus, Bcepmuvirus, Beceayunavirus, Becedseptimavirus, Beenievirus, Behunavirus, Bendigovirus, Benedictvirus, Bernalvirus, Betterkatzvirus, Bglawtbvirus, Bievrevirus, Bigmanorsvirus, Bingvirus, Bippervirus, Bismarckvirus, Bjornvirus, Bluefeathervirus, Bocovirus, Bonzeevirus, Borockvirus, Bowservirus, Branisovskavirus, Bridgettevirus, Brigitvirus, Britbratvirus, Brunovirus, Bruynoghevirus, Buchananvirus, Bugaksanvirus, Bunatrivirus, Burrovirus, Busanvirus, Caminolopintovirus, Camtrevirus, Cantarevirus, Capnelvirus, Carnodivirus, Carpasinavirus, Carvajevirus, Casadabanvirus, Cbastvirus, Cecivirus, Cedarrivervirus, Ceduovirus, Cequinquevirus, Certevirus, Chakrabartyvirus, Chaoshanvirus, Chenonavirus, Chertseyvirus, Chewyvirus, Chidieberevirus, Chopinvirus, Chymeravirus, Cimandefvirus, Cimpunavirus, Cinunavirus, Clawzvirus, Clownvirus, Coatlandelriovirus, Cobrasixvirus, Coetzeevirus, Coeurvirus, Colneyvirus, Colunavirus, Coralvirus, Corndogvirus, Coventryvirus, Craquatrovirus, Cronusvirus, Cukevirus, Daredevilvirus, Decurrovirus, Delepquintavirus, Delfunavirus, Delislevirus, Demosthenesvirus, Denisevirus, Deseoctovirus, Detrevirus, Deurplevirus, Dexdertvirus, Dhillonvirus, Dibbivirus, Dinavirus, Dismasvirus, Dolmabahcevirus, Donellivirus, Doucettevirus, Dubuvirus, Dybvigvirus, Eagleeyevirus, Edenvirus, Efemquintavirus, Efemunavirus, Efquatrovirus, Efunavirus, Eiauvirus, Eisenstarkvirus, Elemovirus, Elerivirus, Elmenteitavirus, Emalynvirus, Emdodecavirus, Emirosevirus, Emperorvirus, Eneladusvirus, Enfavirus, Enhodamvirus, Eowynvirus, Eponavirus, Ericdabvirus, Eurybiavirus, Eyrevirus, Fairfaxidumvirus, Fajavirus, Farahnazvirus, Fattrevirus, Feofaniavirus, Fernvirus, Ferozepurvirus, Fibralongavirus, Ficleduovirus, Finchvirus, Finkelvirus, Fipvunavirus, Firingavirus, Footloosevirus, Forzavirus, Fowlmouthvirus, Foxquatrovirus, Foxunavirus, Franklinbayvirus, Fremauxvirus, Fromanvirus, Fukuivirus, Fuzanglongvirus, Gaiavirus, Galaxyvirus, Galunavirus, Gamtrevirus, Gervaisevirus, Getseptimavirus, Ghobesvirus, Gilesvirus, Gilgameshvirus, Gillianvirus, Gimaduovirus, Gladiatorvirus, Glaedevirus, Godonkavirus, Gofduovirus, Goodmanvirus, Gordonvirus, Gordtnkvirus, Gorganvirus, Gorjumvirus, Grutrevirus, Gustavvirus, Hafyongvirus, Haihevirus, Halcyonevirus, Halfdanvirus, Hapunavirus, Harrisonburgvirus, Hattifnattvirus, Hedwigvirus, Heilongjiangvirus, Helsingorvirus, Hestiavirus, Hiroshimavirus, Hiyaavirus, Hnatkovirus, Hollowayvirus, Holosalinivirus, Homburgvirus, Howevirus, Hubeivirus, Hulijingvirus, Hungariovirus, Iaduovirus, Ibantikvirus, Identitycrisisvirus, Ignaciovirus, Ikedavirus, Ilzatvirus, Immutovirus, Incheonvirus, Indlulamithivirus, Inhavirus, Iodovirus, Ionavirus, Isoldevirus, Ittyvirus, Jacevirus, Jarrellvirus, Jasminevirus, Jenstvirus, Jimmervirus, Jouyvirus, Juiceboxvirus, Jujuvirus, Junavirus, Kafunavirus, Kairosalinivirus, Kamchatkavirus, Kelleziovirus, Kelquatrovirus, Kimonavirus, Klausavirus, Kleczkowskavirus, Klementvirus, Knuthellervirus, Kochitakasuvirus, Kojivirus, Konstantinevirus, Korravirus, Kostyavirus, Krampusvirus, Krompvirus, Kroosvirus, Krylovvirus, Kryptosalinivirus, Kuleanavirus, Kumottavirus, Kungbxnavirus, Kunmingvirus, Kylevirus, Lacnuvirus, Lacusarxvirus, Lafunavirus, Lagaffevirus, Lahexavirus, Lambdavirus, Lambovirus, Lanavirus, Larmunavirus, Laroyevirus, Lastavirus, Latrobevirus, Lebronvirus^[24] (neuznaný), Lederbergvirus, Leicestervirus, Lentavirus, Leonardvirus, Lessievirus, Lietduovirus, Lightbulbvirus, Lilbeanievirus, Lillamyvirus, Lilspottyvirus, Lilyvirus, Lishizhenvirus, Llyrvirus, Lokivirus, Lomovskayavirus, Loughboroughvirus, Lubbockvirus, Luchadorvirus, Luckybarnesvirus, Luckytenvirus, Ludhianavirus, Lughvirus, Lwoffvirus, Maaswegvirus, Macdonaldcampvirus, Magadivirus, Magiavirus, Majavirus, Malagasyrosevirus, Manovirus, Mapvirus, Mardecavirus, Mareflavirus, Marfavirus, Marienburgvirus, Marthavirus, Marvinvirus, Maxrubnervirus, Mboquatrovirus, Mcgonagallvirus, Meadowvirus, Medeavirus, Menderavirus, Metrivirus, Miamivirus, Micavirus, Microwolfvirus, Midgardsormrvirus, Miecznikowavirus, Mieseafarmvirus, Miltoncavirus, Mimasvirus, Minunavirus, Mohonavirus, Mollymurvirus, Montyvirus, Moturavirus, Mudcatvirus, Mufasoctovirus, Muldoonvirus, Muminvirus, Murrayvirus, Mushuvirus, Muvirus, Mycoabscvirus, Myoalterovirus, Myosmarvirus, Myradeevirus, Myxoctovirus, Naesvirus, Namazuvirus, Nanhaivirus, Nankokuvirus, Neferthenavirus, Nesevirus, Nevevirus, Nickievirus, Nimduovirus, Nonanavirus, Northamptonvirus, Nyceiraevirus, Nylescharonvirus, Obolenskvirus, Oengusvirus, Omegavirus, Oneupvirus, Onyinyevirus, Orchidvirus, Oscarsovirus, Oshimavirus, Otakuvirus, Paclarkvirus, Pagevirus, Pahexavirus, Pankowvirus, Papyrusvirus, Parlovirus, Patiencevirus, Pavtokvirus, Pawinskivirus, Pbunavirus, Pemunavirus, Pepyhexavirus, Perisivirus, Persistencevirus, Phabiovirus, Phabquatrovirus, Pharaohvirus, Phifelvirus, Phleivirus, Phrappuccinovirus, Picardvirus, Pikminvirus, Piorkowskivirus, Plaisancevirus, Plateaulakevirus, Pleeduovirus, Pleetrevirus, Polybotosvirus, Ponsvirus, Popoffvirus, Porunavirus, Poushouvirus, Powerballvirus, Predatorvirus, Psavirus, Pukovnikvirus, Pulverervirus, Pumpernickelvirus, Punavirus, Puppervirus, Purivirus, Qingdaovirus, Questintvirus, Quivirus, Radostvirus, Rahariannevirus, Raleighvirus, Rauchvirus, Ravarandavirus, Ravinvirus, Readingvirus, Refugevirus, Rerduovirus, Richievirus, Rigallicvirus, Rimavirus, Rivsvirus, Rockefellervirus, Rockvillevirus, Rogerhendrixvirus, Ronaldovirus, Rosariovirus, Rosemountvirus, Roslyckyvirus, Roufvirus, Rovertvirus, Rowavirus, Ruthyvirus, Ryyoungvirus, Saclayvirus, Sagamiharavirus, Saintgironsvirus, Salmondvirus, Saltrevirus, Samaravirus, Samunavirus, Samwavirus, Sandinevirus, Sansavirus, Santafevirus, Santhisvirus, Saphexavirus, Sargevirus, Sarumanvirus, Sasdunavirus, Sashavirus, Sasquatchvirus, Sasvirus, Saundersvirus, Sawaravirus, Scappvirus, Scapunavirus, Schmidvirus, Schmittlotzvirus, Schnabeltiervirus, Schubertvirus, Seahorsevirus, Seamegvirus, Segzyvirus, Sendosyvirus, Seongbukvirus, Serbinvirus, Seretavirus, Serwervirus, Seussvirus, Sextaecvirus, Sfunavirus, Shandongvirus, Sheenvirus, Sherbrookevirus, Shirahamavirus, Shockervirus, Shoyavirus, Shuimuvirus, Siatvirus, Sidiousvirus, Siftrevirus, Silentrexvirus, Sixamavirus, Skarprettervirus, Skatevirus, Skogvirus, Skulduggeryvirus, Skunavirus, Slashvirus, Sleepyheadvirus, Smoothievirus, Snuvirus, Sonalivirus, Sortsnevirus, Soupsvirus, Sourvirus, Sozzivirus, Sparkyvirus, Spartoivirus, Spbetavirus, Spizizenvirus, Squashvirus, Stanholtvirus, Steinhofvirus, Stonewallvirus, Stormageddonvirus, Successvirus, Sukhumvitvirus, Svunavirus, Swiduovirus, Syrbvirus, Tabernariusvirus, Tandoganvirus, Tankvirus, Tantvirus, Taranisvirus, Tepukevirus, Terapinvirus, Teubervirus, Theosmithvirus, Thiercelinvirus, Thornevirus, Tieomvirus, Tigunavirus, Tijeunavirus, Timshelvirus, Tinduovirus, Titanvirus, Toutatisvirus, Triavirus, Trigintaduovirus, Trinavirus, Trinevirus, Triplejayvirus, Turbidovirus, Typhavirus, Uetakevirus, Uwajimavirus, Valentinivirus, Vanleevirus, Vashvirus, Vedamuthuvirus, Veewebvirus, Veracruzvirus, Vespunovirus, Vhmlvirus, Vhulanivirus, Vibakivirus, Vicosavirus, Vidquintavirus, Vieuvirus, Vividuovirus, Waukeshavirus, Wbetavirus, Weaselvirus, Whackvirus, Whiteheadvirus, Whytuvirus, Wifcevirus, Wizardvirus, Woesvirus, Wollypogvirus, Wolominvirus, Woodruffvirus, Xajduovirus, Xiamenvirus, Xipdecavirus, Xuquatrovirus, Yanchengvirus, Yeceytrevirus, Yokohamavirus, Yoloswagvirus, Yongloolinvirus, Yvonnevirus, Zetavirus, Zhangqianvirus, Zhuquevirus, Zitchvirus, Zukovirus
    Podčeleď: Andregratiavirinae (2 rody)
    Rod: Haetaevirus, Kirovvirus
    Podčeleď: Andrewesvirinae (2 rody)
    Rod: Denvervirus, Vipetofemvirus
    Podčeleď: Arquatrovirinae (11 rodů)
    Rod: Arequatrovirus, Caelumvirus, Camvirus, Celiavirus, Hautrevirus, Janusvirus, Likavirus, Omarvirus, Salutenavirus, Sentinelvirus, Yosifvirus
    Podčeleď: Azeevirinae (4 rody)
    Rod: Galvastonvirus, Liebevirus, Manhattanvirus, Yangvirus
    Podčeleď: Azeredovirinae (2 rody)
    Rod: Dubowvirus, Phietavirus
    Podčeleď: Bclasvirinae (12 rodů)
    Rod: Acadianvirus, Birdsnestvirus, Coopervirus, Imvubuvirus, Julieunavirus, Lilmcdreamyvirus, Pegunavirus, Pipefishvirus, Quesadillavirus, Rosebushvirus, Saguarovirus, Thonkovirus
    Podčeleď: Beaumontvirinae (3 rody)
    Rod: Bixiavirus, Salvavirus, Siaravirus
    Podčeleď: Beephvirinae (3 rody)
    Rod: Flowerpowervirus, Immanueltrevirus, Manuelvirus
    Podčeleď: Bronfenbrennervirinae (2 rody)
    Rod: Biseptimavirus, Peeveelvirus
    Podčeleď: Ceeclamvirinae (2 rody)
    Rod: Bixzunavirus, Myrnavirus
    Podčeleď: Chebruvirinae (1 rod)
    Rod: Brujitavirus
    Podčeleď: Daemsvirinae (2 rody)
    Rod: Elesarvirus, Nanditavirus
    Podčeleď: Dclasvirinae (2 rody)
    Rod: Hawkeyevirus, Plotvirus
    Podčeleď: Deejayvirinae (3 rody)
    Rod: Kenoshavirus, Secretariatvirus, Tanisvirus
    Podčeleď: Deeyouvirinae (2 rody)
    Rod: Nevillevirus, Octobienvirus
    Podčeleď: Dolichocephalovirinae (4 rody)
    Rod: Bertelyvirus, Colossusvirus, Poindextervirus, Shapirovirus
    Podčeleď: Eekayvirinae (2 rody)
    Rod: Akonivirus, Tinytimothyvirus
    Podčeleď: Eucampyvirinae (2 rody)
    Rod: Firehammervirus, Fletchervirus
    Podčeleď: Feeclasvirinae (3 rody)
    Rod: Corgivirus, Idahovirus, Noelyvirus
    Podčeleď: Gclasvirinae (5 rodů)
    Rod: Antsirabevirus, Avocadovirus, Jolieduovirus, Liefievirus, Pinnievirus
    Podčeleď: Gochnauervirinae (4 rody)
    Rod: Dragolirvirus, Harrisonvirus, Vegasvirus, Wanderervirus
    Podčeleď: Gordonclarkvirinae (3 rody)
    Rod: Kuravirus, Nieuwekanaalvirus, Suseptimavirus
    Podčeleď: Gorskivirinae (5 rodů)
    Rod: Dilongvirus, Flaumdravirus, Kremarvirus, Otagovirus, Shenlongvirus
    Podčeleď: Gracegardnervirinae (6 rodů)
    Rod: Avanivirus, Cheoctovirus, Cornievirus, Moomoovirus, Squirtyvirus, Thetabobvirus
    Podčeleď: Guarnerosvirinae (3 rody)
    Rod: Beetrevirus, Mechnikovvirus, Torontovirus
    Podčeleď: Guernseyvirinae (3 rody)
    Rod: Cornellvirus, Jerseyvirus, Kagunavirus
    Podčeleď: Gutmannvirinae (4 rody)
    Rod: Carmenvirus, Layangavirus, Layangbvirus, Pebcunavirus
    Podčeleď: Heleneionescovirinae (2 rody)
    Rod: Kenyattavirus, Zhangjivirus
    Podčeleď: Hendrixvirinae (9 rodů)
    Rod: Byrnievirus, Cuauhtlivirus, Kwaitsingvirus, Nochtlivirus, Saikungvirus, Shamshuipovirus, Wanchaivirus, Wongtaivirus, Yautsimvirus
    Podčeleď: Iiscvirinae (2 rody)
    Rod: Aryavirus, Jilinvirus
    Podčeleď: Jameshumphriesvirinae (10 rodů)
    Rod: Bimevirus, Chaoyangvirus, Geezettvirus, Jedunavirus, Mascletvirus, Parissaclayvirus, Peatvirus, Ringroadvirus, Sircambvirus, Zewailvirus
    Podčeleď: Joanripponvirinae (3 rody)
    Rod: Natevirus, Sophritavirus, Tsamsavirus
    Podčeleď: Johnpaulvirinae (2 rody)
    Rod: Eidolonvirus, Kharnvirus
    Podčeleď: Jondennisvirinae (3 rody)
    Rod: Kilunavirus, Kipunavirus, Septimatrevirus
    Podčeleď: Kantovirinae (2 rody)
    Rod: Beograduvirus, Tsukubavirus
    Podčeleď: Kutznervirinae (5 rodů)
    Rod: Kozievirus, Meganvirus, Mementomorivirus, Metamorphoovirus, Quhwahvirus
    Podčeleď: Langleyhallvirinae (3 rody)
    Rod: Getalongvirus, Horusvirus, Phistoryvirus
    Podčeleď: Mccleskeyvirinae (2 rody)
    Rod: Limdunavirus, Unaquatrovirus
    Podčeleď: Munstervirinae (4 rody)
    Rod: Aceathervirus, Adovirus, Ahaonvirus, Atrivirus
    Podčeleď: Nclasvirinae (1 rod)
    Rod: Charlievirus
    Podčeleď: Nymbaxtervirinae (2 rody)
    Rod: Baxterfoxvirus, Nymphadoravirus
    Podčeleď: Ounavirinae (4 rody)
    Rod: Felixounavirus, Kolesnikvirus, Mooglevirus, Suspvirus
    Podčeleď: Pclasvirinae (6 rodů)
    Rod: Bignuzvirus, Fishburnevirus, Phayoncevirus, Purkyvirus, Tortellinivirus, Xaviavirus
    Podčeleď: Queuovirinae (8 rodů)
    Rod: Amoyvirus, Iggyvirus, Micathvirus, Nipunavirus, Nonagvirus, Seuratvirus, Shangdongvirus, Torvergatavirus
    Podčeleď: Ruthgordonvirinae (6 rodů)
    Rod: Catfishvirus, Dardanusvirus, Gesputvirus, Schmidtvirus, Tinalinvirus, Vendettavirus
    Podčeleď: Sejongvirinae (2 rody)
    Rod: Basiliskvirus, Yihwangvirus
    Podčeleď: Sepvirinae (3 rody)
    Rod: Diegovirus, Oslovirus, Traversvirus
    Podčeleď: Skryabinvirinae (2 rody)
    Rod: Bembunaquatrovirus, Pushchinovirus
    Podčeleď: Skurskavirinae (2 rody)
    Rod: Baldwinvirus, Pakpunavirus
    Podčeleď: Stanbaylleyvirinae (2 rody)
    Rod: Shirevirus, Subavirus
    Podčeleď: Stephanstirmvirinae (2 rody)
    Rod: Justusliebigvirus, Phapecoctavirus
    Podčeleď: Trabyvirinae (2 rody)
    Rod: Jelitavirus, Slepowronvirus
    Podčeleď: Tybeckvirinae (4 rody)
    Rod: Douglaswolinvirus, Lenusvirus, Lidleunavirus, Maenadvirus
    Podčeleď: Vequintavirinae (7 rodů)
    Rod: Avunavirus, Certrevirus, Henunavirus, Mydovirus, Septuagintavirus, Seunavirus, Vequintavirus
    Podčeleď: Weiservirinae (8 rodů)
    Rod: Amginevirus, Aminayvirus, Anayavirus, Fionnbharthvirus, Keshuvirus, Kratiovirus, Timquatrovirus, Unicornvirus
    Čeleď: Ackermannviridae (2 podčeledi, 7 nezařazených rodů)
    Rod: Campanilevirus, Kujavirus, Miltonvirus, Nezavisimistyvirus, Taipeivirus, Tedavirus, Vapseptimavirus
    Podčeleď: Aglimvirinae (2 rody)
    Rod: Agtrevirus, Limestonevirus
    Podčeleď: Cvivirinae (1 rod)
    Rod: Kuttervirus
    Čeleď: Aggregaviridae (1 rod)
    Rod: Harrekavirus
    Čeleď: Aliceevansviridae (3 rody)
    Rod: Brussowvirus, Moineauvirus, Vansinderenvirus
    Čeleď: Arenbergviridae (1 rod)
    Rod: Wroclawvirus
    Čeleď: Assiduviridae (3 rody)
    Rod: Cebadecemvirus, Cellubavirus, Nekkelsvirus
    Čeleď: Autographiviridae (9 podčeledí, 71 nezařazených rodů)
    Rod: Aegirvirus, Anchaingvirus, Aqualcavirus, Ashivirus, Atuphduovirus, Ayakvirus, Ayaqvirus, Banchanvirus, Bifseptvirus, Bonnellvirus, Cheungvirus, Chosvirus, Cuernavacavirus, Cyclitvirus, Ermolevavirus, Foturvirus, Foussvirus, Fussvirus, Gajwadongvirus, Gyeongsanvirus, Igirivirus, Jalkavirus, Jiaoyazivirus, Kafavirus, Kajamvirus, Kakivirus, Kalppathivirus, Kelmasvirus, Kembevirus, Krakvirus, Lauvirus, Limelightvirus, Lingvirus, Lirvirus, Lullwatervirus, Maculvirus, Napahaivirus, Nohivirus, Oinezvirus, Paadamvirus, Pagavirus, Pairvirus, Pedosvirus, Pekhitvirus, Pelagivirus, Percyvirus, Piedvirus, Podivirus, Pollyceevirus, Poseidonvirus, Powvirus, Pradovirus, Qadamvirus, Scottvirus, Sednavirus, Serkorvirus, Sieqvirus, Stompelvirus, Stopalavirus, Stopavirus, Stupnyavirus, Tangaroavirus, Tawavirus, Tiamatvirus, Tiilvirus, Tritonvirus, Voetvirus, Votkovvirus, Waewaevirus, Wuhanvirus, Youngvirus
    Podčeleď: Beijerinckvirinae (3 rody)
    Rod: Daemvirus, Friunavirus, Pettyvirus
    Podčeleď: Colwellvirinae (5 rodů)
    Rod: Gutovirus, Kaohsiungvirus, Murciavirus, Trungvirus, Uliginvirus
    Podčeleď: Corkvirinae (4 rody)
    Rod: Kantovirus, Kotilavirus, Phimunavirus, Stompvirus
    Podčeleď: Krylovirinae (4 rody)
    Rod: Kirikabuvirus, Phikmvvirus, Stubburvirus, Tunggulvirus
    Podčeleď: Melnykvirinae (8 rodů)
    Rod: Aerosvirus, Aghbyvirus, Ahphunavirus, Cronosvirus, Panjvirus, Pienvirus, Pokrovskaiavirus, Wanjuvirus
    Podčeleď: Molineuxvirinae (6 rodů)
    Rod: Acadevirus, Axomammavirus, Eracentumvirus, Tuodvirus, Vectrevirus, Zindervirus
    Podčeleď: Okabevirinae (5 rodů)
    Rod: Ampunavirus, Higashivirus, Mguuvirus, Risjevirus, Sukuvirus
    Podčeleď: Slopekvirinae (4 rody)
    Rod: Bucovirus, Drulisvirus, Koutsourovirus, Novosibovirus
    Podčeleď: Studiervirinae (24 rody)
    Rod: Aarhusvirus, Apdecimavirus, Berlinvirus, Caroctavirus, Chatterjeevirus, Eapunavirus, Elunavirus, Foetvirus, Ghunavirus, Helsettvirus, Jarilovirus, Kayfunavirus, Minipunavirus, Ningirsuvirus, Pektosvirus, Phutvirus, Pifdecavirus, Pijolavirus, Przondovirus, Teetrevirus, Teseptimavirus, Troedvirus, Unyawovirus, Warsawvirus
    Čeleď: Casjensviridae (24 rody)
    Rod: Ahduovirus, Broinstvirus, Cenphatecvirus, Chivirus, Dunedinvirus, Enchivirus, Fengtaivirus, Gediminasvirus, Gwanakrovirus, Jacunavirus, Kokobelvirus, Lavrentievavirus, Maxdohrnvirus, Nazgulvirus, Newforgelanevirus, Phobosvirus, Redjacvirus, Salvovirus, Sanovirus, Seodaemunguvirus, Sessunavirus, Sharonstreetvirus, Yonseivirus, Zhonglingvirus
    Čeleď: Chaseviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Cleopatravirinae (7 rodů)
    Rod: Carltongylesvirus, Faunusvirus, Fifivirus, Loessnervirus, Myducvirus, Sabourvirus, Suwonvirus
    Podčeleď: Nefertitivirinae (6 rodů)
    Rod: Liaoningvirus, Longwangvirus, Pahsextavirus, Phayathaivirus, Shantouvirus, Yushanvirus
    Čeleď: Chimalliviridae(1 podčeleď, 17 nezařazených rodů)
    Rod: Agricanvirus, Chiangmaivirus, Derbicusvirus, Elvirus, Erskinevirus, Goslarvirus, Iapetusvirus, Machinavirus, Moabitevirus, Noxifervirus, Petsuvirus, Phikzvirus, Ripduovirus, Risingsunvirus, Seoulvirus, Takahashivirus, Wellingtonvirus
    Podčeleď: Gorgonvirinae (2 rody)
    Rod: Aphroditevirus, Tidunavirus
    Čeleď: Clermontviridae (1 rod)
    Rod: Ventrumvirus
    Čeleď: Demerecviridae (3 podčeledi, 6 nezařazených rodů)
    Rod: Keyvirus, Novosibvirus, Pogseptimavirus, Priunavirus, Shenzhenvirus, Sugarlandvirus
    Podčeleď: Ermolyevavirinae (4 rody)
    Rod: Cetovirus, Jesfedecavirus, Thalassavirus, Vipunavirus
    Podčeleď: Markadamsvirinae (2 rody)
    Rod: Epseptimavirus, Tequintavirus
    Podčeleď: Mccorquodalevirinae (2 rody)
    Rod: Hongcheonvirus, Myunavirus
    Čeleď: Drexlerviridae (4 podčeledi, 8 nezařazených rodů)
    Rod: Eclunavirus, Hicfunavirus, Jhansiroadvirus, Kyungwonvirus, Nouzillyvirus, Sauletekiovirus, Vilniusvirus, Webervirus
    Podčeleď: Braunvirinae (8 rodů)
    Rod: Augustepiccardvirus, Christensenvirus, Guelphvirus, Inhoffenstrassevirus, Julespiccardvirus, Loudonvirus, Rtpvirus, Veterinaerplatzvirus
    Podčeleď: Rogunavirinae (5 rodů)
    Rod: Eastlansingvirus, Lindendrivevirus, Rogunavirus, Sadiyavirus, Wilsonroadvirus
    Podčeleď: Tempevirinae (9 rodů)
    Rod: Baihuvirus, Changchunvirus, Hanrivervirus, Henuseptimavirus, Jahatvirus, Peekayseptimavirus, Pocisvirus, Tlsvirus, Warwickvirus
    Podčeleď: Tunavirinae (3 rody)
    Rod: Badaguanvirus, Sertoctavirus, Tunavirus
    Čeleď: Duneviridae (3 rody)
    Rod: Ingelinevirus, Labanvirus, Unahavirus
    Čeleď: Fervensviridae (1 rod)
    Rod: Deepoceanvirus
    Čeleď: Forsetiviridae (1 rod)
    Rod: Freyavirus
    Čeleď: Fredfastierviridae (1 rod)
    Rod: Jamesmcgillvirus
    Čeleď: Grimontviridae (5 rodů)
    Rod: Crifsvirus, Dalianvirus, Libingvirus, Moazamivirus, Privateervirus
    Čeleď: Guelinviridae (1 podčeleď, 3 nezařazené rody)
    Rod: Brucesealvirus, Hzauvirus, Susfortunavirus
    Podčeleď: Denniswatsonvirinae (2 rody)
    Rod: Capvunavirus, Gregsiragusavirus
    Čeleď: Helgolandviridae (1 rod)
    Rod: Leefvirus
    Čeleď: Herelleviridae (5 podčeledí, 8 nezařazených rodů)
    Rod: Elpedvirus, Harbinvirus, Hopescreekvirus, Klumppvirus, Mooreparkvirus, Salchichonvirus, Tybeckvirus, Watanabevirus
    Podčeleď: Bastillevirinae (15 rodů)
    Rod: Agatevirus, Bastillevirus, Bequatrovirus, Caeruleovirus, Eldridgevirus, Goettingenvirus, Grisebachstrassevirus, Jeonjuvirus, Matervirus, Moonbeamvirus, Nitunavirus, Shalavirus, Siophivirus, Tsarbombavirus, Wphvirus
    Podčeleď: Brockvirinae (2 rody)
    Rod: Kochikohdavirus, Schiekvirus
    Podčeleď: Jasinskavirinae (1 rod)
    Rod: Pecentumvirus
    Podčeleď: Spounavirinae (2 rody)
    Rod: Okubovirus, Siminovitchvirus
    Podčeleď: Twortvirinae (6 rodů)
    Rod: Baoshanvirus, Kayvirus, Sciuriunavirus, Sepunavirus, Silviavirus, Twortvirus
    Čeleď: Kleczkowskaviridae (1 rod)
    Rod: Cuauhnahuacvirus
    Čeleď: Kyanoviridae (54 rody)
    Rod: Acionnavirus, Ahtivirus, Alisovirus, Anaposvirus, Atlauavirus, Bellamyvirus, Bristolvirus, Brizovirus, Chalconvirus, Charybdisvirus, Cymopoleiavirus, Emcearvirus, Galenevirus, Gibbetvirus, Glaucusvirus, Greenvirus, Haifavirus, Huanghaivirus, Kanaloavirus, Leucotheavirus, Libanvirus, Lipsvirus, Lowelvirus, Macariavirus, Makaravirus, Makelovirus, Mazuvirus, Namakavirus, Neptunevirus, Nereusvirus, Neritesvirus, Nerrivikvirus, Nilusvirus, Nodensvirus, Ormenosvirus, Palaemonvirus, Pontusvirus, Potamoivirus, Ronodorvirus, Salacisavirus, Scyllavirus, Sedonavirus, Serangoonvirus, Shandvirus, Shenzhenivirus, Sokavirus, Tamkungvirus, Tefnutvirus, Thaumasvirus, Thetisvirus, Vellamovirus, Yellowseavirus, Yushanluvirus, Zhoulongquanvirus
    Čeleď: Lutetiaviridae (1 rod)
    Rod: Classicovirus
    Čeleď: Madisaviridae (1 rod)
    Rod: Clampvirus
    Čeleď: Madridviridae (1 rod)
    Rod: Cepunavirus
    Čeleď: Mesyanzhinovviridae (2 podčeledi, 1 nezařazený rod)
    Rod: Keylargovirus
    Podčeleď: Bradleyvirinae (11 rodů)
    Rod: Abidjanvirus, Bosavirus, Cinvestavvirus, Docaquintavirus, Donnerlittchenvirus, Elanorvirus, Epaquintavirus, Ghuizhouvirus, Mallosvirus, Pamexvirus, Xooduovirus
    Podčeleď: Rabinowitzvirinae (2 rody)
    Rod: Vojvodinavirus, Yuavirus
    Čeleď: Molycolviridae (1 rod)
    Rod: Mollyvirus
    Čeleď: Naomviridae (1 rod)
    Rod: Noahvirus
    Čeleď: Orlajensenviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Pelczarvirinae (3 rody)
    Rod: Bonaevitaevirus, Efekovirus, Paopuvirus
    Čeleď: Pachyviridae (3 rody)
    Rod: Bacelvirus, Baltivirus, Gundelvirus
    Čeleď: Peduoviridae (58 rodů)
    Rod: Aptresvirus, Aresaunavirus, Arsenicumvirus, Arsyunavirus, Baylorvirus, Bielevirus, Bracchivirus, Canoevirus, Catalunyavirus, Citexvirus, Dagavirus, Duodecimduovirus, Duonihilunusvirus, Eganvirus, Elveevirus, Entnonagintavirus, Evevirus, Felsduovirus, Finvirus, Firavirus, Gegavirus, Gegevirus, Gemsvirus, Graikaemvirus, Hpunavirus, Inibicvirus, Irrigatiovirus, Irtavirus, Kapieceevirus, Kayeltresvirus, Kisquattuordecimvirus, Kisquinquevirus, Longwoodvirus, Maltschvirus, Mersinvirus, Nampongvirus, Novemvirus, Peduovirus, Phitrevirus, Piscesmortuivirus, Playavirus, Plazymidvirus, Quadragintavirus, Reginaelenavirus, Reipivirus, Sanguivirus, Senquatrovirus, Seongnamvirus, Simpcentumvirus, Tigrvirus, Tresduoquattuorvirus, Valbvirus, Vimunumvirus, Vulnificusvirus, Wadgaonvirus, Xuanwuvirus, Yongunavirus, Yulgyerivirus
    Čeleď: Pervagoviridae (1 rod)
    Rod: Callevirus
    Čeleď: Pootjesviridae (1 podčeleď, 4 nezařazené rody)
    Rod: Emnonavirus, Heverleevirus, Innesvirus, Rollinsvirus
    Podčeleď: Staniewskivirinae (1 rod)
    Rod: Trinifflemingvirus
    Čeleď: Pungoviridae (1 rod)
    Rod: Flagovirus
    Čeleď: Rountreeviridae (2 podčeledi, 2 nezařazené rody)
    Rod: Fischettivirus, Negarvirus
    Podčeleď: Rakietenvirinae (2 rody)
    Rod: Andhravirus, Rosenblumvirus
    Podčeleď: Sarlesvirinae (2 rody)
    Rod: Copernicusvirus, Minhovirus
    Čeleď: Saffermanviridae (5 rodů)
    Rod: Arthrovirus, Kozyakovvirus, Morrisvirus, Wumpquatrovirus, Wumptrevirus
    Čeleď: Salasmaviridae (3 podčeledi, 4 nezařazené rody)
    Rod: Bundooravirus, Harambevirus, Huangshavirus, Mingyongvirus
    Podčeleď: Northropvirinae (4 rody)
    Rod: Claudivirus, Hemphillvirus, Klosterneuburgvirus, Layangcvirus
    Podčeleď: Picovirinae (3 rody)
    Rod: Bahkauvirus, Beecentumtrevirus, Salasvirus
    Podčeleď: Tatarstanvirinae (2 rody)
    Rod: Gaunavirus, Karezivirus
    Čeleď: Saparoviridae (2 rody)
    Rod: Halohivirus, Samsavirus
    Čeleď: Schitoviridae (9 podčeledí, 27 nezařazených rodů)
    Rod: Cavevirus, Cbunavirus, Dendoorenvirus, Eceepunavirus, Efbeekayvirus, Electravirus, Exceevirus, Huelvavirus, Littlefixvirus, Mukerjeevirus, Oliverunavirus, Pacinivirus, Pariacacavirus, Penintadodekavirus, Petruschkyvirus, Philippevirus, Pokkenvirus, Presleyvirus, Riverridervirus, Shizishanvirus, Triduovirus, Varunavirus, Vicoquintavirus, Waedenswilvirus, Xoxocotlavirus, Zicotriavirus, Zurivirus
    Podčeleď: Demetervirinae (2 rody)
    Rod: Acanvirus, Cyamitesvirus
    Podčeleď: Enquatrovirinae (4 rody)
    Rod: Enquatrovirus, Gamaleyavirus, Kaypoctavirus, Moovirus
    Podčeleď: Erskinevirinae (2 rody)
    Rod: Johnsonvirus, Yonginvirus
    Podčeleď: Fuhrmanvirinae (2 rody)
    Rod: Matsuvirus, Stoningtonvirus
    Podčeleď: Humphriesvirinae (3 rody)
    Rod: Ithacavirus, Pollockvirus, Pylasvirus
    Podčeleď: Migulavirinae (2 rody)
    Rod: Litunavirus, Luzseptimavirus
    Podčeleď: Pontosvirinae (3 rody)
    Rod: Dorisvirus, Galateavirus, Nahantvirus
    Podčeleď: Rhodovirinae (8 rodů)
    Rod: Aoqinvirus, Aorunvirus, Baltimorevirus, Gonggongvirus, Plymouthvirus, Pomeroyivirus, Raunefjordenvirus, Sanyabayvirus
    Podčeleď: Rothmandenesvirinae (4 rody)
    Rod: Dongdastvirus, Inbricusvirus, Jwalphavirus, Pourcelvirus
    Čeleď: Speroviridae (1 rod)
    Rod: Glazvirus
    Čeleď: Stanwilliamsviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Boydwoodruffvirinae (4 rody)
    Rod: Coruscantvirus, Karimacvirus, Samistivirus, Tomasvirus
    Podčeleď: Loccivirinae (5 rodů)
    Rod: : Annadreamyvirus, Faustvirus, Gilsonvirus, Wakandavirus, Wilnyevirus
    Čeleď: Straboviridae (3 podčeledi, 15 nezařazených rodů)
    Rod: Angelvirus, Biquartavirus, Bragavirus, Carettavirus, Chrysonvirus, Cinqassovirus, Gualtarvirus, Jiangsuvirus, Krischvirus, Mylasvirus, Nanhuvirus, Pseudotevenvirus, Schizotequatrovirus, Slopekvirus, Tulanevirus
    Podčeleď: Emmerichvirinae (2 rody)
    Rod: Ceceduovirus, Ishigurovirus
    Podčeleď: Tevenvirinae (14 rodů)
    Rod: Dhakavirus, Gaprivervirus, Gelderlandvirus, Jiaodavirus, Kagamiyamavirus, Kanagawavirus, Karamvirus, Moonvirus, Mosigvirus, Mosugukvirus, Roskildevirus, Tegunavirus, Tequatrovirus, Winklervirus
    Podčeleď: Twarogvirinae (5 rodů)
    Rod: Acajnonavirus, Hadassahvirus, Lasallevirus, Lazarusvirus, Zedzedvirus
    Čeleď: Suolaviridae (1 rod)
    Rod: Pormufvirus
    Čeleď: Toyamaviridae (3 rody)
    Rod: Totsukavirus, Ushigomevirus, Wadatovirus
    Čeleď: Umezonoviridae (2 rody)
    Rod: Moriyavirus, Namikivirus
    Čeleď: Verdandiviridae^[25] (2 rody)
    Rod: Dolusvirus, Tonitrusvirus
    Čeleď: Vertoviridae (2 rody)
    Rod: Chaovirus, Myohalovirus
    Čeleď: Vilmaviridae (2 podčeledi, 2 nezařazené rody)
    Rod: Kumaovirus, Wildcatvirus
    Podčeleď: Lclasvirinae (4 rody)
    Rod: Bromdenvirus, Bronvirus, Faithunavirus, Lumosvirus
    Podčeleď: Mclasvirinae (2 rody)
    Rod: Bongovirus, Reyvirus
    Čeleď: Winoviridae (2 rody)
    Rod: Peternellavirus, Pippivirus
    Čeleď: Zierdtviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Emilbogenvirinae (7 rodů)
    Rod: Commandariavirus, Foxborovirus, Gruunavirus, Kablunavirus, Pleakleyvirus, Skysandvirus, Sukkupivirus
    Podčeleď: Toshachvirinae (2 rody)
    Rod: Ceetrepovirus, Chunghsingvirus
    Čeleď: Zobellviridae (1 podčeleď, 6 nezařazených rodů)
    Rod: Citrovirus, Icepovirus, Melvirus, Paundecimvirus, Salinovirus, Vipivirus
    Podčeleď: Cobavirinae (2 rody)
    Rod: Siovirus, Veravirus
    Řád: Crassvirales (4 čeledi)
    Čeleď: Crevaviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Coarsevirinae (1 rod)
    Rod: Junduvirus
    Podčeleď: Doltivirinae (2 rody)
    Rod: Kahucivirus, Kingevirus
    Čeleď: Intestiviridae (3 podčeledi, 1 nezařazený rod)
    Rod: Rudgehvirus
    Podčeleď: Churivirinae (1 rod)
    Rod: Jahgtovirus
    Podčeleď: Crudevirinae (7 rodů)
    Rod: Carjivirus, Dabirmavirus, Delmidovirus, Diorhovirus, Drivevirus, Endlipuvirus, Whopevirus
    Podčeleď: Obtuvirinae (3 rody)
    Rod: Fohxhuevirus, Hacihdavirus, Wotdevirus
    Čeleď: Steigviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Asinivirinae (12 rodů)
    Rod: Akihdevirus, Kahnovirus, Kehishuvirus, Kolpuevirus, Lahndsivirus, Lebriduvirus, Mahlunavirus, Mahstovirus, Pamirivirus, Paundivirus, Pipoluvirus, Wulfhauvirus
    Čeleď: Suoliviridae (5 podčeledí, 1 nezařazený rod)
    Rod: Dechshavirus
    Podčeleď: Bearivirinae (1 rod)
    Rod: Afonbuvirus
    Podčeleď: Boorivirinae (3 rody)
    Rod: Canhaevirus, Cohcovirus, Culoivirus
    Podčeleď: Loutivirinae (3 rody)
    Rod: Blohavirus, Buchavirus, Buorbuivirus
    Podčeleď: Oafivirinae (5 rodů)
    Rod: Bohxovirus, Buhlduvirus, Burzaovirus, Cacepaovirus, Chuhaivirus
    Podčeleď: Uncouvirinae (3 rody)
    Rod: Aurodevirus, Besingivirus, Birpovirus
    Řád: Juravirales (2 čeledi)
    Čeleď: Yangangviridae (3 rody)
    Rod: Mathaucavirus, Nohelivirus, Senitvirus
    Čeleď: Yanlukaviridae (1 rod)
    Rod: Sweetvirus
    Řád: Kirjokansivirales (4 čeledi)
    Čeleď: Graaviviridae (2 rody)
    Rod: Beejeyvirus, Seejivirus
    Čeleď: Haloferuviridae (3 rody)
    Rod: Dpdavirus, Retbasiphovirus, Saldibavirus
    Čeleď: Pyrstoviridae (1 rod)
    Rod: Hatrivirus
    Čeleď: Shortaselviridae (1 rod)
    Rod: Lonfivirus
    Řád: Magrovirales (1 čeleď)
    Čeleď: Aoguangviridae (1 rod)
    Rod: Aobingvirus
    Řád: Methanobavirales (5 čeledí)
    Čeleď: Anaerodiviridae (1 rod)
    Rod: Metforvirus
    Čeleď: Armatusviridae (1 rod)
    Rod: Ariesvirus
    Čeleď: Kairosviridae (1 rod)
    Rod: Nadirvirus
    Čeleď: Leisingerviridae (1 rod)
    Rod: Psimunavirus
    Čeleď: Pigerviridae (1 rod)
    Rod: Somnumvirus
    Řád: Nakonvirales (2 čeledi)
    Čeleď: Ahpuchviridae (1 rod)
    Rod: Kisinvirus
    Čeleď: Ekchuahviridae (1 rod)
    Rod: Kukulkanvirus
    Řád: Thumleimavirales (4 čeledi)
    Čeleď: Druskaviridae (2 rody)
    Rod: Hacavirus, Tredecimvirus
    Čeleď: Hafunaviridae (4 rody)
    Rod: Haloferacalesvirus, Laminvirus, Mincapvirus, Minorvirus
    Čeleď: Halomagnusviridae (1 rod)
    Rod: Hagravirus
    Čeleď: Soleiviridae (1 rod)
    Rod: Eilatmyovirus

Monodnaviria

Realm: Monodnaviria (4 říše)

Říše: Loebvirae (1 kmen)
- Kmen: Hofneiviricota (1 třída)
  - Třída: Faserviricetes (1 řád)
    Řád: Tubulavirales (3 čeledi)
    Čeleď: Inoviridae (26 rodů)
    Rod: Affertcholeramvirus, Anademivirus, Capistrivirus, Coriovirus, Fibrovirus, Habenivirus, Infulavirus, Inovirus, Lineavirus, Lophivirus, Parhipatevirus, Porrectionivirus, Primolicivirus, Psecadovirus, Restivirus, Saetivirus, Scuticavirus, Siphunculivirus, Staminivirus, Subteminivirus, Tertilicivirus, Vasivirus, Versovirus, Vicialiavirus, Villovirus, Xylivirus
    Čeleď: Paulinoviridae (2 rody)
    Rod: Bifilivirus, Thomixvirus
    Čeleď: Plectroviridae (4 rody)
    Rod: Plectrovirus, Suturavirus, Vespertiliovirus, Virgulavirus
Říše: Sangervirae (1 kmen)
- Kmen: Phixviricota (1 třída)
  - Třída: Malgrandaviricetes (1 řád)
    Řád: Petitvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Microviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Bullavirinae (3 rody)
    Rod: Alphatrevirus, Gequatrovirus, Sinsheimervirus
    Podčeleď: Gokushovirinae (4 rody)
    Rod: Bdellomicrovirus, Chlamydiamicrovirus, Enterogokushovirus, Spiromicrovirus
Říše: Shotokuvirae (2 kmeny)
- Kmen: Cossaviricota (3 třídy)
  - Třída: Mouviricetes (1 řád)
    Řád: Polivirales (1 čeleď)
    Čeleď: Bidnaviridae (1 rod)
    Rod: Bidensovirus
  - Třída: Papovaviricetes (2 řády)
    Řád: Sepolyvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Polyomaviridae (8 rodů)
    Rod: Alphapolyomavirus, Betapolyomavirus, Deltapolyomavirus, Epsilonpolyomavirus, Etapolyomavirus, Gammapolyomavirus, Thetapolyomavirus, Zetapolyomavirus
    Řád: Zurhausenvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Papillomaviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Firstpapillomavirinae (52 rody)
    Rod: Alphapapillomavirus, Betapapillomavirus, Chipapillomavirus, Deltapapillomavirus, Dyochipapillomavirus, Dyodeltapapillomavirus, Dyoepsilonpapillomavirus, Dyoetapapillomavirus, Dyoiotapapillomavirus, Dyokappapapillomavirus, Dyolambdapapillomavirus, Dyomupapillomavirus, Dyonupapillomavirus, Dyoomegapapillomavirus, Dyoomikronpapillomavirus, Dyophipapillomavirus, Dyopipapillomavirus, Dyopsipapillomavirus, Dyorhopapillomavirus, Dyosigmapapillomavirus, Dyotaupapillomavirus, Dyothetapapillomavirus, Dyoupsilonpapillomavirus, Dyoxipapillomavirus, Dyozetapapillomavirus, Epsilonpapillomavirus, Etapapillomavirus, Gammapapillomavirus, Iotapapillomavirus, Kappapapillomavirus, Lambdapapillomavirus, Mupapillomavirus, Nupapillomavirus, Omegapapillomavirus, Omikronpapillomavirus, Phipapillomavirus, Pipapillomavirus, Psipapillomavirus, Rhopapillomavirus, Sigmapapillomavirus, Taupapillomavirus, Thetapapillomavirus, Treisdeltapapillomavirus, Treisepsilonpapillomavirus, Treisetapapillomavirus, Treisiotapapillomavirus, Treiskappapapillomavirus, Treisthetapapillomavirus, Treiszetapapillomavirus, Upsilonpapillomavirus, Xipapillomavirus, Zetapapillomavirus
    Podčeleď: Secondpapillomavirinae (1 rod)
    Rod: Alefpapillomavirus
  - Třída: Quintoviricetes (1 řád)
    Řád: Piccovirales (1 čeleď)
    Čeleď: Parvoviridae (3 podčeledi, 1 nezařazený rod )
    Rod: Metalloincertoparvovirus
    Podčeleď: Densovirinae (11 rodů)
    Rod: Aquambidensovirus, Blattambidensovirus, Diciambidensovirus, Hemiambidensovirus, Iteradensovirus, Miniambidensovirus, Muscodensovirus, Pefuambidensovirus, Protoambidensovirus, Scindoambidensovirus, Tetuambidensovirus
    Podčeleď: Hamaparvovirinae (5 rodů)
    Rod: Brevihamaparvovirus, Chaphamaparvovirus, Hepanhamaparvovirus, Ichtchaphamaparvovirus, Penstylhamaparvovirus
    Podčeleď: Parvovirinae (11 rodů)
    Rod: Amdoparvovirus, Artiparvovirus, Aveparvovirus, Bocaparvovirus, Copiparvovirus, Dependoparvovirus, Erythroparvovirus, Loriparvovirus, Protoparvovirus, Sandeparvovirus, Tetraparvovirus
- Kmen: Cressdnaviricota (2 třídy)
  - Třída: Arfiviricetes (11 řádů)
    Řád: Baphyvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Bacilladnaviridae (7 rodů)
    Rod: Aberdnavirus, Diatodnavirus, Keisodnavirus, Kieseladnavirus, Protobacilladnavirus, Puahadnavirus, Seawadnavirus
    Řád: Cirlivirales (3 čeledi)
    Čeleď: Circoviridae (2 rody)
    Rod: Circovirus, Cyclovirus
    Čeleď: Endolinaviridae (4 rody)
    Rod: Bovdisavirus, Camdisavirus, Chidisavirus, Hudisavirus
    Čeleď: Vilyaviridae (15 rodů)
    Rod: Ancalagonvirus, Andurilvirus, Angristvirus, Aranruthvirus, Arnorvirus, Berenvirus, Glamdringvirus, Grondvirus, Herugrimvirus, Illuinvirus, Ormalvirus, Palantirivirus, Ringilvirus, Ulaervirus, Vingilotevirus
    Řád: Cremevirales (1 čeleď)
    Čeleď: Smacoviridae (12 rodů)
    Rod: Babosmacovirus, Bonzesmacovirus, Bostasmacovirus, Bovismacovirus, Cosmacovirus, Dragsmacovirus, Drosmacovirus, Felismacovirus, Huchismacovirus, Inpeasmacovirus, Porprismacovirus, Simismacovirus
    Řád: Gredzevirales (2 čeledi)
    Čeleď: Gandrviridae (8 rodů)
    Rod: Atripovirus, Meliavirus, Oreadivirus, Oreiadivirus, Satyrivirus, Sthenivirus, Thisbivirus, Thyiavirua
    Čeleď: Ouroboviridae (30 rodů)
    Rod: Aretevirus, Boebeisivirus, Demetevirus, Doliovirus, Dorisivirus, Eurynomevirus, Gorgovirus, Heravirus, Horusivirus, Ioniavirus, Kadmovirus, Kreonivirus, Lamposivirus, Mantiovirus, Naiadivirus, Otosivirus, Patroklovirus, Perimedevirus, Peronelivirus, Persevirus, Proteusivirus, Pylenevirus, Pythorivirus, Rhipevirus, Stentovirus, Styxivirus, Tantalovirus, Taphiavirus, Telemovirus, Tethyvirus
    Řád: Jormunvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Draupnirviridae (42 rodů)
    Rod: Armipotenivirus, Asperivirus, Atroxivirus, Audacivirus, Audaxivirus, Bellicusivirus, Belligerivirus, Citaivirus, Citataivirus, Citiorivirus, Durusivirus, Ferullusivirus, Fervidivirus, Funestivirus, Incitativirus, Incitatusivirus, Malificivirus, Mordaxivirus, Nervillivirus, Nocentianivirus, Periculosovirus, Pollentivirus, Potensivirus, Properatisvirus, Rapidusivirus, Robaratusivirus, Roburiusivirus, Strenuaivirus, Strenuusivirus, Tetricillivirus, Torentivirus, Valentivirus, Validivirus, Vegetinivirus, Vegetivirus, Vehemenivirus, Velocianivirus, Veloxivirus, Violenivirus, Viratusivirus, Virilianivirus, Volantivirus
    Řád: Mulpavirales (4 čeledi)
    Čeleď: Amesuviridae (2 rody)
    Rod: Temfrudevirus, Yermavirus
    Čeleď: Anicreviridae (9 rodů)
    Rod: Baranavirus, Ketkevirus, Kopavirus, Manawavirus, Otevirus, Patavirus, Pekavirus, Rakkovirus, Uewvirus
    Čeleď: Metaxyviridae (1 rod)
    Rod: Cofodevirus^{[pozn. 8]}
    Čeleď: Nanoviridae (2 rody)
    Rod: Babuvirus, Nanovirus
    Řád: Recrevirales (1 čeleď)
    Čeleď: Redondoviridae (1 rod)
    Rod: Torbevirus
    Řád: Ringavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Pecoviridae (8 rodů)
    Rod: Amaruvirus, Capamivirus, Cinchivirus, Intivirus, Macochavirus, Quillavirus, Tambotovirus, Yaviravirus
    Řád: Rivendellvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Naryaviridae (11 rodů)
    Rod: Arkenivirus, Beornivirus, Mallornivirus, Menegrothvirus, Mirkivirus, Nauglamirvirus, Nimphelosvirus, Phialvirus, Sindarvirus, Thengelvirus, Tirithivirus
    Řád: Rohanvirales (3 čeledi)
    Čeleď: Adamaviridae (18 rodů)
    Rod: Andorivirus, Caradhivirus, Celebovirus, Dolmedivirus, Enedivirus, Harfovirus, Moriavirus, Nimlovirus, Nurnevirus, Pelorivirus, Stoorivirus, Taravirus, Telperivirus, Tharbavirus, Ulwavirus, Valarivirus, Vanyarvirus, Zirakzivirus
    Čeleď: Kirkoviridae (10 rodů)
    Rod: Aglavirus, Denevirus, Edravirus, Halavirus, Irmovirus, Luinilvirus, Melianvirus, Nessavirus, Ossirvirus, Yavannavirus
    Čeleď: Nenyaviridae (6 rodů)
    Rod: Angainorvirus, Cirilivirus, Galvornvirus, Mazarbulvirus, Mithrilvirus, Valinorvirus
    Řád: Saturnivirales (2 čeledi)
    Čeleď: Kanorauviridae (24 rodů)
    Rod: Chinseivirus, Chiunvirus, Doseivirus, Kaiwanvirus, Kajamanuvirus, Kronovirus, Ninurtavirus, Phainonvirus, Raagevirus, Sadornvirus, Sagusvirus, Sakkuthvirus, Sanchirviurs, Sanivirus, Saothovirus, Savurvirus, Scythevirus, Seetinvirus, Shabtayvirus, Shanivirus, Sickelvirus, Tuxingvirus, Zohali, Zuhalvirus
    Čeleď: Mahapunaviridae (11 rodů)
    Rod: Acamarivirus, Amalthevirus, Anthevirus, Cursavirus, Elnathivirus, Enifivirus, Fuluvirus, Garivirus, Himalivirus, Janusivirus, Thebevirus
  - Třída: Repensiviricetes (1 řád)
    Řád: Geplafuvirales (3 čeledi)
    Čeleď: Geminiviridae (15 rodů, 1 neuznaný rod)
    Rod: Becurtovirus, Begomovirus, Capulavirus, Citlodavirus, Curtovirus, Eragrovirus, Grablovirus, Graingemvirus^[27] (neuznaný), Maldovirus, Mastrevirus, Mulcrilevirus, Opunvirus, Topilevirus, Topocuvirus, Turncurtovirus, Welwivirus
    Čeleď: Genomoviridae (10 rodů)
    Rod: Gemycircularvirus, Gemyduguivirus, Gemygorvirus, Gemykibivirus, Gemykolovirus, Gemykrogvirus, Gemykroznavirus, Gemytondvirus, Gemytripvirus, Gemyvongvirus
    Čeleď: Geplanaviridae (18 rodů)
    Rod: Acciovirus, Aguamentivirus, Alohovirus, Aparevirus, Avadavirus, Densaugvirus, Diffindovirus, Engorgivirus, Episkevirus, Expellivirus, Impedivirus, Lumovirus, Oblivivirus, Patrovirus, Protegovirus, Riddikuvirus, Stupevirus, Wingardivirus
Říše: Trapavirae (1 kmen)
- Kmen: Saleviricota (1 třída)
  - Třída: Huolimaviricetes (1 řád)
    Řád: Haloruvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Pleolipoviridae (3 rody)
    Rod: Alphapleolipovirus, Betapleolipovirus, Gammapleolipovirus

Riboviria

Realm: Riboviria (2 říše, 2 nezařazené čeledi, 4 nezařazené rody)^{[pozn. 9]}

Rod: Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus

Čeleď: Polymycoviridae (1 rod)
- Rod: Polymycovirus
Čeleď: Sarthroviridae (1 rod)
- Rod: Macronovirus

Říše: Orthornavirae (6 kmenů, 4 neuznané kmeny^[29]^[30]^[31], 2 nezařazené čeledi)
Čeleď: Birnaviridae (7 rodů)
Rod: Aquabirnavirus, Avibirnavirus, Blosnavirus, Dronavirus, Entomobirnavirus, Ronavirus, Telnavirus
Čeleď: Permutotetraviridae (1 rod)
Rod: Alphapermutotetravirus
- Kmen (neuznaný): Arctiviricota^[29]^[32]^[33]^{[pozn. 10]}
- Kmen: Ambiviricota (1 třída)
  - Třída: Suforviricetes (1 řád)
    Řád: Crytulvirales (4 čeledi)
    Čeleď: Dumbiviridae (1 rod)
    Rod: Orthodumbivirus
    Čeleď: Quambiviridae (1 rod)
    Rod: Orthoquambivirus
    Čeleď: Trimbiviridae (1 rod)
    Rod: Orthotrimbivirus
    Čeleď: Unambiviridae (1 rod)
    Rod: Orthounambivirus
- Kmen (neuznaný): Artimaviricota^[30]^[34]^{[pozn. 11]}
- Kmen: Duplornaviricota (3 třídy)
  - Třída: Chrymotiviricetes (1 řád)
    Řád: Ghabrivirales (3 podřády)
    Podřád: Alphatotivirineae (10 čeledí)
    Čeleď: Botybirnaviridae (1 rod)
    Rod: Botybirnavirus
    Čeleď: Chrysoviridae (2 rody)
    Rod: Alphachrysovirus, Betachrysovirus
    Čeleď: Fusagraviridae (1 rod)
    Rod: Fusagravirus
    Čeleď: Megabirnaviridae (1 rod)
    Rod: Megabirnavirus
    Čeleď: Monocitiviridae (1 rod)
    Rod: Monocitivirus
    Čeleď: Orthototiviridae (1 rod)
    Rod: Totivirus
    Čeleď: Phlegiviridae (1 rod)
    Rod: Phlegivirus
    Čeleď: Pseudototiviridae (4 rody)
    Rod: Eimeriavirus, Leishmaniavirus, Trichomonasvirus, Victorivirus
    Čeleď: Quadriviridae (1 rod)
    Rod: Quadrivirus
    Čeleď: Spiciviridae (1 rod)
    Rod: Spicivirus
    Podřád: Betatotivirineae (8 čeledí)
    Čeleď: Artiviridae (1 rod)
    Rod: Artivirus
    Čeleď: Giardiaviridae (1 rod)
    Rod: Giardiavirus
    Čeleď: Inseviridae (1 rod)
    Rod: Insevirus
    Čeleď: Lebotiviridae (1 rod)
    Rod: Lebotivirus
    Čeleď: Megatotiviridae (1 rod)
    Rod: Megatotivirus
    Čeleď: Ootiviridae (1 rod)
    Rod: Ootivirus
    Čeleď: Pistolviridae (1 rod)
    Rod: Pistolvirus
    Čeleď: Yadonushiviridae (1 rod)
    Rod: Yadonushivirus
    Podřád: Gammatotivirineae (1 čeleď)
    Čeleď: Alternaviridae (1 rod)
    Rod: Alternavirus
  - Třída: Resentoviricetes (1 řád)
    Řád: Reovirales (2 čeledi)
    Čeleď: Sedoreoviridae (6 rodů)
    Rod: Cardoreovirus, Mimoreovirus, Orbivirus, Phytoreovirus, Rotavirus, Seadornavirus
    Čeleď: Spinareoviridae (9 rodů)
    Rod: Aquareovirus, Coltivirus, Cypovirus, Dinovernavirus, Fijivirus, Idnoreovirus, Mycoreovirus, Orthoreovirus, Oryzavirus
  - Třída: Vidaverviricetes (1 řád)
    Řád: Mindivirales (1 čeleď)
    Čeleď: Cystoviridae (1 rod)
    Rod: Cystovirus
- Kmen: Kitrinoviricota (4 třídy)
  - Třída: Alsuviricetes (3 řády)
    Řád: Hepelivirales (4 čeledi)
    Čeleď: Alphatetraviridae (2 rody)
    Rod: Betatetravirus, Omegatetravirus
    Čeleď: Benyviridae (1 rod)
    Rod: Benyvirus
    Čeleď: Hepeviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Orthohepevirinae (4 rody)
    Rod: Avihepevirus, Chirohepevirus, Paslahepevirus, Rocahepevirus
    Podčeleď: Parahepevirinae (1 rod)
    Rod: Piscihepevirus
    Čeleď: Matonaviridae (1 rod)
    Rod: Rubivirus
    Řád: Martellivirales (7 čeledí)
    Čeleď: Bromoviridae (6 rodů)
    Rod: Alfamovirus, Anulavirus, Bromovirus, Cucumovirus, Ilarvirus, Oleavirus
    Čeleď: Closteroviridae (7 rodů)
    Rod: Ampelovirus, Bluvavirus, Closterovirus, Crinivirus, Menthavirus, Olivavirus, Velarivirus
    Čeleď: Endornaviridae (2 rody)
    Rod: Alphaendornavirus, Betaendornavirus
    Čeleď: Kitaviridae (3 rody)
    Rod: Blunervirus, Cilevirus, Higrevirus
    Čeleď: Mayoviridae (2 rody)
    Rod: Idaeovirus, Pteridovirus
    Čeleď: Togaviridae (1 rod)
    Rod: Alphavirus
    Čeleď: Virgaviridae (7 rodů)
    Rod: Furovirus, Goravirus, Hordeivirus, Pecluvirus, Pomovirus, Tobamovirus, Tobravirus
    Řád: Tymovirales (5 čeledí)
    Čeleď: Alphaflexiviridae (6 rodů)
    Rod: Allexivirus, Botrexvirus, Lolavirus, Platypuvirus, Potexvirus, Sclerodarnavirus
    Čeleď: Betaflexiviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Quinvirinae (5 rodů)
    Rod: Banmivirus, Carlavirus, Foveavirus, Robigovirus, Sustrivirus
    Podčeleď: Trivirinae (10 rodů)
    Rod: Capillovirus, Chordovirus, Citrivirus, Divavirus, Prunevirus, Ravavirus, Tepovirus, Trichovirus, Vitivirus, Wamavirus
    Čeleď: Deltaflexiviridae (1 rod)
    Rod: Deltaflexivirus
    Čeleď: Gammaflexiviridae (3 rody)
    Rod: Gammaflexivirus, Mycoflexivirus, Xylavirus
    Čeleď: Tymoviridae (3 rody)
    Rod: Maculavirus, Marafivirus, Tymovirus
  - Třída: Flasuviricetes (1 řád)
    Řád: Amarillovirales (1 čeleď)
    Čeleď: Flaviviridae (4 rody)
    Rod: Hepacivirus, Orthoflavivirus, Pegivirus, Pestivirus
  - Třída: Magsaviricetes (1 řád)
    Řád: Nodamuvirales (2 čeledi)
    Čeleď: Nodaviridae (2 rody)
    Rod: Alphanodavirus, Betanodavirus
    Čeleď: Sinhaliviridae (1 rod)
    Rod: Sinaivirus
  - Třída: Tolucaviricetes (1 řád)
    Řád: Tolivirales (2 čeledi)
    Čeleď: Carmotetraviridae (1 rod)
    Rod: Alphacarmotetravirus
    Čeleď: Tombusviridae (3 podčeledi)
    Podčeleď: Calvusvirinae (1 rod)
    Rod: Umbravirus
    Podčeleď: Procedovirinae (15 rodů)
    Rod: Alphacarmovirus, Alphanecrovirus, Aureusvirus, Avenavirus, Betacarmovirus, Betanecrovirus, Gallantivirus, Gammacarmovirus, Macanavirus, Machlomovirus, Panicovirus, Pelarspovirus, Tombusvirus, Tralespevirus, Zeavirus
    Podčeleď: Regressovirinae (2 rody)
    Rod: Dianthovirus, Luteovirus
- Kmen: Lenarviricota (4 třídy)
  - Třída: Amabiliviricetes (1 řád)
    Řád: Wolframvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Narnaviridae (1 rod)
    Rod: Narnavirus
  - Třída: Howeltoviricetes (1 řád)
    Řád: Cryppavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Mitoviridae (4 rody)
    Rod: Duamitovirus, Kvaramitovirus, Triamitovirus, Unuamitovirus
  - Třída: Leviviricetes (2 řády, 5 nezařazených rodů)
    Rod: Grandbuvirus, Mahrahovirus, Nicedsevirus, Nordovirus, Skrubnovirus
    Řád: Norzivirales (4 čeledi)
    Čeleď: Atkinsviridae (123 rodů)
    Rod: Aastrivirus, Aldormivirus, Alkesdovirus, Alvostovirus,Andhevirus, Apihcavirus, Arihsbuvirus, Ashurnovirus, Astuncavirus, Avantavirus, Bahdevirus, Bahdevuvirus, Bahguvirus, Balsavirus, Barchevirus, Bardovirus, Bartovirus, Bascudevirus, Batdovirus, Beahrlevirus, Behauvirus, Beheusavirus, Behntlevirus, Behrmuvirus, Bercswevirus, Bermivirus, Bexdevirus, Bidwuvirus, Bihdfovirus, Bihshovirus, Bilifuvirus, Bilsavirus, Birdonovirus, Birfovirus, Birstovirus, Blictovirus, Blinduvirus, Bolihivirus, Bolislovirus, Boltovirus, Bouhrtavirus, Braholevirus, Bramcovirus, Bramkuvirus, Branavirus, Brandovirus, Brehdfovirus, Broetwevirus, Bruncluvirus, Buckevirus, Budprovirus, Buhdlovirus, Buhpbivirus, Buhshwavirus, Bulcivirus, Bunlevirus, Buntovirus, Burdivirus, Burtuvirus, Bushuvirus, Cahtebovirus, Cahwstovirus, Caldevirus, Cambruovirus, Capsdovirus, Casfavirus, Chadwivirus, Chahpevirus, Chatshuvirus, Chepelevirus, Cherlevirus, Cherovirus, Chinihovirus, Chostevirus, Chounavirus, Churchovirus, Cihsnivirus, Clavivirus, Clifovirus, Clufdovirus, Cohrlevirus, Colishivirus, Comptovirus, Comptuvirus, Coughduvirus, Diydovirus, Dugnivirus, Firunevirus, Gohshovirus, Hehspivirus, Helacdivirus, Hirvovirus, Huhmpluvirus, Huleruivirus, Hysdruvirus, Ichonovirus, Ipivevirus, Isoihlovirus, Kempsvovirus, Kihrivirus, Kimihcavirus, Kudohovirus, Kuhfotivirus, Lahcomavirus, Lehptevirus, Lobdovirus, Madisduvirus, Mitdiwavirus, Moloevirus, Monekavirus, Nehujevirus, Neratovirus, Niginuvirus, Pagohnivirus, Pihngevirus, Pohlydovirus, Psoetuvirus, Qeihnovirus, Rainacovirus, Scloravirus, Sdonativirus, Sdribtuvirus, Shopitevirus, Stupavirus, Tsecebavirus, Wahbolevirus, Wecineivirus, Whodehavirus, Wulosvivirus, Yekorevirus, Yeshinuvirus
    Čeleď: Duinviridae (10 rodů)
    Rod: Apeevirus, Beshanovirus, Cartwavirus, Cubpivirus, Derlivirus, Dirlevirus, Kahshuvirus, Kohmavirus, Samuneavirus, Tehuhdavirus
    Čeleď: Fiersviridae (308 rodů)
    Rod: Amubhivirus, Andhasavirus, Andhaxevirus, Ashucavirus, Bahscuvirus, Behevivirus, Behlfluvirus, Bihdovirus, Bisdanovirus, Blafavirus, Bohnovirus, Bohwovirus, Boschuvirus, Breudwovirus, Buhdavirus, Cahdavirus, Cahrpivirus, Caloevirus, Cauhldivirus, Cehakivirus, Chaedoavirus, Chahsmivirus, Chihyovirus, Chobevirus, Choctavirus, Cintrevirus, Cunavirus, Dahmuvirus, Darnbovirus, Decadevirus, Denfovirus, Depandovirus, Dihsdivirus, Dohlivirus, Dortuvirus, Dorudgevirus, Dosmizivirus, Draycavirus, Dreytovirus, Duhcivirus, Dunchevirus, Dursuvirus, Eahsevirus, Eahvevirus, Eedhovirus, Eerlswovirus, Eistcuvirus, Emesvirus, Empivirus, Etongtovirus, Fagihyuvirus, Fenycovirus, Fihluvirus, Firnpuvirus, Fiyodovirus, Flehknovirus, Frinctavirus, Fulbrouvirus, Gahlovirus, Galoycavirus, Garovuvirus, Gehnevirus, Giydovirus, Glyciruvirus, Gmuhndevirus, Gorodievirus, Grandpovirus, Greatevirus, Greatpavirus, Grehavirus, Grendovirus,, Grendvuvirus, Gunawavirus, Haeldovirus, Hagavirus, Hahdsevirus, Hahmbtovirus, Hahsevirus, Halcalevirus, Hampdavirus, Hamptovirus, Helfovirus, Herbuvirus, Hihdivirus, Hihlwaovirus, Hirbarovirus, Hirtshivirus, Hisilivirus, Hisilovirus, Hitdovirus, Hohnivirus, Honleyivirus, Honolovirus, Hudnivirus, Huhnivirus, Huhnuvirus, Hukohnovirus, Hurlivirus, Icumivirus, Ideskevirus, Idlucavirus, Imeberivirus, Ineyimevirus, Iruqauvirus, Ishugivirus, Jiesduavirus, Johnovirus, Jupbevirus, Kahfsdivirus, Keghovirus, Kehmevirus, Kehrevirus, Kemicevirus, Kihryuvirus, Kinehtovirus, Kinolwovirus, Kirnavirus, Kiwsmaevirus, Kongskuvirus, Konkivirus, Konwavirus, Koteshevirus, Kowinovirus, Kuhshuvirus, Kungsnevirus, Kungspuvirus, Lahbwuvirus, Lahdbrovirus, Langlevirus, Leahmovirus, Lecwavirus, Lehamuvirus, Lighthovirus, Lihdtlovirus, Lihtdlivirus, Litdlevirus, Loamavirus, Loghdhuvirus, Lohmavirus, Lohngkovirus, Lohwevirus, Lohwovirus, Longmavirus, Longovirus, Loslovirus, Lowerquvirus, Lowsuvirus, Loxlovirus, Ludtlevirus, Ludtlovirus, Ludtovirus, Lunjlavirus, Luthavirus, Lyejrivirus, Mahqeavirus, Mahraivirus, Mahrtovirus, Manrohovirus, Martavirus, Martovirus, Maxstovirus, Meblowovirus, Mehraxmevirus, Mehrevirus, Mekintivirus, Merlkluvirus, Methovirus, Mihkrovirus, Mincetevirus, Mintuvirus, Mohredovirus, Molcatevirus, Molvevirus, Monkskivirus, Moxhuvirus, Mutledovirus, Muyegivirus, Nadsecevirus, Naneatavirus, Napdanuvirus, Nedhivirus, Nehwtovirus, Newbovirus, Newpuvirus, Niankuvirus, Niuhvovirus, Niwnhavirus, Niwtovirus, Nohmivirus, Nohrdovirus, Northevirus, Oceshuvirus, Oldperovirus, Olmsdivirus, Omohevirus, Onohmuvirus, Opdykovirus, Overwhuvirus, Owenocuvirus, Oxychlovirus, Pailtovirus, Paloswovirus, Palsdevirus, Paysduvirus, Pedhlovirus, Pehohrivirus, Pehsaduvirus, Pepevirus, Perrunavirus, Philtcovirus, Phobpsivirus, Piceduvirus, Pihlevirus, Pilordavirus, Piponevirus, Pohlevirus, Poncivirus, Prihavirus, Prihovirus, Prisdovirus, Prosdovirus, Pruncivirus, Psimevirus, Pudlivirus, Punlevirus, Qubevirus, Quihndavirus, Radbaivirus, Rahdfavirus, Ratlevirus, Redbauvirus, Rehihmevirus, Rehudzovirus, Ridwavirus, Rusvolovirus, Rytunovirus, Sahwbrivirus, Sambuevirus, Saudhavirus, Sbehrnivirus, Scuadavirus, Sdadlevirus, Sdoctuvirus, Sdohnivirus, Sdredfovirus, Sdredtuvirus, Sdretovirus, Seckivirus, Sehpovirus, Selfuvirus, Seybrovirus, Shebanavirus, Shehrpovirus, Shestuvirus, Shihovirus, Shipsduvirus, Shodtevirus, Sholavirus, Shomudavirus, Shrewlivirus, Shuldovirus, Shutevirus, Shutovirus, Sincthavirus, Skhembuvirus, Smudhfivirus, Snitdevirus, Soetuvirus, Stanolovirus, Stehlmavirus, Sterodovirus, Stoartovirus, Stretavirus, Stritovirus, Suhtovirus, Swihdzovirus, Tahluvirus, Tapikevirus, Teciucevirus, Tehnexuvirus, Temblevirus, Templevirus, Templovirus, Tenwovirus, Thiwvovirus, Thiyevirus, Thobivirus, Thurlavirus, Ticahravirus, Todtivirus, Tohvovirus, Trotivirus, Trucevirus, Tudmivirus, Tysohivirus, Ulinhavirus, Upborqevirus, Ureyisuvirus, Ushumevirus, Vohsuavirus, Whietlevirus, Whilavirus, Wohudhevirus, Wyahnevirus, Yahnavirus, Yemegivirus, Yohcadevirus, Yuhrihovirus
    Čeleď: Solspiviridae (55 rodů)
    Rod: Andihavirus, Begindovirus, Dibaevirus, Dilzevirus, Duridgovirus, Eosonovirus, Etdyvivirus, Fahrmivirus, Hinehbovirus, Insbruvirus, Jargovirus, Lunjuvirus, Mahshuvirus, Mintinovirus, Puhrivirus, Puirovirus, Sexopuavirus, Thiuhmevirus, Tohkunevirus, Tyrahlevirus, Upirshuvirus, Vendavirus, Voulevirus, Wahlkovirus, Wahpevirus, Wahrwivirus, Wahtivirus, Warmivirus, Waspevirus, Wedhlevirus, Wehlfuvirus, Wehsdovirus, Welesbovirus, Weothlivirus, Whahdcavirus, Whochfovirus, Whotchuvirus, Whotnavirus, Wihbtavirus, Wihlevirus, Windevirus, Witirovirus, Wixfuvirus, Woatevirus, Wohlvevirus, Wohtovirus, Wolstavirus, Woshavirus, Wostovirus, Wruxevirus, Wulfhavirus, Wulmkuvirus, Wulouvirus, Wulvevirus, Wurmloivirus
    Řád: Timlovirales (2 čeledi)
    Čeleď: Blumeviridae (29 rodů)
    Rod: Alehndavirus, Bonghivirus, Brahivirus, Chimpavirus, Dahmuivirus, Dehgumevirus, Dehkhevirus, Espurtavirus, Gifriavirus, Hehrovirus, Hisehlovirus, Ivolevirus, Kahnayevirus, Kahraivirus, Kemiovirus, Kerishovirus, Konmavirus, Lirnavirus, Marskhivirus, Nehpavirus, Niwtuvirus, Pacehavirus, Pahdacivirus, Prorsmavirus, Semodevirus, Shihwivirus, Strotovirus, Wahdswovirus, Yenihzavirus
    Čeleď: Steitzviridae (202 rodů)
    Rod: Adahmuvirus, Alcestovirus, Alehxovirus, Alvestavirus, Asdankavirus, Ashcevirus, Austrovirus, Badtivirus, Bahrchivirus, Bahxtivirus, Bartuvirus, Behrmavirus, Beiedevirus, Beirlevirus, Bepbevirus, Berdovirus, Bertovirus, Bescotivirus, Bicehmovirus, Bidwovirus, Bihckevirus, Bihndovirus, Bilsivirus, Bircswevirus, Bishavirus, Bishovirus, Blacdavirus, Boaesivirus, Bohlehivirus, Boldovirus, Bourtovirus, Bridfovirus, Brikhyavirus, Brimcuvirus, Brimkuvirus, Broedwivirus, Buhdprovirus, Buhrmuvirus, Bulkovirus, Bushwuavirus, Butlevirus, Cahrlavirus, Campduvirus, Capbuvirus, Casfovirus, Cawstavirus, Cebevirus, Chebevirus, Chiruvirus, Chitwivirus, Churkhuvirus, Clavevirus, Clofavirus, Cumbruovirus, Cumpduvirus, Curdwovirus, Danchavirus, Darsivirus, Dordavirus, Drayduvirus, Dreycovirus, Eastcovirus, Eerlswavirus, Eidhovirus, Endehruvirus, Etingtavirus, Fagihovirus, Fejonovirus, Ferahgovirus, Fluruvirus, Frobavirus, Fudhoevirus, Gahmegovirus, Garnievirus, Gehrmavirus, Gihfavirus, Giliycovirus, Greatavirus, Grehevirus, Grehndovirus, Gulmivirus, Hahkesevirus, Hahselevirus, Hampduvirus, Hanolevirus, Harbevirus, Hardshivirus, Hihlwovirus, Hilfovirus, Hirbovirus, Hisolavirus, Hodnevirus, Hohnuvirus, Hohrdovirus, Huhbevirus, Huohcivirus, Huylevirus, Hyjrovirus, Iwahcevirus, Kecuhnavirus, Kihsiravirus, Kinglevirus, Kingscavirus, Koroslivirus, Laimuvirus, Lazuovirus, Lehemavirus, Lidbrovirus, Lidtloavirus, Lihvevirus, Limaivirus, Lipwuvirus, Litdlovirus, Litlevirus, Loecwouvirus, Lohwivirus, Loimivirus, Lomnativirus, Loptevirus, Lughthovirus, Luhtdivirus, Luwerquvirus, Mahdsavirus, Merlclivirus, Mertavirus, Metsavirus, Minusuvirus, Mixstovirus, Mocruvirus, Mohrtavirus, Molucevirus, Nehumivirus, Nehwbovirus, Nethevirus, Nuhnehevirus, Oldborovirus, Ovirwhivirus, Pahspavirus, Pidhluvirus, Pihckevirus, Pinlevirus, Pirifovirus, Podtsbuvirus, Pohlodivirus, Prihuvirus, Psiaduvirus, Puduphavirus, Quihndovirus, Retlevirus, Rodtovirus, Rydonovirus, Sahlfavirus, Sderotavirus, Sdrodtuvirus, Sehcuvirus, Sempoevirus, Setdovirus, Shiltuvirus, Shrewlevirus, Sidiruavirus, Sperdavirus, Stehnavirus, Stonedovirus, Strehtovirus, Strotuvirus, Studlivirus, Suhnsivirus, Surghavirus, Tamanovirus, Tehmuvirus, Tehnicivirus, Thehlovirus, Thuhrlavirus, Tikiyavirus, Timirovirus, Tsuhreavirus, Tuskovirus, Tuwendivirus, Ulenhavirus, Vindevirus, Wahlkavirus, Wahspovirus, Watorgevirus, Wehlevirus, Wesdanuvirus, Westonuvirus, Whadcovirus, Whidchuvirus, Whudnevirus, Wibpevirus, Widsokivirus, Wilfovirus, Wirwovirus, Wixfovirus, Wohodivirus, Wohrmlevirus, Wohtavirus, Wolvivirus, Wruxavirus, Wundevirus, Wushavirus, Yeziwivirus
  - Třída: Miaviricetes (1 řád)
    Řád: Ourlivirales (1 čeleď)
    Čeleď: Botourmiaviridae (12 rodů, 1 neuznaný rod)
    Rod: Betabotoulivirus, Betarhizoulivirus, Betascleroulivirus, Botoulivirus, Deltascleroulivirus, Epsilonscleroulivirus, Gammascleroulivirus, Magoulivirus, Ostravirus^[35]^[36] (neuznaný), Ourmiavirus, Penoulivirus, Rhizoulivirus, Scleroulivirus
- Kmen: Negarnaviricota (2 podkmeny, 1 nezařazená čeleď)
  Čeleď: Tosoviridae (1 rod)
  Rod: Fraservirus
  - Podkmen: Haploviricotina (4 třídy)
    - Třída: Chunqiuviricetes (1 řád)
      - Řád: Muvirales (1 čeleď)
        Čeleď: Qinviridae (1 rod)
        Rod: Yingvirus
    - Třída: Milneviricetes (1 řád)
      - Řád: Naedrevirales (1 čeleď)
        Čeleď: Aspiviridae (1 rod)
        Rod: Ophiovirus
    - Třída: Monjiviricetes (2 řády)
      - Řád: Jingchuvirales (5 čeledí)
        Čeleď: Aliusviridae (2 rody)
        Rod: Obscuruvirus, Ollusvirus
        Čeleď: Chuviridae (16 rodů)
        Rod: Boscovirus, Chuvivirus, Culicidavirus, Demapteravirus, Doliuvirus, Mivirus, Morsusvirus, Nigecruvirus, Odonatavirus, Pediavirus, Piscichuvirus, Pterovirus, Rochuvirus, Scarabeuvirus, Taceavirus, Vapochuvirus
        Čeleď: Crepuscuviridae (1 rod)
        Rod: Aqualaruvirus
        Čeleď: Myriaviridae (1 rod)
        Rod: Myriavirus
        Čeleď: Natareviridae (1 rod)
        Rod: Charybdivirus
      - Řád: Mononegavirales (11 čeledí)
        Čeleď: Artoviridae (2 rody)
        Rod: Hexartovirus, Peropuvirus
        Čeleď: Bornaviridae (4 rody)
        Rod: Carbovirus, Cartilovirus, Cultervirus, Orthobornavirus
        Čeleď: Filoviridae (9 rodů)
        Rod: Cuevavirus, Dianlovirus, Loebevirus, Oblavirus, Orthoebolavirus, Orthomarburgvirus, Striavirus, Tapjovirus, Thamnovirus
        Čeleď: Lispiviridae (25 rodů)
        Rod: Acridvirus, Aleyavirus, Aleybvirus, Anicalvirus, Anidravirus, Aranavirus, Aranbvirus, Arlivirus, Avesvirus, Birfecvirus, Copasivirus, Cybitervirus, Damravirus, Ganiavirus, Hemipvirus, Leocovirus, Nematovirus, Phelinovirus, Rivapovirus, Sanstrivirus, Stylovirus, Supelovirus, Synelinevirus, Usmuvirus, Xenophyvirus
        Čeleď: Mymonaviridae (9 rodů)
        Rod: Auricularimonavirus, Botrytimonavirus, Hubramonavirus, Lentimonavirus, Penicillimonavirus, Phyllomonavirus, Plasmopamonavirus, Rhizomonavirus, Sclerotimonavirus
        Čeleď: Nyamiviridae (7 rodů)
        Rod: Berhavirus, Crustavirus, Formivirus, Nyavirus, Orinovirus, Socyvirus, Tapwovirus
        Čeleď: Paramyxoviridae (9 podčeledí)
        Podčeleď: Avulavirinae (3 rody)
        Rod: Metaavulavirus, Orthoavulavirus, Paraavulavirus
        Podčeleď: Feraresvirinae (3 rody)
        Rod: Aquaparamyxovirus, Ferlavirus, Respirovirus
        Podčeleď: Glossavirinae (1 rod)
        Rod: Cynoglossusvirus
        Podčeleď: Ichthysvirinae (1 rod)
        Rod: Hoplichthysvirus
        Podčeleď: Kamposvirinae (1 rod)
        Rod: Hippocavirus
        Podčeleď: Metaparamyxovirinae (1 rod)
        Rod: Synodonvirus
        Podčeleď: Orthoparamyxovirinae (10 rodů)
        Rod: Bovinavirus, Henipavirus, Jeilongvirus, Morbillivirus, Narmovirus, Parahenipavirus, Parajeilongvirus, Paramorbillivirus, Salemvirus, Tupaivirus
        Podčeleď: Rubulavirinae (2 rody)
        Rod: Orthorubulavirus, Pararubulavirus
        Podčeleď: Skoliovirinae (1 rod)
        Rod: Scoliodonvirus
        Čeleď: Pneumoviridae (2 rody)
        Rod: Metapneumovirus, Orthopneumovirus
        Čeleď: Rhabdoviridae (4 podčeledi, 1 nezařazený rod)
        Rod: Platrhavirus
        Podčeleď: Alpharhabdovirinae (33 rodů)
        Rod: Almendravirus, Alphanemrhavirus, Alphapaprhavirus, Alpharicinrhavirus, Amplylivirus, Arurhavirus, Barhavirus, Caligrhavirus, Cetarhavirus, Curiovirus, Ephemerovirus, Hapavirus, Ledantevirus, Lostrhavirus, Lyssavirus, Merhavirus, Mousrhavirus, Ohlsrhavirus, Perhabdovirus, Replylivirus, Sawgrhavirus, Scophrhavirus, Sigmavirus, Siniperhavirus, Sprivivirus, Sripuvirus, Sunrhavirus, Thriprhavirus, Tibrovirus, Tupavirus, Uniorhavirus, Vesiculovirus, Zarhavirus
        Podčeleď: Betarhabdovirinae (9 rodů)
        Rod: Alphagymnorhavirus, Alphanucleorhabdovirus, Betagymnorhavirus, Betanucleorhabdovirus, Cytorhabdovirus, Deltanucleorhabdovirus, Dichorhavirus, Gammanucleorhabdovirus, Varicosavirus
        Podčeleď: Deltarhabdovirinae (11 rodů)
        Rod: Alphacrustrhavirus, Alphadrosrhavirus, Alphahymrhavirus, Betahymrhavirus, Betanemrhavirus, Betapaprhavirus, Betaricinrhavirus, Gammahymrhavirus, Gammaricinrhavirus, Primrhavirus, Stangrhavirus
        Podčeleď: Gammarhabdovirinae (2 rody)
        Rod: Margarhavirus, Novirhabdovirus
        Čeleď: Sunviridae (1 rod)
        Rod: Sunshinevirus
        Čeleď: Xinmoviridae (22 rodů)
        Rod: Alasvirus, Anphevirus, Corulvirus, Culivirus, Doupovirus, Draselvirus, Drunivirus, Gambievirus, Gordisvirus, Gudgevirus, Gylbovirus, Hoptevirus, Laumovirus, Madalivirus, Molauvirus, Nurnegvirus, Pelmivirus, Puclevirus, Tecephavirus, Triniovirus, Ulegvirus
    - Třída: Yunchangviricetes (1 řád)
      - Řád: Goujianvirales (1 čeleď)
        Čeleď: Yueviridae (1 rod)
        Rod: Yuyuevirus
  - Podkmen: Polyploviricotina (2 třídy)
    - Třída: Bunyaviricetes (2 řády)
      - Řád: Elliovirales (7 čeledí)
        Čeleď: Cruliviridae (1 rod)
        Rod: Lincruvirus
        Čeleď: Fimoviridae (1 rod)
        Rod: Emaravirus
        Čeleď: Hantaviridae (4 podčeledi)
        Podčeleď: Actantavirinae (2 rody)
        Rod: Actinovirus, Percilovirus
        Podčeleď: Agantavirinae (1 rod)
        Rod: Agnathovirus
        Podčeleď: Mammantavirinae (4 rody)
        Rod: Loanvirus, Mobatvirus, Orthohantavirus, Thottimvirus
        Podčeleď: Repantavirinae (1 rod)
        Rod: Reptillovirus
        Čeleď: Peribunyaviridae (8 rodů)
        Rod: Gryffinivirus, Herbevirus, Khurdivirus, Lakivirus, Lambavirus, Orthobunyavirus, Pacuvirus, Shangavirus
        Čeleď: Phasmaviridae (7 rodů)
        Rod: Cicadellivirus, Feravirus, Hymovirus, Jonvirus, Orthophasmavirus, Sawastrivirus, Wuhivirus
        Čeleď: Tospoviridae (1 rod)
        Rod: Orthotospovirus
        Čeleď: Tulasviridae (2 rody)
        Rod: Orthotulasvirus, Paratulasvirus
      - Řád: Hareavirales
        Čeleď: Arenaviridae (5 rodů)
        Rod: Antennavirus, Hartmanivirus, Innmovirus, Mammarenavirus, Reptarenavirus
        Čeleď: Discoviridae (1 rod)
        Rod: Orthodiscovirus
        Čeleď: Konkoviridae (1 rod)
        Rod: Olpivirus
        Čeleď: Leishbuviridae (1 rod)
        Rod: Shilevirus
        Čeleď: Mypoviridae (1 rod)
        Rod: Hubavirus
        Čeleď: Nairoviridae (8 rodů)
        Rod: Norwavirus, Ocetevirus, Orthonairovirus, Sabavirus, Shaspivirus, Sitinavirus, Striwavirus, Xinspivirus
        Čeleď: Phenuiviridae (23 rodů)
        Rod: Bandavirus, Beidivirus, Bocivirus, Citricivirus, Coguvirus, Entovirus, Goukovirus, Horwuvirus, Hudivirus, Hudovirus, Ixovirus, Laulavirus, Lentinuvirus, Mechlorovirus, Mobuvirus, Phasivirus, Phlebovirus, Pidchovirus, Rubodvirus, Tanzavirus, Tenuivirus, Uukuvirus, Wenrivirus
        Čeleď: Wupedeviridae (1 rod)
        Rod: Wumivirus
    - Třída: Insthoviricetes (1 řád)
      - Řád: Articulavirales (2 čeledi)
        Čeleď: Amnoonviridae (1 rod)
        Rod: Tilapinevirus
        Čeleď: Orthomyxoviridae (9 rodů)
        Rod: Alphainfluenzavirus, Betainfluenzavirus, Deltainfluenzavirus, Gammainfluenzavirus, Isavirus, Mykissvirus, Quaranjavirus, Sardinovirus, Thogotovirus
- Kmen (neuznaný): Paraxenoviricota^[29]^[32]^[33]^{[pozn. 12]}
- Kmen: Pisuviricota (3 třídy, 1 nezařazený řád, 1 nezařazená čeleď)
  Čeleď: Hadakaviridae (1 rod)
  Rod: Hadakavirus
  Řád: Yadokarivirales (1 čeleď)
  Čeleď: Yadokariviridae (2 rody)
  Rod: Alphayadokarivirus, Betayadokarivirus
  - Třída: Duplopiviricetes (1 řád)
    Řád: Durnavirales (6 čeledí)
    Čeleď: Amalgaviridae (2 rody)
    Rod: Amalgavirus, Zybavirus
    Čeleď: Curvulaviridae (1 rod)
    Rod: Orthocurvulavirus
    Čeleď: Fusariviridae (3 rody)
    Rod: Alphafusarivirus, Betafusarivirus, Gammafusarivirus
    Čeleď: Hypoviridae (8 rodů)
    Rod: Alphahypovirus, Betahypovirus, Deltahypovirus, Epsilonhypovirus, Etahypovirus, Gammahypovirus, Thetahypovirus, Zetahypovirus
    Čeleď: Partitiviridae (5 rodů)
    Rod: Alphapartitivirus, Betapartitivirus, Cryspovirus, Deltapartitivirus, Gammapartitivirus
    Čeleď: Picobirnaviridae (1 rod)
    Rod: Orthopicobirnavirus
  - Třída: Pisoniviricetes (3 řády)
    Řád: Nidovirales (8 podřádů)
    Podřád: Abnidovirineae (1 čeleď)
    Čeleď: Abyssoviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Tiamatvirinae (1 rod)
    Rod: Alphaabyssovirus
    Podřád: Arnidovirineae (4 čeledi)
    Čeleď: Arteriviridae (6 podčeledí)
    Podčeleď: Crocarterivirinae (1 rod)
    Rod: Muarterivirus
    Podčeleď: Equarterivirinae (1 rod)
    Rod: Alphaarterivirus
    Podčeleď: Heroarterivirinae (1 rod)
    Rod: Lambdaarterivirus
    Podčeleď: Simarterivirinae (6 rodů)
    Rod: Deltaarterivirus, Epsilonarterivirus, Etaarterivirus, Iotaarterivirus, Thetaarterivirus, Zetaarterivirus
    Podčeleď: Variarterivirinae (3 rody)
    Rod: Betaarterivirus, Gammaarterivirus, Nuarterivirus
    Podčeleď: Zealarterivirinae (1 rod)
    Rod: Kappaarterivirus
    Čeleď: Cremegaviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Becregavirinae (1 rod)
    Rod: Sicregavirus
    Podčeleď: Rodepovirinae (1 rod)
    Rod: Pontunivirus
    Čeleď: Gresnaviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Reternivirinae (1 rod)
    Rod: Cyclophivirus
    Čeleď: Olifoviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Gofosavirinae (1 rod)
    Rod: Kukrinivirus
    Podřád: Cornidovirineae (1 čeleď)
    Čeleď: Coronaviridae (3 podčeledi)
    Podčeleď: Letovirinae (1 rod)
    Rod: Alphaletovirus
    Podčeleď: Orthocoronavirinae (4 rody)
    Rod: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Deltacoronavirus, Gammacoronavirus
    Podčeleď: Pitovirinae (1 rod)
    Rod: Alphapironavirus
    Podřád: Mesnidovirineae (2 čeledi)
    Čeleď: Medioniviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Medionivirinae (2 rody)
    Rod: Bolenivirus, Turrinivirus
    Čeleď: Mesoniviridae (3 podčeledi)
    Podčeleď: Hexponivirinae (1 rod)
    Rod: Alphamesonivirus
    Podčeleď: Menanivirinae (1 rod)
    Rod: Nasenivirus
    Podčeleď: Metotonivirinae (2 rody)
    Rod: Tocinivirus, Tofonivirus
    Podřád: Monidovirineae (1 čeleď)
    Čeleď: Mononiviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Mononivirinae (1 rod)
    Rod: Alphamononivirus
    Podřád: Nanidovirineae (2 čeledi)
    Čeleď: Nanghoshaviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Chimanivirinae (1 rod)
    Rod: Chimshavirus
    Čeleď: Nanhypoviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Hyporhamsavirinae (1 rod)
    Rod: Sajorinivirus
    Podřád: Ronidovirineae (2 čeledi)
    Čeleď: Euroniviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Ceronivirinae (2 rody)
    Rod: Charybnivirus, Paguronivirus
    Čeleď: Roniviridae (1 podčeleď)
    Podčeleď: Okanivirinae (2 rody)
    Rod: Nimanivirus, Okavirus
    Podřád: Tornidovirineae (1 čeleď)
    Čeleď: Tobaniviridae (4 podčeledi)
    Podčeleď: Piscanivirinae (2 rody)
    Rod: Bafinivirus, Oncotshavirus
    Podčeleď: Remotovirinae (1 rod)
    Rod: Bostovirus
    Podčeleď: Serpentovirinae (7 rodů)
    Rod: Infratovirus, Lyctovirus, Pregotovirus, Sectovirus, Septovirus, Sertovirus, Vebetovirus
    Podčeleď: Torovirinae (1 rod)
    Rod: Torovirus
    Řád: Picornavirales (9 čeledí)
    Čeleď: Caliciviridae (11 rodů)
    Rod: Bavovirus, Lagovirus, Minovirus, Nacovirus, Nebovirus, Norovirus, Recovirus, Salovirus, Sapovirus, Valovirus, Vesivirus
    Čeleď: Dicistroviridae (3 rody)
    Rod: Aparavirus, Cripavirus, Triatovirus
    Čeleď: Iflaviridae (1 rod)
    Rod: Iflavirus
    Čeleď: Marnaviridae (7 rodů)
    Rod: Bacillarnavirus, Kusarnavirus, Labyrnavirus, Locarnavirus, Marnavirus, Salisharnavirus, Sogarnavirus
    Čeleď: Noraviridae (1 rod)
    Rod: Orthonoravirus
    Čeleď: Picornaviridae (5 podčeledí, 2 nezařazené rody)
    Rod: Ampivirus, Harkavirus
    Podčeleď: Caphthovirinae (16 rodů)
    Rod: Ailurivirus, Aphthovirus, Bopivirus, Cardiovirus, Cosavirus, Erbovirus, Hunnivirus, Malagasivirus, Marsupivirus, Mischivirus, Mosavirus, Mupivirus, Senecavirus, Teschovirus, Torchivirus, Tottorivirus
    Podčeleď: Ensavirinae (8 rodů)
    Rod: Anativirus, Boosepivirus, Diresapivirus, Enterovirus, Felipivirus, Parabovirus, Rabovirus, Sapelovirus
    Podčeleď: Heptrevirinae (7 rodů)
    Rod: Caecilivirus, Crahelivirus, Fipivirus, Gruhelivirus, Hepatovirus, Rohelivirus, Tremovirus
    Podčeleď: Kodimesavirinae (22 rodů)
    Rod: Danipivirus, Dicipivirus, Gallivirus, Hemipivirus, Kobuvirus, Livupivirus, Ludopivirus, Megrivirus, Myrropivirus, Oscivirus, Passerivirus, Pemapivirus, Poecivirus, Pygoscepivirus, Rafivirus, Rajidapivirus, Rosavirus, Sakobuvirus, Salivirus, Sicinivirus, Symapivirus, Tropivirus
    Podčeleď: Paavivirinae (13 rodů)
    Rod: Aalivirus, Aquamavirus, Avihepatovirus, Avisivirus, Crohivirus, Grusopivirus, Kunsagivirus, Limnipivirus, Orivirus, Parechovirus, Pasivirus, Potamipivirus, Shanbavirus
    Čeleď: Polycipiviridae (3 rody)
    Rod: Chipolycivirus, Hupolycivirus, Sopolycivirus
    Čeleď: Secoviridae (1 podčeleď, 6 nezařazených rodů)
    Rod: Cheravirus, Sadwavirus, Sequivirus, Stralarivirus, Torradovirus, Waikavirus
    Podčeleď: Comovirinae (3 rody)
    Rod: Comovirus, Fabavirus, Nepovirus
    Čeleď: Solinviviridae (2 rody)
    Rod: Invictavirus, Nyfulvavirus
    Řád: Sobelivirales (3 čeledi)
    Čeleď: Alvernaviridae (1 rod)
    Rod: Dinornavirus
    Čeleď: Barnaviridae (1 rod)
    Rod: Barnavirus
    Čeleď: Solemoviridae (5 rodů)
    Rod: Enamovirus, Hubsclerovirus, Polemovirus, Polerovirus, Sobemovirus
  - Třída: Stelpaviricetes (2 řády)
    Řád: Patatavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Potyviridae (12 rodů)
    Rod: Arepavirus, Bevemovirus, Brambyvirus, Bymovirus, Celavirus, Ipomovirus, Macluravirus, Poacevirus, Potyvirus, Roymovirus, Rymovirus, Tritimovirus
    Řád: Stellavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Astroviridae (2 rody)
    Rod: Avastrovirus, Mamastrovirus
- Kmen (neuznaný): Wamoviricota^[29]^[32]^[33]^{[pozn. 13]}
Říše: Pararnavirae (1 kmen)
- Kmen: Artverviricota (1 třída)
  - Třída: Revtraviricetes (2 řády)
    Řád: Blubervirales (1 čeleď, 1 neuznaná čeleď)
    Čeleď: Hepadnaviridae (5 rodů)
    Rod: Avihepadnavirus, Herpetohepadnavirus, Metahepadnavirus, Orthohepadnavirus, Parahepadnavirus
    Čeleď (neuznaná): Nackednaviridae^[37] (1 neuznaný rod)
    Rod (neuznaný): Nackednavirus^[37]
    Řád: Ortervirales (5 čeledí)
    Čeleď: Belpaoviridae (1 rod)
    Rod: Semotivirus
    Čeleď: Caulimoviridae (11 rodů)
    Rod: Badnavirus, Caulimovirus, Cavemovirus, Dioscovirus, Petuvirus, Rosadnavirus, Ruflodivirus, Solendovirus, Soymovirus, Tungrovirus, Vaccinivirus
    Čeleď: Metaviridae (2 rodů)
    Rod: Errantivirus, Metavirus
    Čeleď: Pseudoviridae (3 rody)
    Rod: Hemivirus, Pseudovirus, Sirevirus
    Čeleď: Retroviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Orthoretrovirinae (6 rodů)
    Rod: Alpharetrovirus, Betaretrovirus, Deltaretrovirus, Epsilonretrovirus, Gammaretrovirus, Lentivirus
    Podčeleď: Spumaretrovirinae (5 rodů)
    Rod: Bovispumavirus, Equispumavirus, Felispumavirus, Prosimiispumavirus, Simiispumavirus

Ribozyviria

Realm: Ribozyviria (1 čeleď)

Čeleď: Kolmioviridae (11 rodů)
- Rod: Daazvirus, Dagazvirus, Daletvirus, Dalvirus, Deevirus, Deltavirus, Dobrovirus, Donvirus, Perideltavirus, Perithurisazvirus, Thurisazvirus

Varidnaviria

Realm: Varidnaviria (2 říše)

Říše: Bamfordvirae (2 kmeny, 1 nezařazená čeleď)
Čeleď: Yaraviridae (1 rod)
Rod: Yaravirus^[38]
- Kmen: Nucleocytoviricota^{[pozn. 14]} (2 třídy, 1 neuznaná třída)^{[pozn. 15]}
  - Třída: Megaviricetes (3 řády, 1 nezařazená čeleď)
    Čeleď: Mamonoviridae (pův. Medusaviridae^[43])
    Rod: Medusavirus^[43]^[44]
    Řád: Algavirales (1 čeleď, 1 neuznaná čeleď, 1 neuznaný rod)
    Rod (neuznaný): Mollivirus^[45]
    Čeleď (neuznaná): Pandoraviridae^[46]^[47]^[48] (1 neuznaný rod)
    Rod (neuznaný): Pandoravirus^[46]^[47]^[48]
    Čeleď: Phycodnaviridae (6 rodů)
    Rod: Chlorovirus, Coccolithovirus, Phaeovirus, Prasinovirus, Prymnesiovirus, Raphidovirus
    Řád: Imitervirales (4 čeledi)
    Čeleď: Allomimiviridae (2 rody)
    Rod: Heliosvirus, Oceanusvirus
    Čeleď: Mesomimiviridae (1 rod)
    Rod: Tethysvirus
    Čeleď: Mimiviridae (3 podčeledi)
    Podčeleď: Aliimimivirinae (1 rod)
    Rod: Rheavirus
    Podčeleď: Klosneuvirinae^[49] (3 rody, 4 neuznané rody)
    Rod: Catovirus^[49] (neuznaný; vč. Naegleriavirus^[50]), Fadolivirus, Theiavirus, Yasminevirus, Hokovirus^[49] (neuznaný), Indivirus^[49] (neuznaný), Klosneuvirus^[49] (neuznaný)
    Podčeleď: Megamimivirinae (5 rodů)
    Rod: Cotonvirus, Megavirus^[51], Mimivirus (vč. Lentillevirus^[52], někdy navrhovaného vyčlenit do samostatného rodu, jako již vyčleněné Megavirus a Moumouvirus)^[53], Moumouvirus^[54], Tupanvirus^[55]^[53]
    Čeleď: Schizomimiviridae (2 rody)
    Rod: Biavirus, Kratosvirus
    Řád: Pimascovirales^{[pozn. 16]} (6 čeledí, 1 neuznaná čeleď)
    Čeleď: Ascoviridae (2 rody)
    Rod: Ascovirus, Toursvirus
    Čeleď: Cedratviridae (1 rod)
    Rod: Alphacedratvirus^[56]
    Čeleď: Iridoviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Alphairidovirinae (3 rody)
    Rod: Lymphocystivirus, Megalocytivirus, Ranavirus
    Podčeleď: Betairidovirinae (4 rody)
    Rod: Chloriridovirus, Daphniairidovirus, Decapodiridovirus, Iridovirus
    Čeleď: Marseilleviridae (2 rody)
    Rod: Lausannavirus (vč. býv. Tunisvirus), Marseillevirus
    Čeleď: Orpheoviridae (1 rod)
    Rod: Alphaorpheovirus^[57]
    Čeleď: Pithoviridae^[58]^[59]^[60] (1 rod)
    Rod: Alphapithovirus^[58]
  - Třída: Pokkesviricetes (2 řády)
    Řád: Asfuvirales (1 čeleď, 3 neuznané rody)
    Rod (neuznaný): Faustovirus^[61]^[62], Kaumoebavirus^[63], Pacmanvirus^[64]
    Čeleď: Asfarviridae (1 rod)
    Rod: Asfivirus
    Řád: Chitovirales (1 čeleď)
    Čeleď: Poxviridae (2 podčeledi)
    Podčeleď: Chordopoxvirinae (18 rodů)
    Rod: Avipoxvirus, Capripoxvirus, Centapoxvirus, Cervidpoxvirus, Crocodylidpoxvirus, Leporipoxvirus, Macropopoxvirus, Molluscipoxvirus, Mustelpoxvirus, Orthopoxvirus, Oryzopoxvirus, Parapoxvirus, Pteropopoxvirus, Salmonpoxvirus, Sciuripoxvirus, Suipoxvirus, Vespertilionpoxvirus, Yatapoxvirus
    Podčeleď: Entomopoxvirinae (4 rody)
    Rod: Alphaentomopoxvirus, Betaentomopoxvirus, Deltaentomopoxvirus, Epsilonentomopoxvirus
  - Třída (neuznaná): Proculviricetes^[19]^[20]^[21]
- Kmen: Preplasmiviricota (4 třídy)
  - Třída: Ainoaviricetes (1 řád)
    Řád: Lautamovirales (1 čeleď)
    Čeleď: Finnlakeviridae (1 rod)
    Rod: Finnlakevirus
  - Třída: Maveriviricetes (4 řády)
    Řád: Divpevirales (1 čeleď)
    Čeleď: Ruviroviridae (1 rod)
    Rod: Oviruvirus
    Řád: Lavidavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Lavidaviridae (1 rod)^{[pozn. 17]}
    Rod: Mavirus (vč. pův. Cafeteriavirus)
    Řád: Mividavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Sputniviroviridae (1 rod)
    Rod: Sputnikvirus
    Řád: Priklausovirales (4 čeledi)
    Čeleď: Burtonviroviridae (1 rod)
    Rod: Burquivirus
    Čeleď: Dishuiviroviridae (1 rod)
    Rod: Essdubovirus
    Čeleď: Gulliviroviridae (1 rod)
    Rod: Invirovirus
    Čeleď: Omnilimnoviroviridae (1 rod)
    Rod: Panaquavirovirus
  - Třída: Polintoviricetes (1 řád)
    Řád: Orthopolintovirales (1 čeleď)
    Čeleď: Adintoviridae (2 rody)
    Rod: Alphadintovirus, Betadintovirus
  - Třída: Tectiliviricetes (6 řádů, 1 nezařazená čeleď)
    Čeleď: Autolykiviridae^[66]^[67]^[68] (2 rody)
    Rod: Livvievirus, Paulavirus
    Řád: Atroposvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Skuldviridae^[25] (1 rod)
    Rod: Delusorvirus
    Řád: Belfryvirales (1 čeleď)
    Čeleď: Turriviridae (1 rod)
    Rod: Alphaturrivirus
    Řád: Coyopavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Chaacviridae (2 rody)
    Rod: Antichaacvirus, Homochaacvirus
    Řád: Kalamavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Tectiviridae (5 rodů)
    Rod: Alphatectivirus, Betatectivirus, Deltatectivirus, Epsilontectivirus, Gammatectivirus
    Řád: Rowavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Adenoviridae (6 rodů)
    Rod: Aviadenovirus, Barthadenovirus (dříve Atadenovirus), Ichtadenovirus, Mastadenovirus, Siadenovirus, Testadenovirus
    Řád: Vinavirales (1 čeleď)
    Čeleď: Corticoviridae (1 rod)
    Rod: Corticovirus
Říše: Helvetiavirae (1 kmen)
- Kmen: Dividoviricota (1 třída)
  - Třída: Laserviricetes (1 řád)
    Řád: Halopanivirales (3 čeledi)
    Čeleď: Matsushitaviridae (1 rod)
    Rod: Hukuchivirus
    Čeleď: Simuloviridae (1 rod)
    Rod: Yingchengvirus
    Čeleď: Sphaerolipoviridae (1 rod)
    Rod: Alphasphaerolipovirus

Nezařazené do realmů

(1 nezařazená třída, 22 nezařazených čeledí, 1 neuznaná nezařazená čeleď, 2 nezařazené rody, 1 neuznaný nezařazený rod)

Rod: Dinodnavirus, Rhizidiovirus, Tornovirus^[69] (neuznaný)

Čeleď: Alphasatellitidae (3 podčeledi)
- Podčeleď: Geminialphasatellitinae (7 rodů)
  - Rod: Ageyesisatellite, Clecrusatellite, Colecusatellite, Draflysatellite, Gosmusatellite, Somasatellite, Whiflysatellite
- Podčeleď: Nanoalphasatellitinae (6 rodů)
  - Rod: Clostunsatellite, Fabenesatellite, Milvetsatellite, Mivedwarsatellite, Sophoyesatellite, Podclovsatellite
- Podčeleď: Petromoalphasatellitinae (5 rodů)
  - Rod: Babusatellite, Cocosatellite, Coprasatellite, Kobbarisatellite, Muscarsatellite
Čeleď: Ampullaviridae (1 rod)
- Rod: Bottigliavirus
Čeleď: Anelloviridae (34 rodů)
- Rod: Aleptorquevirus, Alphatorquevirus, Betatorquevirus, Chitorquevirus, Dalettorquevirus, Deltatorquevirus, Epsilontorquevirus, Etatorquevirus, Gammatorquevirus, Gimeltorquevirus, Gyrovirus, Hetorquevirus, Iotatorquevirus, Kappatorquevirus, Lambdatorquevirus, Lamedtorquevirus, Memtorquevirus, Mutorquevirus, Nutorquevirus, Omegatorquevirus, Omicrontorquevirus, Pitorquevirus, Psitorquevirus, Rhotorquevirus, Samektorquevirus, Sigmatorquevirus, Tettorquevirus, Thetatorquevirus, Upsilontorquevirus, Wawtorquevirus, Xitorquevirus, Yodtorquevirus, Zayintorquevirus, Zetatorquevirus
Čeleď: Avsunviroidae (3 rody)
- Rod: Avsunviroid, Elaviroid, Pelamoviroid
Čeleď: Bartogtaviriformidae (1 rod)
- Rod: Bartonegtaviriform
Čeleď: Bicaudaviridae (1 rod)
- Rod: Bicaudavirus
Čeleď: Brachygtaviriformidae (1 rod)
- Rod: Brachyspigtaviriform
Čeleď: Clavaviridae (1 rod)
- Rod: Clavavirus
Čeleď: Fuselloviridae (2 rody)
- Rod: Alphafusellovirus, Betafusellovirus
Čeleď: Globuloviridae (1 rod)
- Rod: Alphaglobulovirus
Čeleď: Guttaviridae (1 rod)
- Rod: Betaguttavirus
Čeleď: Halspiviridae (1 rod)
- Rod: Salterprovirus
Čeleď: Itzamnaviridae (2 rody)
- Rod: Demiitzamnavirus, Pletoitzamnavirus
Čeleď: Ovaliviridae (1 rod)
- Rod: Alphaovalivirus
Čeleď: Plasmaviridae (1 rod)
- Rod: Plasmavirus
Čeleď: Polydnaviriformidae^{[pozn. 18]} (2 rody)
- Rod: Bracoviriform, Ichnoviriform
Čeleď: Portogloboviridae (1 rod)
- Rod: Alphaportoglobovirus
Čeleď: Pospiviroidae (5 rodů)
- Rod: Apscaviroid, Cocadviroid, Coleviroid, Hostuviroid, Pospiviroid
Čeleď: Rhodogtaviriformidae (4 rody)
- Rod: Dinogtavirus, Rhodobactegtavirus, Rhodovulugtavirus, Ruegerigtaviriform
Čeleď: Spiraviridae (1 rod)
- Rod: Alphaspiravirus
Čeleď: Thaspiviridae (1 rod)
- Rod: Nitmarvirus
Čeleď: Tolecusatellitidae (2 rody)
- Rod: Betavirus, Deltasatellite
Čeleď (neuznaná): Wyrdviridae^[25]

Třída: Naldaviricetes^{[pozn. 18]} (1 řád, 1 nezařazená čeleď)
Čeleď: Nimaviridae (1 rod)
Rod: Whispovirus
- Řád: Lefavirales (3 čeledi)
  - Čeleď: Baculoviridae (4 rody)
    Rod: Alphabaculovirus, Betabaculovirus, Deltabaculovirus, Gammabaculovirus
  - Čeleď: Hytrosaviridae (2 rody)
    Rod: Glossinavirus, Muscavirus
  - Čeleď: Nudiviridae (4 rody)
    Rod: Alphanudivirus, Betanudivirus, Deltanudivirus, Gammanudivirus

Baltimorova klasifikace

Baltimorova klasifikace je systém klasifikace virů do sedmi skupin podle typu genetického materiálu, který je obsažen ve virových částicích, a způsobu jeho přepisu do virové mRNA. Klasifikaci poprvé navrhl v roce 1971 David Baltimore, pozdější nositel Nobelovy ceny za fyziologii nebo lékařství.^[72] V jeho původním návrhu bylo šest skupin virů (I.–VI.), sedmá skupina byla vytvořena pro později objevenou skupinu hepadnavirů s unikátně stavěným genomem. Systém umožňuje zjednodušit si nesmírně komplikované a rozmanité typy forem a životních cyklů, jimiž viry oplývají,^[73] ale protože není hierarchicky strukturovaný, na skutečnou systematiku tisíců známých virů již nestačí. Vzhledem k definici skupin nemůže přesně začlenit viroidy a jim podobné entity s kruhově uspořádaným genomem (ambiviry, obelisky), v tradičním pojetí nezahrnuje ani retrotranspozony a satelitní nukleové kyseliny (pojetí ICTV tyto tři skupiny mezi viry řadí a taxonomicky je klasifikuje).

Jedná se tak o jednoduché, jednoúrovňové, dosud běžně používané třídění, které dříve (do r. 2019, kdy byl vytvořen první realm – Riboviria, zahrnující skupiny III.–V.) bylo možno až na drobné výjimky nadřadit systému ICTV. To ale neznamená, že se u skupin Baltimorovy klasifikace jedná o fylogeneticky přirozené taxony;^{[pozn. 19]} ani jejich vymezení podle genomu nemusí být úplně přesné vzhledem k podřazeným nižším taxonům ICTV.^{[pozn. 20]}^{[pozn. 21]}^{[pozn. 22]} To je důvod, proč Baltimorova klasifikace postupně zastarává.

Skupina I.: dsDNA viry, tedy viry s dvouvláknovou DNA
Patří sem:
- realm: Adnaviria
- realm: Duplodnaviria
- realm: Varidnaviria
- řád: Sepolyvirales (realm Monodnaviria)
- a dále:
  - nezařazená třída: Naldaviricetes
  - nezařazená čeleď: Ampullaviridae
  - nezařazená čeleď: Bartogtaviriformidae
  - nezařazená čeleď: Bicaudaviridae
  - nezařazená čeleď: Brachygtaviriformidae
  - nezařazená čeleď: Clavaviridae
  - nezařazená čeleď: Fuselloviridae
  - nezařazená čeleď: Globuloviridae
  - nezařazená čeleď: Guttaviridae
  - nezařazená čeleď: Halspiviridae
  - nezařazená čeleď: Itzamnaviridae
  - nezařazená čeleď: Ovaliviridae
  - nezařazená čeleď: Plasmaviridae
  - nezařazená čeleď: Polydnaviriformidae
  - nezařazená čeleď: Portogloboviridae
  - nezařazená čeleď: Rhodogtaviriformidae
  - nezařazená čeleď: Thaspiviridae
  - nezařazené rody: Dinodnavirus, Rhizidiovirus

Skupina II.: ssDNA viry, tedy viry s jednovláknovou DNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
Patří sem:
- většina realmu Monodnaviria, jmenovitě:
  - říše: Loebvirae
  - říše: Sangervirae
  - říše: Trapavirae = čeleď Pleolipoviridae^{[pozn. 20]}
  - kmen: Cressdnaviricota
  - třída: Mouviricetes = čeleď Bidnaviridae
  - třída: Quintoviricetes
  - řád: Zurhausenvirales
- a dále:
  - nezařazená čeleď: Anelloviridae
  - nezařazená čeleď: Spiraviridae
  - nezařazený rod: Tornovirus (neuznaný)
Ačkoli oficiální Baltimorova klasifikace nezahrnuje satelitní nukleové kyseliny, z hlediska genomu by se ke skupině II. mohly přiřadit i

nezařazená čeleď: Alphasatellitidae a
nezařazená čeleď: Tolecusatellitidae.

Skupina III.: dsRNA viry, tedy viry s dvouvláknovou RNA
Patří sem následující taxony z realmu Riboviria:
- kmen: Duplornaviricota
- čeleď: Amalgaviridae
- čeleď: Curvulaviridae
- čeleď: Birnaviridae
- čeleď: Partitiviridae
- čeleď: Picobirnaviridae
- čeleď: Polymycoviridae
- rod: Botybirnavirus

Skupina IV.: ssRNA viry s pozitivní polaritou, tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
Patří sem následující taxony z realmu Riboviria:
- kmen: Kitrinoviricota
- kmen: Lenarviricota
- třída: Pisoniviricetes
- třída: Stelpaviricetes
- řád: Yadokarivirales
- čeleď: Fusariviridae^{[pozn. 23]}
- čeleď: Hadakaviridae
- čeleď: Hypoviridae^{[pozn. 23]}
- čeleď: Permutotetraviridae
- čeleď: Sarthroviridae
- rody: Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus

Skupina V.: ssRNA viry s negativní polaritou, tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA opačné polarity
Patří sem:
- realm: Ribozyviria
- kmen Negarnaviricota (realm Riboviria)^{[pozn. 21]}

Skupina VI.: ssRNA viry s reverzní transkriptázou, tedy viry s jednovláknovou RNA reverzně přepisovanou do DNA
Patří sem:
- většina řádu Ortervirales (realm Riboviria), jmenovitě:
  - čeleď: Belpaoviridae
  - čeleď: Retroviridae
Ačkoli oficiální Baltimorova klasifikace nezahrnuje retrotranspozony, z hlediska genomu by se ke skupině VI. mohly přiřadit i:
- čeleď: Metaviridae
- čeleď: Pseudoviridae

Skupina VII.: dsDNA viry s reverzní transkriptázou, tedy viry s dvouvláknovou (částečně i jednovláknovou) DNA nejprve přepisovanou do RNA a následně reverzně přepisovanou do DNA
Patří sem:
- řád Blubervirales = čeleď Hepadnaviridae (realm Riboviria)
- čeleď Caulimoviridae z řádu Ortervirales (realm Riboviria)

Systém LHT

Systém navrhli v roce 1962 André Lwoff, R. W. Horne a P. Tournier. K zařazení druhů využili standardní taxony kmen, podkmen, třída, řád, podřád, čeleď, podčeleď a rod. Kritériem sdružování byly společně sdílené vlastnosti, nikoli napadané organismy. Pět hlavních charakteristik používaných ke klasifikaci bylo:

druh nukleové kyseliny genomu (DNA, RNA)
symetrie kapsidy (šroubovice, dvacetistěn, složitý tvar)
přítomnost či nepřítomnost obálky
rozměry virionu a kapsidy
počet kapsomer.

Ve stejném roce byla klasifikace schválena Prozatímním výborem pro nomenklaturu virů (Provisional Committee on Nomenclature of Virus – PNVC) Mezinárodní asociace mikrobiologických společností (International Association of Microbiological Societies – IAMS).

V dnešní době se již systém LHT nepoužívá, ale názvy některých taxonů přetrvávají v systému ICTV. Do úrovně čeledí vypadal následovně:^[78]

Kmen Vira (rozdělen na 2 podkmeny)
- Podkmen Deoxyvira (DNA viry)
  - Třída Deoxybinala (duální symetrie)
    - Řád Urovirales
      Čeleď Phagoviridae
  - Třída Deoxyhelica (helikální symetrie – šroubovice)
    - Řád Chitovirales
      Čeleď Poxviridae
  - Třída Deoxycubica (kubická symetrie – mnohostěn)
    - Řád Peplovirales
      Čeleď Herpesviridae (162 kapsomer)
    - Řád Haplovirales (bez obálky)
      Čeleď Iridoviridae (812 kapsomer)
      Čeleď Adenoviridae (252 kapsomer)
      Čeleď Papiloviridae (72 kapsomer)
      Čeleď Paroviridae (32 kapsomer)
      Čeleď Microviridae (12 kapsomer)
- Podkmen Ribovira (RNA viry)
  - Třída Ribocubica (kubická symetrie – mnohostěn)
    - Řád Togovirales
      Čeleď Arboviridae
    - Řád Lymovirales
      Čeleď Napoviridae
      Čeleď Reoviridae
  - Třída Ribohelica (helikální symetrie – šroubovice)
    - Řád Sagovirales
      Čeleď Stomataviridae
      Čeleď Paramyxoviridae
      Čeleď Myxoviridae
    - Řád Rhabdovirales
      - Podřád Flexiviridales
        Čeleď Mesoviridae
        Čeleď Peptoviridae
      - Podřád Rigidovirales
        Čeleď Pachyviridae
        Čeleď Protoviridae
        Čeleď Polichoviridae

Poznámky

↑ Viriformy jsou operativně definovány jako typ přenosných genetických prvků (MGE, z angl. mobile genetic element) odvozených z viru, které byly jejich organickými (buněčnými) hostiteli exapovány, aby plnily funkce důležité pro životní cyklus hostitele, včetně těch přenosných genetických elementů, které jsou v průběhu evoluce od takových entit odvozeny.^[1]
↑ Český ekvivalent anglického realm není dosud ustálen. Někdy se překládá jako doména^[4], tou je však zpravidla míněn taxon, anglicky zvaný domain. Takto míněná doména je však ve vztahu k virům používána výjimečně a nemá jednoznačné vymezení: buď zahrnuje všechny viry, nebo se používá jen na skupinu velkých jaderně-cytoplazmatických DNA virů (NCLDV), pro které jedna z hypotéz předpokládá, že jsou reliktem samostatné linie, tzv. čtvrté domény buněčných organismů, které svou stavbou připomínají a jejichž redukcí vznikly.^[5]^[6]^[7] Vzájemné vztahy NCLDV a buněčných organismů jsou však komplexnější.^[8] I sám ICTV ve svém „Prohlášení o shodě“ na hierarchii nových úrovních taxonomie virů^[9] uvádí, že nejvyšší taxon je pojmenován realm, na rozdíl od domény v jiných taxonomiích, aby byl reflektován komplexní vzájemný vztah taxonomie virů vzhledem k jejich protějškům u buněčných organismů.
↑ Zvláštní realm Ribozyviria byl vzhledem k odlišnosti stavby virionu i virovému genomu vytvořen pro dlouho známý rod Deltavirus s kruhovou ssRNA, tradičně pojmenovaný a klasifikovaný jako virus, i když jde o satelitní virus a tedy v některých systémech řazený jako subvirová částice, a jemu podobné nově popsané rody satelitních virů
↑ Jako obelisky se označují viroidům podobné entity kolonizujících bakterie lidského zažívacího traktu, představující neobalené genomy s kruhovou RNA, která je větší a na rozdíl od viroidů obsahuje i sekvence kódující proteiny dosud neznámé rodiny („obliny“), některé z nich i se signaturou ribozymů replikačního mechanismu podobného viroidům, nikoli však proteiny pro virový obal.^[15]^[16]^[17]
↑ tedy nikoli dle české abecedy (jména začínající ch jsou řazena mezi jmény začínajícími c mezi cg a ci) ani dle alfabety (např. jména začínající gamma nenásledují po beta, ale jsou řazena až po delta, epsilon a eta)
↑ Většina nezařazených podčeledí a rodů byla dříve řazena do řádu Caudovirales, čeledí Myoviridae, Podoviridae a Siphoviridae, dnes již zrušených.^[22]
↑ Do třídy Caudoviricetes pravděpodobně náleží i nově objevené nekultivované archeální viry (dosud neuznané jako rody) Fenrir a Sköll (infikují Lokiarchaeota), Ratatoskr a Nidhogg (infikují Helarchaeota) a Vedfolnir (infikuje Thorarchaeota).^[23]
↑ Dříve navrhováno zařazení do řádu Geplafuvirales, neuznané čeledi Naminiviridae^[26]
↑ Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových fylogeneticky odlišných linií, které neodpovídají stávajícím klasifikačním schématům; lze proto očekávat vytváření nejen nových taxonů na úrovni čeledí a rodů, ale i možné hlubší změny v obsahu vyšších taxonů a topologii jejich fylogenetických stromů^[28]^[29]^[30]
↑ Předpokládaná významnost zastoupení v oceánech byla významně snížena, což může vyústit v ponížení taxonomické úrovně a zrušení navrhovaného kmene.^[31]
↑ Vzhledem k výraznější odlišnosti, představující mezipolohu mezi říšemi Orthornavirae and Pararnavirae, může tento kmen představovat skupinu nové, dosud nepopsané samostatné říše RNA virů.^[30]
↑ Průkaznost je zatím nedostatečná pro uznání jako nového kmene; možná bude začleněno jako součást nového kmene společného i pro neuznaný kmen Wamoviricota, nebo jako součást rozšířeného kmene Kitrinoviricota.^[31]
↑ Průkaznost je zatím nedostatečná pro uznání jako nového kmene. Většina spadá do Duplornaviricota; zbytek možná bude začleněn jako součást nového kmene společného i pro neuznaný kmen Paraxenoviricota, nebo jako součást rozšířeného kmene Kitrinoviricota.^[31]
↑ Dříve používané názvy pro skupinu téhož vymezení: „NCLDV group“, „Megavirales“ (před zavedením taxonů vyšších než řád, proto s příponou řádu)^[7]^[39]^[40]^[41]
↑ Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových kladů na úrovni podčeledí či rodů, dosud neuznaných jako samostatné taxony^[42]
↑ Dříve používaný název pro skupinu téhož vymezení: „superklad MAPI“^[8]
↑ Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových kladů na úrovni rodů, dosud neuznaných jako samostatné taxony^[65]
↑ ^a ^b Čeleď Polydnaviriformidae, dříve nazývaná Polydnaviridae, a čeledi třídy Naldaviricetes (Baculoviridae, Hytrosaviridae, Nimoviridae a Nudiviridae) sdílejí část genů s viry kmene Nucleocytoviricota (realm Varidnaviria), což může naznačovat jejich společnou příslušnost k vyššímu, dosud nezavedenému taxonu.^[70] ^[71]
↑ Např. III. skupina (dsRNA viry) je považována za polyfyletickou, k ní patřící čeleď Amalgaviridae dokonce s velkou pravděpodobností vznikla rekombinací RNA virů dvou různých skupin Baltimorovy klasifikace.^[74]
↑ ^a ^b Viry z čeleď Pleolipoviridae, řazené tradičně do skupiny II, tedy ssDNA virů, mohou mít ve skutečnosti genom různého druhu; Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1 (HHPV-1) typu má např. kruhovou dsDNA, His2 virus lineární dsDNA, Halorunbrum pleomorphic virus 3 (HRPV-3) a Halogeometricum pleomorphic virus 1 (HGPV-1) mají v dsDNA úseky ssDNA.^[75]
↑ ^a ^b Viry z rodů Coguvirus, Entovirus, Lentinuvirus, Orthotospovirus, Reptarenavirus, jakož i některé viry z rodu Antennavirus, Bandavirus, Hartmanivirus, Mammarenavirus, Phlebovirus, Rubodvirus, Tenuivirus a Uukuvirus obsahují ve svém genomu vedle ssRNA s negativní polaritou i ssRNA s pozitivní polaritou, ale tradičně i podle fylogenetické příbuznosti se řadí do Baltimorovy skupiny V.^[77]^[12]
↑ Do řádu Ortervilales spadá vedle Baltimorovy skupiny VI. i čeleď Caulimoviridae ze skupiny VII.
↑ ^a ^b Viry z čeledí Fusariviridae a Hypoviridae vytvářejí ve svém životním cyklu i dsRNA a nejsou tak typickými představiteli skupiny IV. Baltimorovy klasifikace. Označují se jako „ssRNA viry s životním stylem dsRNA“^[76]

Odkazy

Reference

↑ ^a ^b ^c ^d ^e The International Code of Virus Classification and Nomenclature. Odstavce 3.3, 3.21, 3.24, 3.26, 3.27, 3.28. ICTV, březen 2021. Dostupné online (anglicky)
↑ FLORES, R.; RANDLES, J. W.; BAR-JOSEPH, M., DIENER, T. O. A proposed scheme for viroid classification and nomenclature. S. 623–629. Arch Virol. [online]. 1998. Svazek 143, s. 623–629. (anglicky)
↑ DIENER, T. O. The viroid: biological oddity or evolutionary fossil?. S. 137–184. Adv Virus Res. [online]. 2001. Svazek 57, s. 137–184. (anglicky)
↑ ^a ^b FORSTOVÁ, Jitka; FRAIBERK, Martin. Diverzita virů. S. 212–215. Živa [online]. Academia, 17. říjen 2019. Roč. 2019, čís. 5, s. 212–215. Dostupné online. ISSN 0044-4812.
↑ BOYER, Mickaël; MADOUI, Mohammed-Amine; GIMENEZ, Gregory, Bernard La Scola, Didier Raoult. Phylogenetic and Phyletic Studies of Informational Genes in Genomes Highlight Existence of a 4th Domain of Life Including Giant Viruses. E15530. PLoS One [online]. 2. prosinec 2010 [cit. 2011-05-03]. Svazek 5, čís. 12. Dostupné online. PDF [1]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0015530. (anglicky)
↑ COLSON, Philippe; GIMENEZ, Gregory; BOYER, Mickaël, Ghislain Fournous, Didier Raoult. The Giant Cafeteria roenbergensis Virus That Infects a Widespread Marine Phagocytic Protist Is a New Member of the Fourth Domain of Life. E18935. PLoS One [online]. 29. duben 2011 [cit. 2011-05-03]. Svazek 6, čís. 4. Dostupné online. PDF [2]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0018935. (anglicky)
↑ ^a ^b COLSON, Philippe; LAMBALLERIE, Xavier de; FOURNOUS, Ghislain; RAOULT, Didier. Reclassification of Giant Viruses Composing a Fourth Domain of Life in the New Order Megavirales. S. 321–332. Intervirology [online]. S. Karger AG, 14. duben 2012. Svazek 55, čís. 5, s. 321–332. Dostupné online. ISSN 1423-0100. DOI 10.1159/000336562. PMID 22508375. (anglicky)
↑ ^a ^b GUGLIELMINI, Julien; WOO, Anthony C.; KRUPOVIC, Mart; FORTERRE, Patrick; GAIA, Morgan. Diversification of giant and large eukaryotic dsDNA viruses predated the origin of modern eukaryotes. S. 19 585 – 19 592. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. National Academy of Sciences, 10. září 2019. Svazek 116, čís. 39, s. 19 585 – 19 592. Dostupné online. Dostupné také na: [3]. preprint [4]. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1912006116. PMID 31506349. (anglicky)
↑ ^a ^b GORBALENYA, Alexander E.; KRUPOVIC, Mart; MUSHEGIAN, Arcady, et al . (International Committee on Taxonomy of Viruses Executive Committee). The new scope of virus taxonomy: partitioning the virosphere into 15 hierarchical ranks. S. 668–674. Nature Microbiology [online]. Springer Nature Limited, 27. duben 2020. Svazek 5, čís. 5, s. 668–674. Dostupné online. Dostupné také na: [5]. ISSN 2058-5276. DOI 10.1038/s41564-020-0709-x. (anglicky)
↑ SIDDELL, Stuart G.; WALKER, Peter J.; LEFKOWITZ, Elliot J., et al . Binomial nomenclature for virus species: a consultation. S. 519–525. Archives of Virology [online]. Springer Nature Switzerland AG, 3. prosinec 2019. Svazek 165, čís. 2, s. 519–525. Dostupné online. Dostupné také na: [6]. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-019-04477-6. PMID 31797129. (anglicky)
↑ International Committee on Taxonomy of Viruses, Virus Taxonomy: 2023 Release. Dostupné online (anglicky)
↑ ^a ^b ICTV Master Species List 2023 (MSL39). Verze 3, 21. červen 2024. Dostupné online (anglicky)
↑ SUTELA, Suvi; FORGIA, Marco; VAINIO, Eeva J; CHIAPELLO, Marco; DAGHINO, Stefania; VALLINO, Marta; MARTINO, Elena. The virome from a collection of endomycorrhizal fungi reveals new viral taxa with unprecedented genome organization. Virus Evolution [online]. 2020-07-01 [cit. 2024-05-02]. Roč. 6, čís. 2. Dostupné online. DOI 10.1093/ve/veaa076. PMID 33324490. (anglicky)
↑ CHONG, Li Chuin; LAUBER, Chris. Viroid-like RNA-dependent RNA polymerase-encoding ambiviruses are abundant in complex fungi. Frontiers in Microbiology [online]. 2023-05-12 [cit. 2024-05-02]. Roč. 14. Dostupné online. DOI 10.3389/fmicb.2023.1144003. PMID 37275138. (anglicky)
↑ ZHELUDEV, Ivan N.; EDGAR, Robert C.; LOPEZ-GALIANO, Maria Jose; DE LA PEÑA, Marcos; BABAIAN, Artem; BHATT, Ami S.; FIRE, Andrew Z. Viroid-like colonists of human microbiomes. bioRχiv [online]. Cold Spring Harbor Laboratory, 2024-01-21 [cit. 2024-01-29]. Preprint v1. Dostupné online. DOI 10.1101/2024.01.20.576352. (anglicky)
↑ PENNISI, Elizabeth. ‘It’s insane’: New viruslike entities found in human gut microbes. Science [online]. American Association for the Advancement of Science, 2024-01-26 [cit. 2024-01-29]. Online před tiskem. ISSN 0036-8075. DOI 10.1126/science.znxt3dk. (anglicky)
↑ MIHULKA, Stanislav. Podivuhodné RNA obelisky představují novou úroveň organismů. O.S.E.L. [online]. 2024-01-28 [cit. 2024-01-29]. Dostupné online. ISSN 1214-6307.
↑ International Committee on Taxonomy of Viruses, Pending Proposals Dostupné online Archivováno 25. 3. 2014 na Wayback Machine. (anglicky)
↑ ^a ^b GAÏA, Morgan; MENG, Lingjie; PELLETIER, Eric; FORTERRE, Patrick; VANNI, Chiara; FERNANDEZ-GUERRA, Antonio; JAILLON, Olivier. Mirusviruses link herpesviruses to giant viruses. S. 783–789. Nature [online]. 2023-04-27 [cit. 2023-06-13]. Roč. 616, čís. 7958, s. 783–789. Dostupné online. Dostupné také na: [7]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/s41586-023-05962-4. PMID 37076623. (anglicky)
↑ ^a ^b YIRKA, Bob. New types of viruses discovered that infect plankton in the world's oceans. Phys.Org [online]. Science X Network, 2023-04-21 [cit. 2023-06-13]. Dostupné online. (anglicky)
↑ ^a ^b CNRS. New viruses related to both giant viruses and herpesviruses. CNRS Press Area [online]. 2023-04-19 [cit. 2023-06-13]. Dostupné online. (anglicky)
↑ Adriaenssens E. M. et al.: Taxonomy Proposal 2021.001B.R.abolish_Caudovirales, říjen 2020. Dostupné online Archivováno 28. 3. 2022 na Wayback Machine. v souboru ICTV Approved Proposals: Bacterial Viruses Archivováno 28. 3. 2022 na Wayback Machine.
↑ RAMBO, Ian M.; LANGWIG, Marguerite V.; LEÃO, Pedro; ANDA, Valerie de; BAKER, Brett J. Genomes of six viruses that infect Asgard archaea from deep-sea sediments. S. 953–961. Nature Microbiology [online]. Springer Nature Limited, 27. červen 2022 [cit. 2022-07-01]. Svazek 7, čís. 7, s. 953–961. Dostupné online. preprint [8]. ISSN 2058-5276. DOI 10.1038/s41564-022-01150-8. PMID 35760837. (anglicky)
↑ ADRIAENSSENS, Evelien M.; EDWARDS, Rob; NASH, John H. E., MAHADEVAN, Padmanabhan; SETO, Donald; ACKERMANN, Hans-Wolfgang; LAVIGNE, Rob; KROPINSKI, Andrew M. Integration of genomic and proteomic analyses in the classification of the Siphoviridae family. S. 144–154. Virology [online]. 14. listopad 2014. Svazek 477, s. 144–154. Dostupné online. ISSN 0042-6822. DOI 10.1016/j.virol.2014.10.016. PMID 25466308. (anglicky)
↑ ^a ^b ^c MEDVEDEVA, Sofia; SUN, Jiarui; YUTIN, Natalya; KOONIN, Eugene V.; NUNOURA, Takuro; RINKE, Christian; KRUPOVIC, Mart. S. 962–973. Nature Microbiology [online]. Springer Nature Limited, 27. červen 2022 [cit. 2022-07-01]. Svazek 7, čís. 7, s. 962–973. Dostupné online. náhled [9]. preprint [10]. ISSN 2058-5276. DOI 10.1038/s41564-022-01144-6. PMID 35760839. (anglicky)
↑ GRONENBORN, Bruno; RANDLES, John W.; KNIERIM, Dennis; BARRIÈRE, Quentin; VETTEN, H. Josef; WARTHMANN, Norman; CORNU, David. Scientific Reports [online]. Macmillan Publishers Limited, 9. duben 2018. Svazek 8: 5698. Dostupné online. ISSN 2045-2322. DOI 10.1038/s41598-018-23739-y. (anglicky)
↑ POOJARI, Sudarsana; ALABI, Olufemi J.; FOFANOV, Viacheslav Y., NAIDU, Rayapati A. A Leafhopper-Transmissible DNA Virus with Novel Evolutionary Lineage in the Family Geminiviridae Implicated in Grapevine Redleaf Disease by Next-Generation Sequencing. S. 1–17. PLoS ONE [online]. 5. červen 2013. Svazek 8, čís. 6: e64194, s. 1–17. Dostupné online. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0064194. (anglicky)
↑ SHI, Mang; LIN, Xian-Dan; TIAN, Jun-Hua; CHEN, Liang-Jun; CHEN, Xiao; LI, Ci-Xiu; QIN, Xin-Cheng, LI, Jun; CAO, Jian-Ping; EDEN, John-Sebastian; BUCHMANN, Jan; WANG, Wen; XU, Jianguo; HOLMES, Edward C.; ZHANG, Yong-Zhen. Redefining the invertebrate RNA virosphere. Nature [online]. 23. listopad 2016 [cit. 2016-12-07]. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature20167. PMID 27880757. (anglicky)
↑ ^a ^b ^c ^d ^e ZAYED, Ahmed A.; SULLIVAN, Matthew, et al. (Tara Oceans Consortium). Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth's RNA virome. S. 156–162. Science [online]. American Association for the Advancement of Science, 2022-04-7 [cit. 2022-04-11]. Svazek 376, čís. 6589, s. 156–162. Abstrakt. Dostupné online. ISSN 0036-8075. DOI 10.1126/science.abm5847. PMID 35389782. (anglicky)
↑ ^a ^b ^c ^d URAYAMA, Syun-ichi; FUKUDOME, Akihito; HIRAI, Miho; OKUMURA, Tomoyo; NISHIMURA, Yosuke; TAKAKI, Yoshihiro; KUROSAWA, Norio. Double-stranded RNA sequencing reveals distinct riboviruses associated with thermoacidophilic bacteria from hot springs in Japan. Nature Microbiology [online]. Springer Nature Limited, 2024-01-17 [cit. 2024-01-29]. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 2058-5276. DOI 10.1038/s41564-023-01579-5. (anglicky)
↑ ^a ^b ^c ^d EDGAR, Robert. Known phyla dominate the Tara Oceans RNA virome. Virus Evolution [online]. Oxford University Press, 2023-11-15 [cit. 2024-08-13]. Roč. 9, čís. 2. Dostupné online. ISSN 2057-1577. DOI 10.1093/ve/vead063. PMID 38028147. (anglicky)
↑ ^a ^b ^c RETTNER, Rachael. Thousands of new viruses discovered in the ocean. Live Science [online]. Future US Inc., 2022-04-10 [cit. 2022-04-11]. Dostupné online. (anglicky)
↑ ^a ^b ^c KARLÍK, Tomáš. Vědci našli v oceánech přes pět tisíc druhů neznámých virů. Některé obsahují prastaré geny. Věda – ČT24 [online]. Česká televize, 2022-04-11 [cit. 2022-04-11]. Dostupné online.
↑ University of Tsukuba. Discovery of a third RNA virus lineage in extreme environments. Phys.Org [online]. 2024-01-26 [cit. 2024-01-29]. Dostupné online. (anglicky)
↑ GRYBCHUK, Danyil; AKOPYANTS, Natalia S.; KOSTYGOV, Alexei Y.; KONOVALOVAS, Aleksandras; LYE, Lon-Fye; DOBSON, Deborah E.; ZANGGER, Haroun, FASEL, Nicolas; BUTENKO, Anzhelika; FROLOV, Alexander O.; VOTÝPKA, Jan; d’AVILA-LEVY, Claudia M.; KULICH, Pavel; MORAVCOVÁ, Jana; PLEVKA, Pavel; ROGOZIN, Igor B.; SERVA, Saulius; LUKEŠ, Julius; BEVERLEY, Stephen M.; YURCHENKO, Vyacheslav. Viral discovery and diversity in trypanosomatid protozoa with a focus on relatives of the human parasite Leishmania. S. E506-E515. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 28. prosinec 2017. Svazek 115, čís. 3, s. E506-E515. Dostupné online. PDF [11]. Dále dostupné na: [12]. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1717806115. PMID 29284754. (anglicky)
↑ kar (ČTK). Ostrava má svůj virus. Podle vědců se OstraVirus nepodobá žádnému jinému na Zemi. Kapitola Všda. ČT24.cz [online]. Česká televize, 4. duben 2018. Dostupné online.
↑ ^a ^b LAUBER, Chris; SEITZ, Stefan; MATTEI, Simone; SUH, Alexander; BECK, Jürgen; HERSTEIN, Jennifer; BÖROLD, Jacob, SALZBURGER, Walter; KADERALI, Lars; BARTENSCHLAGER, Ralf; BRIGGS, John A. G. Deciphering the Origin and Evolution of Hepatitis B Viruses by Means of a Family of Non-enveloped Fish Viruses. S. 387–399.e6. Cell Host & Microbe [online]. Cell Press, Elsevier Inc., 31. srpen 2017. Svazek 22, čís. 3, s. 387–399.e6. Dostupné online. Dostupné také na: [13]. ISSN 1931-3128. DOI 10.1016/j.chom.2017.07.019. PMID 28867387. (anglicky)
↑ BORATTO, Paulo V. M.; OLIVEIRA, Graziele P.; MACHADO, Talita B.; ANDRADE, Ana Cláudia S. P.; BAUDOIN, Jean-Pierre; KLOSE, Thomas; SCHULZ, Frederik, CHABRIÈRE, Eric; COLSON, Philippe; LEVASSEUR, Anthony; La SCOLA, Bernard; ABRAHÃO, Jônatas S. A mysterious 80 nm amoeba virus with a near-complete “ORFan genome” challenges the classification of DNA viruses. bioRχiv [online]. Cold Spring Harbor Laboratory, 28. leden 2020. Preprint. Dostupné online. Dostupné také na: [14]. DOI 10.1101/2020.01.28.923185. (anglicky)
↑ COLSON, Philippe, a kol. “Megavirales”, a proposed new order for eukaryotic nucleocytoplasmic large DNA viruses. S. 2517–2521. Archives of Virology [online]. 29. červen 2013. Svazek 158, čís. 12, s. 2517–2521. Dostupné online. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-013-1768-6. PMID 23812617. (anglicky)
↑ FISCHER, Matthias G. Giant viruses come of age. S. 50–57. Current Opinion in Microbiology [online]. 19. březen 2016. Svazek 31, s. 50–57. Dostupné online. ISSN 1369-5274. DOI 10.1016/j.mib.2016.03.001. (anglicky)
↑ HALARY, S.; TEMMAM, S.; RAOULT, D.; DESNUES, C. Viral metagenomics: are we missing the giants?. S. 34–43. Current Opinion in Microbiology [online]. 19. březen 2016. Svazek 31, s. 34–43. Dostupné online. ISSN 1369-5274. DOI 10.1016/j.mib.2016.01.005. (anglicky)
↑ SCHULZ, Frederik; ROUX, Simon; PAEZ-ESPINO, David, et al . Giant virus diversity and host interactions through global metagenomics. S. 432–436. Nature [online]. Springer Nature Limited, 22. leden 2020. Svazek 578, čís. 7795, s. 432–436. Dostupné online. Dostupné také na: [15]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/s41586-020-1957-x. (anglicky)
↑ ^a ^b YOSHIKAWA, Genki; BLANC-MATHIEU, Romain; SONG, Chihong; KAYAMA, Yoko; MOCHIZUKI, Tomohiro; MURATA, Kazuyoshi; OGATA, Hiroyuki, TAKEMURA, Masaharu. Medusavirus, a novel large DNA virus discovered from hot spring water. Journal of Virology [online]. American Society for Microbiology, 6. únor 2019 [cit. 2019-02-26]. Svazek 93, čís. 8: e02130-18. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2019-02-27. Dostupné také na: [16]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.02130-18. PMID 30728258. (anglicky)
↑ MIHULKA, Stanislav. Veliký Medusavirus promění bezbranné améby v kámen. OSEL.cz [online]. 25. únor 2019. Dostupné online. ISSN 1214-6307.
↑ LEGENDRE, Matthieu; LARTIGUE, Audrey; BERTAUX, Lionel; JEUDY, Sandra; BARTOLI, Julia; LESCOT, Magali; ALEMPIC, Jean-Marie, RAMUS, Claire; BRULEY, Christophe; LABADIE, Karine; SHMAKOVA, Lyubov; RIVKINA, Elizaveta; COUTÉ, Yohann; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel. In-depth study of Mollivirus sibericum, a new 30,000-y-old giant virus infecting Acanthamoeba. S. E5327–E5335. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 8. září 2015. Svazek 112, čís. 38, s. E5327–E5335. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1510795112. PMID 26351664. (anglicky)
↑ ^a ^b YUTIN, Natalya; KOONIN, Eugene V. Pandoraviruses are highly derived phycodnaviruses. S. 1–8. Biology Direct [online]. 23. říjen 2013. Svazek 8, čís. 25, s. 1–8. Dostupné online. PDF [17]. DOI 10.1186/1745-6150-8-25. (anglicky)
↑ ^a ^b PHILIPPE, Nadège, et al. Pandoraviruses: Amoeba Viruses with Genomes Up to 2.5 Mb Reaching That of Parasitic Eukaryotes. S. 281–286. Science [online]. 19. červenec 2013. Svazek 341, čís. 6143, s. 281–286. Dostupné online. ISSN 1095-9203. DOI 10.1126/science.1239181. (anglicky)
↑ ^a ^b MIHULKA, Stanislav: Mimiviry jsou out, teď vládnou pandoraviry! O.S.E.L., 20. červenec 2013. Dostupné online
↑ ^a ^b ^c ^d ^e SCHULZ, Frederik; YUTIN, Natalya; IVANOVA, Natalia N.; ORTEGA, Davi R.; LEE, Tae Kwon; VIERHEILIG, Julia; DAIMS, Holger, HORN, Matthias; WAGNER, Michael; JENSEN, Grant J.; KYRPIDES, Nikos C.; KOONIN, Eugene V.; WOYKE, Tanja. Giant viruses with an expanded complement of translation system components. S. 82–85. Science [online]. 7. duben 2017. Svazek 356, čís. 6333, s. 82–85. Dostupné online. ISSN 1095-9203. DOI 10.1126/science.aal4657. PMID 28386012. (anglicky)
↑ ARTHOFER, Patrick; PANHÖLZL, Florian; DELAFONT, Vincent; HAY, Alban; REIPERT, Siegfried; CYRAN, Norbert; WIENKOOP, Stefanie. A giant virus infecting the amoeboflagellate Naegleria. Nature Communications [online]. 2024-04-24. Roč. 15, čís. 1. Dostupné online. Dostupné také na: [18]. ISSN 2041-1723. DOI 10.1038/s41467-024-47308-2. PMID 38658525. (anglicky)
↑ ARSLAN, Defne, et al. Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae. S. 17486–17491. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 18. říjen 2011. Svazek 108, čís. 42, s. 17486–17491. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1110889108. (anglicky)
↑ DESNUES, Christelle; LA SCOLA, Bernard; YUTIN, Natalya, FOURNOUS, Ghislain; ROBERT, Catherine; AZZA, Saïd; JARDOT, Priscilla; MONTEIL, Sonia; CAMPOCASSO, Angélique; KOONIN, Eugene V.; RAOULT, Didier. Provirophages and transpovirons as the diverse mobilome of giant viruses. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 15. říjen 2012. Online před tiskem. Dostupné online. DOI 10.1073/pnas.1208835109. (anglicky)
↑ ^a ^b RODRIGUES, Rodrigo Araújo Lima; MOUGARI, Said; COLSON, Phillipe; LA SCOLA, Bernard; ABRAHÃO, Jônatas Santos. “ Tupanvirus”, a new genus in the family Mimiviridae. S. 325–331. Archives of Virology [online]. Springer Nature Switzerland AG, 5. říjen 2018. Svazek 164, čís. 1, s. 325–331. Dostupné online. Dostupné také na: [19]. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-018-4067-4. PMID 30291500. (anglicky)
↑ YOOSUF, Niyaz, et al. Related Giant Viruses in Distant Locations and Different Habitats: Acanthamoeba polyphaga moumouvirus Represents a Third Lineage of the Mimiviridae That Is Close to the Megavirus Lineage. S. 1324–1330. Genome Biol. Evol. [online]. 4. prosinec 2012. Svazek 4, čís. 12, s. 1324–1330. ISSN 1759-6653. DOI 10.1093/gbe/evs109. (anglicky)
↑ ABRAHÃO, Jônatas; SILVA, Lorena; SANTOS SILVA, Ludmila; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; RODRIGUES, Rodrigo; ARANTES, Thalita; ASSIS, Felipe, BORATTO, Paulo; ANDRADE, Miguel; GEESSIEN KROON, Erna; RIBEIRO, Bergmann; BERGIER, Ivan; SELIGMANN, Herve; GHIGO, Eric; COLSON, Philippe; LEVASSEUR, Anthony KROEMER, ; Guido; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Tailed giant Tupanvirus possesses the most complete translational apparatus of the known virosphere. Nature Communications [online]. Macmillan Publishers Limited, 27. únor 2018. Svazek 9: 749. Dostupné online. ISSN 2041-1723. DOI 10.1038/s41467-018-03168-1. (anglicky)
↑ ANDREANI, Julien; AHERFI, Sarah; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; DI PINTO, Fabrizio; BITAM, Idir; RAOULT, Didier; COLSON, Philippe, La SCOLA, Bernard. Cedratvirus, a Double-Cork Structured Giant Virus, is a Distant Relative of Pithoviruses. S. 1–11. Viruses [online]. MDPI AG, 3. listopad 2016. Svazek 8, čís. 11: 300, s. 1–11. Dostupné online. Dostupné také na: [20]. ISSN 1999-4915. DOI 10.3390/v8110300. PMID 27827884. (anglicky)
↑ ANDREANI, Julien; KHALIL, Jacques Y. B.; BAPTISTE, Emeline; HASNI, Issam; MICHELLE, Caroline; RAOULT, Didier; LEVASSEUR, Anthony. Orpheovirus IHUMI-LCC2: A New Virus among the Giant Viruses. Frontiers in Microbiology [online]. Frontiers Media SA, 22. leden 2018. Roč. 8: 2643. Dostupné online. Dostupné také na: [21]. Dále dostupné na: [22]. ISSN 1664-302X. DOI 10.3389/fmicb.2017.02643. PMID 29403444. (anglicky)
↑ ^a ^b LEGENDRE, Matthieu; BARTOLI, Julia; SHMAKOVA, Lyubov, JEUDY, Sandra; LABADIE, Karine; ADRAIT, Annie; LESCOT, Magali; POIROT, Olivier; BERTAUX, Lionel; BRULEY, Christophe; COUTÉ, Yohann; RIVKINA, Elizaveta; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel. Thirty-thousand-year-old distant relative of giant icosahedral DNA viruses with a pandoravirus morphology. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 3. březen 2014. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1320670111. (anglicky)
↑ YONG, Ed. Giant virus resurrected from 30,000-year-old ice. Nature News [online]. 3. březen 2014. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature.2014.14801. (anglicky)
↑ Vědci oživili 30 tisíc let starý virus z ledu. Týden [online]. 4. březen 2014. Dostupné online.
↑ RETENO, Dorine Gaëlle I.; BENAMAR, Samia; KHALIL, Jacques Bou; ANDREANI, Julien; ARMSTRONG, Nicholas; KLOSE, Thomas; ROSSMANN, Michael, COLSON, Philippe; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Faustovirus, an Asfarvirus-Related New Lineage of Giant Viruses Infecting Amoebae. S. 6585–6594. Journal of Virology [online]. 15. duben 2015 [cit. 2016-12-01]. Svazek 89, čís. 13, s. 6585–6594. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2016-03-20. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00115-15. (anglicky)
↑ BENAMAR, Samia; RETENO, Dorine Gaëlle I.; BANDALY, Victor; LABAS, Noémie; RAOULT, Didier; LA SCOLA, Bernard. Faustoviruses: Comparative Genomics of New Megavirales Family Members. S. 1–9. Frontiers in Microbiology [online]. 5. únor 2016. Svazek 7, čís. 3, s. 1–9. Dostupné online. Dostupné také na: [23]. DOI 10.3389/fmicb.2016.00003. (anglicky)
↑ BAJRAI, Leena H.; BENAMAR, Samia; AZHAR, Esam I.; ROBERT, Catherine; LEVASSEUR, Anthony; RAOULT, Didier; LA SCOLA, Bernard. Kaumoebavirus, a New Virus That Clusters with Faustoviruses and Asfarviridae. S. 1–10. Viruses [online]. MDPI AG, 28. říjen 2016. Svazek 8, čís. 11: 278, s. 1–10. Dostupné online. Dostupné také na: [24]. ISSN 1999-4915. DOI 10.3390/v8110278. PMID 27801826. (anglicky)
↑ ANDREANI, Julien; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; SEVVANA, Madhumati; BENAMAR, Samia; DI PINTO, Fabrizio; BITAM, Idir; COLSON, Philippe, KLOSE, Thomas; ROSSMANN, Michael G.; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Pacmanvirus, a new giant icosahedral virus at the crossroads between Asfarviridae and faustoviruses. S. 1–11. Journal of Virology [online]. American Society for Microbiology, 26. červen 2017 [cit. 2019-02-26]. Svazek 91, čís. 14: e00212-17, s. 1–11. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2019-02-27. Dostupné také na: [25]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00212-17. PMID 28446673. (anglicky)
↑ PAEZ-ESPINO, David; ZHOU, Jinglie; ROUX, Simon, et al . Diversity, evolution, and classification of virophages uncovered through global metagenomics. Microbiome [online]. BioMed Central Ltd, 10. prosinec 2019. Svazek 7, čís. 1: 157. Dostupné online. Dostupné také na: [26]. ISSN 2049-2618. DOI 10.1186/s40168-019-0768-5. PMID 31823797. (anglicky)
↑ KAUFFMAN, Kathryn M.; HUSSAIN, Fatima A.; YANG, Joy; AREVALO, Philip; BROWN, Julia M.; CHANG, William K.; VANINSBERGHE, David, ELSHERBINI, Joseph; SHARMA, Radhey S.; CUTLER, Michael B.; KELLY, Libusha; POLZ, Martin F. A major lineage of non-tailed dsDNA viruses as unrecognized killers of marine bacteria. Kapitola Letters. Nature [online]. Macmillan Publishers Limited, 24. leden 2018. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature25474. (anglicky)
↑ IGNACIO-ESPINOZA, Julio Cesar; FUHRMAN, Jed A. A non-tailed twist in the viral tale. S. 38–39. Nature [online]. Macmillan Publishers Limited, 24. leden 2018. Svazek 554, čís. 7690, s. 38–39. Dostupné online. Dostupné také na: [27]. Dále dostupné na: [28]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/d41586-018-00923-8. PMID 29388959. (anglicky)
↑ MIHULKA, Stanislav. Nově objevené viry jsou lstiví zabijáci bakterií. OSEL.cz [online]. 27. leden 2018. Dostupné online. ISSN 1214-6307.
↑ NG, Terry Fei Fan; MANIRE, Charles; BORROWMAN, Kelly, LANGER, Tammy; EHRHART, Llewellyn; BREITBART, Mya. Discovery of a Novel Single-Stranded DNA Virus from a Sea Turtle Fibropapilloma by Using Viral Metagenomics. S. 2500–2509. Journal of Virology [online]. 30. prosinec 2008 [cit. 2020-05-11]. Svazek 83, čís. 6, s. 2500–2509. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2020-06-23. Dostupné také na: [29]. Dále dostupné na: [30]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.01946-08. PMID 19116258. (anglicky)
↑ KOONIN, Eugene V.; YUTIN, Natalya. Chapter Five - Evolution of the Large Nucleocytoplasmic DNA Viruses of Eukaryotes and Convergent Origins of Viral Gigantism. S. 167–202. Advances in Virus Research [online]. Elsevier Inc., 2018-11-10. Svazek 103, s. 167–202. Dostupné online. ISSN 0065-3527. DOI 10.1016/bs.aivir.2018.09.002. (anglicky)
↑ KOONIN, Eugene V.; DOLJA, Valerian V.; KRUPOVIC, Mart. Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. S. 2–25. Virology [online]. Elsevier Inc., 2015-03-12. Svazek 479–480, s. 2–25. Dostupné online. ISSN 0042-6822. DOI 10.1016/j.virol.2015.02.039. (anglicky)
↑ BALTIMORE, D. Expression of animal virus genomes. Bacteriol Rev.. 1971, roč. 35, čís. 3, s. 235–41. Dostupné online. ISSN 0005-3678.
↑ RACANIELLO, Vincent. Simplifying virus classification: The Baltimore system [online]. Virology Blog, 2009. Dostupné online.
↑ KRUPOVIC, Mart; DOLJA, Valerian V.; KOONIN, Eugene V. Plant viruses of the Amalgaviridae family evolved via recombination between viruses with double-stranded and negative-strand RNA genomes. S. 1–7. Biology Direct [online]. 29. březen 2015. Svazek 10, čís. 12, s. 1–7. Dostupné online. PDF [31]. DOI 10.1186/s13062-015-0047-8. (anglicky)
↑ BAMFORD, Dennis H.; PIETILÄ, Maija K.; ROINE, Elina; ATANASOVA, Nina S.; DIENSTBIER, Ana; OKSANEN, Hanna M., a ICTV Report Consortium. The Online (10th) Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses [online]. 10. vyd. 2017-09-20, rev. 2017-09-21. Kapitola Pleolipoviridae. (anglicky)
↑ Turina M. et al.: Taxonomy Proposal 2021.001F.R.Fusariviridae_1newfam, říjen 2020. Dostupné online Archivováno 28. 3. 2022 na Wayback Machine. v souboru ICTV Approved Proposals: Fungal and Protist Viruses
↑ Bunyaviridae Study Group: Create a new order, Bunyavirales, to accommodate nine families (eight new, one renamed) comprising thirteen genera. Proposal to ICTV, Nr. 2016.030a-vM, 2016. Dostupné online Archivováno 2. 12. 2016 na Wayback Machine. (anglicky)
↑ LWOFF, André; HORNE, R. W.; TOURNIER, P. A system of viruses. S. 51–55. Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. [online]. 1962. Svazek 27, s. 51–55. PMID 13931895. (anglicky)

Literatura

HADIDI, Ahmed a RANDLES, John W. Viroids, and the Legacy of Ricardo Flores (1947–2020). Cells. 2021, vol. 10, no. 10, s. 2570. (Vydáno v rámci Special Issue Celebrating 50 Years of Viroid Discovery; 2021-09-28.)
LHOTSKÝ, Josef. Úvod do studia symbiotických interakcí mikroorganismů: nový pohled na viry a bakterie. 1. vyd. Praha: Academia, 2015. 207 s. Průhledy, sv. 13. ISBN 978-80-200-2480-0.
OWENS, Robert A. a HADIDI, Ahmed. The Remarkable Legacy of Theodor O. Diener (1921–2023): Preeminent Plant Pathologist and the Discoverer of Viroids. Viruses. 2023, vol. 15, no. 9, s. 1895. (Vydáno v rámci Special Issue Viroids and Satellites and Their Vector Interactions, dedicated to the memory of Theodor O. Diener who discovered viroids; 2023-09-08.)

Související články

Externí odkazy

Obrázky, zvuky či videa k tématu Klasifikace virů na Wikimedia Commons
(anglicky) ViralZone – podrobný přehled virů s popisy a schematickými obrázky kapsid
o Ricardovi Floresovi
o Theodoru Ottovi Dienerovi

[2] Viriformy jsou operativně definovány jako typ přenosných genetických prvků (MGE, z angl. mobile genetic element) odvozených z viru, které byly jejich organickými (buněčnými) hostiteli exapovány, aby plnily funkce důležité pro životní cyklus hostitele, včetně těch přenosných genetických elementů, které jsou v průběhu evoluce od takových entit odvozeny.^[1]

[realm-11] Český ekvivalent anglického realm není dosud ustálen. Někdy se překládá jako doména^[4], tou je však zpravidla míněn taxon, anglicky zvaný domain. Takto míněná doména je však ve vztahu k virům používána výjimečně a nemá jednoznačné vymezení: buď zahrnuje všechny viry, nebo se používá jen na skupinu velkých jaderně-cytoplazmatických DNA virů (NCLDV), pro které jedna z hypotéz předpokládá, že jsou reliktem samostatné linie, tzv. čtvrté domény buněčných organismů, které svou stavbou připomínají a jejichž redukcí vznikly.^[5]^[6]^[7] Vzájemné vztahy NCLDV a buněčných organismů jsou však komplexnější.^[8] I sám ICTV ve svém „Prohlášení o shodě“ na hierarchii nových úrovních taxonomie virů^[9] uvádí, že nejvyšší taxon je pojmenován realm, na rozdíl od domény v jiných taxonomiích, aby byl reflektován komplexní vzájemný vztah taxonomie virů vzhledem k jejich protějškům u buněčných organismů.

[15] Zvláštní realm Ribozyviria byl vzhledem k odlišnosti stavby virionu i virovému genomu vytvořen pro dlouho známý rod Deltavirus s kruhovou ssRNA, tradičně pojmenovaný a klasifikovaný jako virus, i když jde o satelitní virus a tedy v některých systémech řazený jako subvirová částice, a jemu podobné nově popsané rody satelitních virů

[21] Jako obelisky se označují viroidům podobné entity kolonizujících bakterie lidského zažívacího traktu, představující neobalené genomy s kruhovou RNA, která je větší a na rozdíl od viroidů obsahuje i sekvence kódující proteiny dosud neznámé rodiny („obliny“), některé z nich i se signaturou ribozymů replikačního mechanismu podobného viroidům, nikoli však proteiny pro virový obal.^[15]^[16]^[17]

[23] tedy nikoli dle české abecedy (jména začínající ch jsou řazena mezi jmény začínajícími c mezi cg a ci) ani dle alfabety (např. jména začínající gamma nenásledují po beta, ale jsou řazena až po delta, epsilon a eta)

[28] Většina nezařazených podčeledí a rodů byla dříve řazena do řádu Caudovirales, čeledí Myoviridae, Podoviridae a Siphoviridae, dnes již zrušených.^[22]

[30] Do třídy Caudoviricetes pravděpodobně náleží i nově objevené nekultivované archeální viry (dosud neuznané jako rody) Fenrir a Sköll (infikují Lokiarchaeota), Ratatoskr a Nidhogg (infikují Helarchaeota) a Vedfolnir (infikuje Thorarchaeota).^[23]

[34] Dříve navrhováno zařazení do řádu Geplafuvirales, neuznané čeledi Naminiviridae^[26]

[39] Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových fylogeneticky odlišných linií, které neodpovídají stávajícím klasifikačním schématům; lze proto očekávat vytváření nejen nových taxonů na úrovni čeledí a rodů, ale i možné hlubší změny v obsahu vyšších taxonů a topologii jejich fylogenetických stromů^[28]^[29]^[30]

[43] Předpokládaná významnost zastoupení v oceánech byla významně snížena, což může vyústit v ponížení taxonomické úrovně a zrušení navrhovaného kmene.^[31]

[45] Vzhledem k výraznější odlišnosti, představující mezipolohu mezi říšemi Orthornavirae and Pararnavirae, může tento kmen představovat skupinu nové, dosud nepopsané samostatné říše RNA virů.^[30]

[48] Průkaznost je zatím nedostatečná pro uznání jako nového kmene; možná bude začleněno jako součást nového kmene společného i pro neuznaný kmen Wamoviricota, nebo jako součást rozšířeného kmene Kitrinoviricota.^[31]

[49] Průkaznost je zatím nedostatečná pro uznání jako nového kmene. Většina spadá do Duplornaviricota; zbytek možná bude začleněn jako součást nového kmene společného i pro neuznaný kmen Paraxenoviricota, nebo jako součást rozšířeného kmene Kitrinoviricota.^[31]

[55] Dříve používané názvy pro skupinu téhož vymezení: „NCLDV group“, „Megavirales“ (před zavedením taxonů vyšších než řád, proto s příponou řádu)^[7]^[39]^[40]^[41]

[57] Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových kladů na úrovni podčeledí či rodů, dosud neuznaných jako samostatné taxony^[42]

[71] Dříve používaný název pro skupinu téhož vymezení: „superklad MAPI“^[8]

[82] Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových kladů na úrovni rodů, dosud neuznaných jako samostatné taxony^[65]

[Koonin_2015,2019-89] Čeleď Polydnaviriformidae, dříve nazývaná Polydnaviridae, a čeledi třídy Naldaviricetes (Baculoviridae, Hytrosaviridae, Nimoviridae a Nudiviridae) sdílejí část genů s viry kmene Nucleocytoviricota (realm Varidnaviria), což může naznačovat jejich společnou příslušnost k vyššímu, dosud nezavedenému taxonu.^[70] ^[71]

[93] Např. III. skupina (dsRNA viry) je považována za polyfyletickou, k ní patřící čeleď Amalgaviridae dokonce s velkou pravděpodobností vznikla rekombinací RNA virů dvou různých skupin Baltimorovy klasifikace.^[74]

[Pleolipoviridae-94] Viry z čeleď Pleolipoviridae, řazené tradičně do skupiny II, tedy ssDNA virů, mohou mít ve skutečnosti genom různého druhu; Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1 (HHPV-1) typu má např. kruhovou dsDNA, His2 virus lineární dsDNA, Halorunbrum pleomorphic virus 3 (HRPV-3) a Halogeometricum pleomorphic virus 1 (HGPV-1) mají v dsDNA úseky ssDNA.^[75]

[Bunyavirales2-95] Viry z rodů Coguvirus, Entovirus, Lentinuvirus, Orthotospovirus, Reptarenavirus, jakož i některé viry z rodu Antennavirus, Bandavirus, Hartmanivirus, Mammarenavirus, Phlebovirus, Rubodvirus, Tenuivirus a Uukuvirus obsahují ve svém genomu vedle ssRNA s negativní polaritou i ssRNA s pozitivní polaritou, ale tradičně i podle fylogenetické příbuznosti se řadí do Baltimorovy skupiny V.^[77]^[12]

[Ortervirales_pozn-96] Do řádu Ortervilales spadá vedle Baltimorovy skupiny VI. i čeleď Caulimoviridae ze skupiny VII.

[dsRNA_lifestyle-99] Viry z čeledí Fusariviridae a Hypoviridae vytvářejí ve svém životním cyklu i dsRNA a nejsou tak typickými představiteli skupiny IV. Baltimorovy klasifikace. Označují se jako „ssRNA viry s životním stylem dsRNA“^[76]

[Code-1] The International Code of Virus Classification and Nomenclature. Odstavce 3.3, 3.21, 3.24, 3.26, 3.27, 3.28. ICTV, březen 2021. Dostupné online (anglicky)

[Flores_1998-3] FLORES, R.; RANDLES, J. W.; BAR-JOSEPH, M., DIENER, T. O. A proposed scheme for viroid classification and nomenclature. S. 623–629. Arch Virol. [online]. 1998. Svazek 143, s. 623–629. (anglicky)

[Diener_2001-4] DIENER, T. O. The viroid: biological oddity or evolutionary fossil?. S. 137–184. Adv Virus Res. [online]. 2001. Svazek 57, s. 137–184. (anglicky)

[Forstová_2019-5] FORSTOVÁ, Jitka; FRAIBERK, Martin. Diverzita virů. S. 212–215. Živa [online]. Academia, 17. říjen 2019. Roč. 2019, čís. 5, s. 212–215. Dostupné online. ISSN 0044-4812.

[Boyer_2010-6] BOYER, Mickaël; MADOUI, Mohammed-Amine; GIMENEZ, Gregory, Bernard La Scola, Didier Raoult. Phylogenetic and Phyletic Studies of Informational Genes in Genomes Highlight Existence of a 4th Domain of Life Including Giant Viruses. E15530. PLoS One [online]. 2. prosinec 2010 [cit. 2011-05-03]. Svazek 5, čís. 12. Dostupné online. PDF [1]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0015530. (anglicky)

[Colson_2011-7] COLSON, Philippe; GIMENEZ, Gregory; BOYER, Mickaël, Ghislain Fournous, Didier Raoult. The Giant Cafeteria roenbergensis Virus That Infects a Widespread Marine Phagocytic Protist Is a New Member of the Fourth Domain of Life. E18935. PLoS One [online]. 29. duben 2011 [cit. 2011-05-03]. Svazek 6, čís. 4. Dostupné online. PDF [2]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0018935. (anglicky)

[Colson_2012-8] COLSON, Philippe; LAMBALLERIE, Xavier de; FOURNOUS, Ghislain; RAOULT, Didier. Reclassification of Giant Viruses Composing a Fourth Domain of Life in the New Order Megavirales. S. 321–332. Intervirology [online]. S. Karger AG, 14. duben 2012. Svazek 55, čís. 5, s. 321–332. Dostupné online. ISSN 1423-0100. DOI 10.1159/000336562. PMID 22508375. (anglicky)

[Guglielmini_2019-9] GUGLIELMINI, Julien; WOO, Anthony C.; KRUPOVIC, Mart; FORTERRE, Patrick; GAIA, Morgan. Diversification of giant and large eukaryotic dsDNA viruses predated the origin of modern eukaryotes. S. 19 585 – 19 592. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. National Academy of Sciences, 10. září 2019. Svazek 116, čís. 39, s. 19 585 – 19 592. Dostupné online. Dostupné také na: [3]. preprint [4]. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1912006116. PMID 31506349. (anglicky)

[Gorbalenya_2020-10] GORBALENYA, Alexander E.; KRUPOVIC, Mart; MUSHEGIAN, Arcady, et al . (International Committee on Taxonomy of Viruses Executive Committee). The new scope of virus taxonomy: partitioning the virosphere into 15 hierarchical ranks. S. 668–674. Nature Microbiology [online]. Springer Nature Limited, 27. duben 2020. Svazek 5, čís. 5, s. 668–674. Dostupné online. Dostupné také na: [5]. ISSN 2058-5276. DOI 10.1038/s41564-020-0709-x. (anglicky)

[Siddell_2020-12] SIDDELL, Stuart G.; WALKER, Peter J.; LEFKOWITZ, Elliot J., et al . Binomial nomenclature for virus species: a consultation. S. 519–525. Archives of Virology [online]. Springer Nature Switzerland AG, 3. prosinec 2019. Svazek 165, čís. 2, s. 519–525. Dostupné online. Dostupné také na: [6]. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-019-04477-6. PMID 31797129. (anglicky)

[ICTV_2023-13] International Committee on Taxonomy of Viruses, Virus Taxonomy: 2023 Release. Dostupné online (anglicky)

[Species_2023-14] ICTV Master Species List 2023 (MSL39). Verze 3, 21. červen 2024. Dostupné online (anglicky)

[Sutela_2020-16] SUTELA, Suvi; FORGIA, Marco; VAINIO, Eeva J; CHIAPELLO, Marco; DAGHINO, Stefania; VALLINO, Marta; MARTINO, Elena. The virome from a collection of endomycorrhizal fungi reveals new viral taxa with unprecedented genome organization. Virus Evolution [online]. 2020-07-01 [cit. 2024-05-02]. Roč. 6, čís. 2. Dostupné online. DOI 10.1093/ve/veaa076. PMID 33324490. (anglicky)

[Chong_2023-17] CHONG, Li Chuin; LAUBER, Chris. Viroid-like RNA-dependent RNA polymerase-encoding ambiviruses are abundant in complex fungi. Frontiers in Microbiology [online]. 2023-05-12 [cit. 2024-05-02]. Roč. 14. Dostupné online. DOI 10.3389/fmicb.2023.1144003. PMID 37275138. (anglicky)

[Zheludev_2024-18] ZHELUDEV, Ivan N.; EDGAR, Robert C.; LOPEZ-GALIANO, Maria Jose; DE LA PEÑA, Marcos; BABAIAN, Artem; BHATT, Ami S.; FIRE, Andrew Z. Viroid-like colonists of human microbiomes. bioRχiv [online]. Cold Spring Harbor Laboratory, 2024-01-21 [cit. 2024-01-29]. Preprint v1. Dostupné online. DOI 10.1101/2024.01.20.576352. (anglicky)

[Pennisi_2024-19] PENNISI, Elizabeth. ‘It’s insane’: New viruslike entities found in human gut microbes. Science [online]. American Association for the Advancement of Science, 2024-01-26 [cit. 2024-01-29]. Online před tiskem. ISSN 0036-8075. DOI 10.1126/science.znxt3dk. (anglicky)

[Mihulka_2024-20] MIHULKA, Stanislav. Podivuhodné RNA obelisky představují novou úroveň organismů. O.S.E.L. [online]. 2024-01-28 [cit. 2024-01-29]. Dostupné online. ISSN 1214-6307.

[pending-22] International Committee on Taxonomy of Viruses, Pending Proposals Dostupné online Archivováno 25. 3. 2014 na Wayback Machine. (anglicky)

[Gaïa_2023-24] GAÏA, Morgan; MENG, Lingjie; PELLETIER, Eric; FORTERRE, Patrick; VANNI, Chiara; FERNANDEZ-GUERRA, Antonio; JAILLON, Olivier. Mirusviruses link herpesviruses to giant viruses. S. 783–789. Nature [online]. 2023-04-27 [cit. 2023-06-13]. Roč. 616, čís. 7958, s. 783–789. Dostupné online. Dostupné také na: [7]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/s41586-023-05962-4. PMID 37076623. (anglicky)

[Yirka_2023-25] YIRKA, Bob. New types of viruses discovered that infect plankton in the world's oceans. Phys.Org [online]. Science X Network, 2023-04-21 [cit. 2023-06-13]. Dostupné online. (anglicky)

[CNRS_2023-26] CNRS. New viruses related to both giant viruses and herpesviruses. CNRS Press Area [online]. 2023-04-19 [cit. 2023-06-13]. Dostupné online. (anglicky)

[Adriaenssens_2020-27] Adriaenssens E. M. et al.: Taxonomy Proposal 2021.001B.R.abolish_Caudovirales, říjen 2020. Dostupné online Archivováno 28. 3. 2022 na Wayback Machine. v souboru ICTV Approved Proposals: Bacterial Viruses Archivováno 28. 3. 2022 na Wayback Machine.

[Rambo_2022-29] RAMBO, Ian M.; LANGWIG, Marguerite V.; LEÃO, Pedro; ANDA, Valerie de; BAKER, Brett J. Genomes of six viruses that infect Asgard archaea from deep-sea sediments. S. 953–961. Nature Microbiology [online]. Springer Nature Limited, 27. červen 2022 [cit. 2022-07-01]. Svazek 7, čís. 7, s. 953–961. Dostupné online. preprint [8]. ISSN 2058-5276. DOI 10.1038/s41564-022-01150-8. PMID 35760837. (anglicky)

[Adriaenssens_2015-31] ADRIAENSSENS, Evelien M.; EDWARDS, Rob; NASH, John H. E., MAHADEVAN, Padmanabhan; SETO, Donald; ACKERMANN, Hans-Wolfgang; LAVIGNE, Rob; KROPINSKI, Andrew M. Integration of genomic and proteomic analyses in the classification of the Siphoviridae family. S. 144–154. Virology [online]. 14. listopad 2014. Svazek 477, s. 144–154. Dostupné online. ISSN 0042-6822. DOI 10.1016/j.virol.2014.10.016. PMID 25466308. (anglicky)

[Medvedeva_2022-32] MEDVEDEVA, Sofia; SUN, Jiarui; YUTIN, Natalya; KOONIN, Eugene V.; NUNOURA, Takuro; RINKE, Christian; KRUPOVIC, Mart. S. 962–973. Nature Microbiology [online]. Springer Nature Limited, 27. červen 2022 [cit. 2022-07-01]. Svazek 7, čís. 7, s. 962–973. Dostupné online. náhled [9]. preprint [10]. ISSN 2058-5276. DOI 10.1038/s41564-022-01144-6. PMID 35760839. (anglicky)

[Cofodevirus-33] GRONENBORN, Bruno; RANDLES, John W.; KNIERIM, Dennis; BARRIÈRE, Quentin; VETTEN, H. Josef; WARTHMANN, Norman; CORNU, David. Scientific Reports [online]. Macmillan Publishers Limited, 9. duben 2018. Svazek 8: 5698. Dostupné online. ISSN 2045-2322. DOI 10.1038/s41598-018-23739-y. (anglicky)

[Poojari_2013-35] POOJARI, Sudarsana; ALABI, Olufemi J.; FOFANOV, Viacheslav Y., NAIDU, Rayapati A. A Leafhopper-Transmissible DNA Virus with Novel Evolutionary Lineage in the Family Geminiviridae Implicated in Grapevine Redleaf Disease by Next-Generation Sequencing. S. 1–17. PLoS ONE [online]. 5. červen 2013. Svazek 8, čís. 6: e64194, s. 1–17. Dostupné online. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0064194. (anglicky)

[Shi_2016-36] SHI, Mang; LIN, Xian-Dan; TIAN, Jun-Hua; CHEN, Liang-Jun; CHEN, Xiao; LI, Ci-Xiu; QIN, Xin-Cheng, LI, Jun; CAO, Jian-Ping; EDEN, John-Sebastian; BUCHMANN, Jan; WANG, Wen; XU, Jianguo; HOLMES, Edward C.; ZHANG, Yong-Zhen. Redefining the invertebrate RNA virosphere. Nature [online]. 23. listopad 2016 [cit. 2016-12-07]. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature20167. PMID 27880757. (anglicky)

[Zayed_2022-37] ZAYED, Ahmed A.; SULLIVAN, Matthew, et al. (Tara Oceans Consortium). Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth's RNA virome. S. 156–162. Science [online]. American Association for the Advancement of Science, 2022-04-7 [cit. 2022-04-11]. Svazek 376, čís. 6589, s. 156–162. Abstrakt. Dostupné online. ISSN 0036-8075. DOI 10.1126/science.abm5847. PMID 35389782. (anglicky)

[Urayama_2024-38] URAYAMA, Syun-ichi; FUKUDOME, Akihito; HIRAI, Miho; OKUMURA, Tomoyo; NISHIMURA, Yosuke; TAKAKI, Yoshihiro; KUROSAWA, Norio. Double-stranded RNA sequencing reveals distinct riboviruses associated with thermoacidophilic bacteria from hot springs in Japan. Nature Microbiology [online]. Springer Nature Limited, 2024-01-17 [cit. 2024-01-29]. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 2058-5276. DOI 10.1038/s41564-023-01579-5. (anglicky)

[Edgar_2023-40] EDGAR, Robert. Known phyla dominate the Tara Oceans RNA virome. Virus Evolution [online]. Oxford University Press, 2023-11-15 [cit. 2024-08-13]. Roč. 9, čís. 2. Dostupné online. ISSN 2057-1577. DOI 10.1093/ve/vead063. PMID 38028147. (anglicky)

[Rettner_2022-41] RETTNER, Rachael. Thousands of new viruses discovered in the ocean. Live Science [online]. Future US Inc., 2022-04-10 [cit. 2022-04-11]. Dostupné online. (anglicky)

[Karlík_2022-42] KARLÍK, Tomáš. Vědci našli v oceánech přes pět tisíc druhů neznámých virů. Některé obsahují prastaré geny. Věda – ČT24 [online]. Česká televize, 2022-04-11 [cit. 2022-04-11]. Dostupné online.

[Tsukuba_2024-44] University of Tsukuba. Discovery of a third RNA virus lineage in extreme environments. Phys.Org [online]. 2024-01-26 [cit. 2024-01-29]. Dostupné online. (anglicky)

[Grybchuk_2018-46] GRYBCHUK, Danyil; AKOPYANTS, Natalia S.; KOSTYGOV, Alexei Y.; KONOVALOVAS, Aleksandras; LYE, Lon-Fye; DOBSON, Deborah E.; ZANGGER, Haroun, FASEL, Nicolas; BUTENKO, Anzhelika; FROLOV, Alexander O.; VOTÝPKA, Jan; d’AVILA-LEVY, Claudia M.; KULICH, Pavel; MORAVCOVÁ, Jana; PLEVKA, Pavel; ROGOZIN, Igor B.; SERVA, Saulius; LUKEŠ, Julius; BEVERLEY, Stephen M.; YURCHENKO, Vyacheslav. Viral discovery and diversity in trypanosomatid protozoa with a focus on relatives of the human parasite Leishmania. S. E506-E515. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 28. prosinec 2017. Svazek 115, čís. 3, s. E506-E515. Dostupné online. PDF [11]. Dále dostupné na: [12]. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1717806115. PMID 29284754. (anglicky)

[CT24_2018-47] r (ČTK). Ostrava má svůj virus. Podle vědců se OstraVirus nepodobá žádnému jinému na Zemi. Kapitola Všda. ČT24.cz [online]. Česká televize, 4. duben 2018. Dostupné online.

[Lauber_2017-50] LAUBER, Chris; SEITZ, Stefan; MATTEI, Simone; SUH, Alexander; BECK, Jürgen; HERSTEIN, Jennifer; BÖROLD, Jacob, SALZBURGER, Walter; KADERALI, Lars; BARTENSCHLAGER, Ralf; BRIGGS, John A. G. Deciphering the Origin and Evolution of Hepatitis B Viruses by Means of a Family of Non-enveloped Fish Viruses. S. 387–399.e6. Cell Host & Microbe [online]. Cell Press, Elsevier Inc., 31. srpen 2017. Svazek 22, čís. 3, s. 387–399.e6. Dostupné online. Dostupné také na: [13]. ISSN 1931-3128. DOI 10.1016/j.chom.2017.07.019. PMID 28867387. (anglicky)

[Yaravirus-51] BORATTO, Paulo V. M.; OLIVEIRA, Graziele P.; MACHADO, Talita B.; ANDRADE, Ana Cláudia S. P.; BAUDOIN, Jean-Pierre; KLOSE, Thomas; SCHULZ, Frederik, CHABRIÈRE, Eric; COLSON, Philippe; LEVASSEUR, Anthony; La SCOLA, Bernard; ABRAHÃO, Jônatas S. A mysterious 80 nm amoeba virus with a near-complete “ORFan genome” challenges the classification of DNA viruses. bioRχiv [online]. Cold Spring Harbor Laboratory, 28. leden 2020. Preprint. Dostupné online. Dostupné také na: [14]. DOI 10.1101/2020.01.28.923185. (anglicky)

[Colson_2013-52] COLSON, Philippe, a kol. “Megavirales”, a proposed new order for eukaryotic nucleocytoplasmic large DNA viruses. S. 2517–2521. Archives of Virology [online]. 29. červen 2013. Svazek 158, čís. 12, s. 2517–2521. Dostupné online. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-013-1768-6. PMID 23812617. (anglicky)

[Fischer_2016-53] FISCHER, Matthias G. Giant viruses come of age. S. 50–57. Current Opinion in Microbiology [online]. 19. březen 2016. Svazek 31, s. 50–57. Dostupné online. ISSN 1369-5274. DOI 10.1016/j.mib.2016.03.001. (anglicky)

[Halary_2016-54] HALARY, S.; TEMMAM, S.; RAOULT, D.; DESNUES, C. Viral metagenomics: are we missing the giants?. S. 34–43. Current Opinion in Microbiology [online]. 19. březen 2016. Svazek 31, s. 34–43. Dostupné online. ISSN 1369-5274. DOI 10.1016/j.mib.2016.01.005. (anglicky)

[Schulz_2020-56] SCHULZ, Frederik; ROUX, Simon; PAEZ-ESPINO, David, et al . Giant virus diversity and host interactions through global metagenomics. S. 432–436. Nature [online]. Springer Nature Limited, 22. leden 2020. Svazek 578, čís. 7795, s. 432–436. Dostupné online. Dostupné také na: [15]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/s41586-020-1957-x. (anglicky)

[Yoshikawa_2019-58] YOSHIKAWA, Genki; BLANC-MATHIEU, Romain; SONG, Chihong; KAYAMA, Yoko; MOCHIZUKI, Tomohiro; MURATA, Kazuyoshi; OGATA, Hiroyuki, TAKEMURA, Masaharu. Medusavirus, a novel large DNA virus discovered from hot spring water. Journal of Virology [online]. American Society for Microbiology, 6. únor 2019 [cit. 2019-02-26]. Svazek 93, čís. 8: e02130-18. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2019-02-27. Dostupné také na: [16]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.02130-18. PMID 30728258. (anglicky)

[Mihulka_2019-59] MIHULKA, Stanislav. Veliký Medusavirus promění bezbranné améby v kámen. OSEL.cz [online]. 25. únor 2019. Dostupné online. ISSN 1214-6307.

[Legendre_2015-60] LEGENDRE, Matthieu; LARTIGUE, Audrey; BERTAUX, Lionel; JEUDY, Sandra; BARTOLI, Julia; LESCOT, Magali; ALEMPIC, Jean-Marie, RAMUS, Claire; BRULEY, Christophe; LABADIE, Karine; SHMAKOVA, Lyubov; RIVKINA, Elizaveta; COUTÉ, Yohann; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel. In-depth study of Mollivirus sibericum, a new 30,000-y-old giant virus infecting Acanthamoeba. S. E5327–E5335. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 8. září 2015. Svazek 112, čís. 38, s. E5327–E5335. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1510795112. PMID 26351664. (anglicky)

[Yutin_2013-61] YUTIN, Natalya; KOONIN, Eugene V. Pandoraviruses are highly derived phycodnaviruses. S. 1–8. Biology Direct [online]. 23. říjen 2013. Svazek 8, čís. 25, s. 1–8. Dostupné online. PDF [17]. DOI 10.1186/1745-6150-8-25. (anglicky)

[Philippe_2013-62] PHILIPPE, Nadège, et al. Pandoraviruses: Amoeba Viruses with Genomes Up to 2.5 Mb Reaching That of Parasitic Eukaryotes. S. 281–286. Science [online]. 19. červenec 2013. Svazek 341, čís. 6143, s. 281–286. Dostupné online. ISSN 1095-9203. DOI 10.1126/science.1239181. (anglicky)

[Mihulka_2013-63] MIHULKA, Stanislav: Mimiviry jsou out, teď vládnou pandoraviry! O.S.E.L., 20. červenec 2013. Dostupné online

[Schulz_2017-64] SCHULZ, Frederik; YUTIN, Natalya; IVANOVA, Natalia N.; ORTEGA, Davi R.; LEE, Tae Kwon; VIERHEILIG, Julia; DAIMS, Holger, HORN, Matthias; WAGNER, Michael; JENSEN, Grant J.; KYRPIDES, Nikos C.; KOONIN, Eugene V.; WOYKE, Tanja. Giant viruses with an expanded complement of translation system components. S. 82–85. Science [online]. 7. duben 2017. Svazek 356, čís. 6333, s. 82–85. Dostupné online. ISSN 1095-9203. DOI 10.1126/science.aal4657. PMID 28386012. (anglicky)

[Arthofer_2024-65] ARTHOFER, Patrick; PANHÖLZL, Florian; DELAFONT, Vincent; HAY, Alban; REIPERT, Siegfried; CYRAN, Norbert; WIENKOOP, Stefanie. A giant virus infecting the amoeboflagellate Naegleria. Nature Communications [online]. 2024-04-24. Roč. 15, čís. 1. Dostupné online. Dostupné také na: [18]. ISSN 2041-1723. DOI 10.1038/s41467-024-47308-2. PMID 38658525. (anglicky)

[Arslan_2011-66] ARSLAN, Defne, et al. Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae. S. 17486–17491. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 18. říjen 2011. Svazek 108, čís. 42, s. 17486–17491. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1110889108. (anglicky)

[Desnues_2012-67] DESNUES, Christelle; LA SCOLA, Bernard; YUTIN, Natalya, FOURNOUS, Ghislain; ROBERT, Catherine; AZZA, Saïd; JARDOT, Priscilla; MONTEIL, Sonia; CAMPOCASSO, Angélique; KOONIN, Eugene V.; RAOULT, Didier. Provirophages and transpovirons as the diverse mobilome of giant viruses. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 15. říjen 2012. Online před tiskem. Dostupné online. DOI 10.1073/pnas.1208835109. (anglicky)

[Rodrigues_2019-68] RODRIGUES, Rodrigo Araújo Lima; MOUGARI, Said; COLSON, Phillipe; LA SCOLA, Bernard; ABRAHÃO, Jônatas Santos. “ Tupanvirus”, a new genus in the family Mimiviridae. S. 325–331. Archives of Virology [online]. Springer Nature Switzerland AG, 5. říjen 2018. Svazek 164, čís. 1, s. 325–331. Dostupné online. Dostupné také na: [19]. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-018-4067-4. PMID 30291500. (anglicky)

[Moumouvirus-69] YOOSUF, Niyaz, et al. Related Giant Viruses in Distant Locations and Different Habitats: Acanthamoeba polyphaga moumouvirus Represents a Third Lineage of the Mimiviridae That Is Close to the Megavirus Lineage. S. 1324–1330. Genome Biol. Evol. [online]. 4. prosinec 2012. Svazek 4, čís. 12, s. 1324–1330. ISSN 1759-6653. DOI 10.1093/gbe/evs109. (anglicky)

[Tupanvirus-70] ABRAHÃO, Jônatas; SILVA, Lorena; SANTOS SILVA, Ludmila; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; RODRIGUES, Rodrigo; ARANTES, Thalita; ASSIS, Felipe, BORATTO, Paulo; ANDRADE, Miguel; GEESSIEN KROON, Erna; RIBEIRO, Bergmann; BERGIER, Ivan; SELIGMANN, Herve; GHIGO, Eric; COLSON, Philippe; LEVASSEUR, Anthony KROEMER, ; Guido; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Tailed giant Tupanvirus possesses the most complete translational apparatus of the known virosphere. Nature Communications [online]. Macmillan Publishers Limited, 27. únor 2018. Svazek 9: 749. Dostupné online. ISSN 2041-1723. DOI 10.1038/s41467-018-03168-1. (anglicky)

[Andreani_2016-72] ANDREANI, Julien; AHERFI, Sarah; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; DI PINTO, Fabrizio; BITAM, Idir; RAOULT, Didier; COLSON, Philippe, La SCOLA, Bernard. Cedratvirus, a Double-Cork Structured Giant Virus, is a Distant Relative of Pithoviruses. S. 1–11. Viruses [online]. MDPI AG, 3. listopad 2016. Svazek 8, čís. 11: 300, s. 1–11. Dostupné online. Dostupné také na: [20]. ISSN 1999-4915. DOI 10.3390/v8110300. PMID 27827884. (anglicky)

[Andreani_2018-73] ANDREANI, Julien; KHALIL, Jacques Y. B.; BAPTISTE, Emeline; HASNI, Issam; MICHELLE, Caroline; RAOULT, Didier; LEVASSEUR, Anthony. Orpheovirus IHUMI-LCC2: A New Virus among the Giant Viruses. Frontiers in Microbiology [online]. Frontiers Media SA, 22. leden 2018. Roč. 8: 2643. Dostupné online. Dostupné také na: [21]. Dále dostupné na: [22]. ISSN 1664-302X. DOI 10.3389/fmicb.2017.02643. PMID 29403444. (anglicky)

[Claverie_2014-74] LEGENDRE, Matthieu; BARTOLI, Julia; SHMAKOVA, Lyubov, JEUDY, Sandra; LABADIE, Karine; ADRAIT, Annie; LESCOT, Magali; POIROT, Olivier; BERTAUX, Lionel; BRULEY, Christophe; COUTÉ, Yohann; RIVKINA, Elizaveta; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel. Thirty-thousand-year-old distant relative of giant icosahedral DNA viruses with a pandoravirus morphology. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 3. březen 2014. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1320670111. (anglicky)

[Yong_2014-75] YONG, Ed. Giant virus resurrected from 30,000-year-old ice. Nature News [online]. 3. březen 2014. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature.2014.14801. (anglicky)

[Týden-76] Vědci oživili 30 tisíc let starý virus z ledu. Týden [online]. 4. březen 2014. Dostupné online.

[Reteno_2015-77] RETENO, Dorine Gaëlle I.; BENAMAR, Samia; KHALIL, Jacques Bou; ANDREANI, Julien; ARMSTRONG, Nicholas; KLOSE, Thomas; ROSSMANN, Michael, COLSON, Philippe; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Faustovirus, an Asfarvirus-Related New Lineage of Giant Viruses Infecting Amoebae. S. 6585–6594. Journal of Virology [online]. 15. duben 2015 [cit. 2016-12-01]. Svazek 89, čís. 13, s. 6585–6594. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2016-03-20. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00115-15. (anglicky)

[Benamar_2016-78] BENAMAR, Samia; RETENO, Dorine Gaëlle I.; BANDALY, Victor; LABAS, Noémie; RAOULT, Didier; LA SCOLA, Bernard. Faustoviruses: Comparative Genomics of New Megavirales Family Members. S. 1–9. Frontiers in Microbiology [online]. 5. únor 2016. Svazek 7, čís. 3, s. 1–9. Dostupné online. Dostupné také na: [23]. DOI 10.3389/fmicb.2016.00003. (anglicky)

[Bajrai_2016-79] BAJRAI, Leena H.; BENAMAR, Samia; AZHAR, Esam I.; ROBERT, Catherine; LEVASSEUR, Anthony; RAOULT, Didier; LA SCOLA, Bernard. Kaumoebavirus, a New Virus That Clusters with Faustoviruses and Asfarviridae. S. 1–10. Viruses [online]. MDPI AG, 28. říjen 2016. Svazek 8, čís. 11: 278, s. 1–10. Dostupné online. Dostupné také na: [24]. ISSN 1999-4915. DOI 10.3390/v8110278. PMID 27801826. (anglicky)

[Andreani_2017-80] ANDREANI, Julien; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; SEVVANA, Madhumati; BENAMAR, Samia; DI PINTO, Fabrizio; BITAM, Idir; COLSON, Philippe, KLOSE, Thomas; ROSSMANN, Michael G.; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Pacmanvirus, a new giant icosahedral virus at the crossroads between Asfarviridae and faustoviruses. S. 1–11. Journal of Virology [online]. American Society for Microbiology, 26. červen 2017 [cit. 2019-02-26]. Svazek 91, čís. 14: e00212-17, s. 1–11. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2019-02-27. Dostupné také na: [25]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00212-17. PMID 28446673. (anglicky)

[Paez-Espino_2019-81] PAEZ-ESPINO, David; ZHOU, Jinglie; ROUX, Simon, et al . Diversity, evolution, and classification of virophages uncovered through global metagenomics. Microbiome [online]. BioMed Central Ltd, 10. prosinec 2019. Svazek 7, čís. 1: 157. Dostupné online. Dostupné také na: [26]. ISSN 2049-2618. DOI 10.1186/s40168-019-0768-5. PMID 31823797. (anglicky)

[Kauffman_2018-83] KAUFFMAN, Kathryn M.; HUSSAIN, Fatima A.; YANG, Joy; AREVALO, Philip; BROWN, Julia M.; CHANG, William K.; VANINSBERGHE, David, ELSHERBINI, Joseph; SHARMA, Radhey S.; CUTLER, Michael B.; KELLY, Libusha; POLZ, Martin F. A major lineage of non-tailed dsDNA viruses as unrecognized killers of marine bacteria. Kapitola Letters. Nature [online]. Macmillan Publishers Limited, 24. leden 2018. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature25474. (anglicky)

[Ignacio-Espinoza_2018-84] IGNACIO-ESPINOZA, Julio Cesar; FUHRMAN, Jed A. A non-tailed twist in the viral tale. S. 38–39. Nature [online]. Macmillan Publishers Limited, 24. leden 2018. Svazek 554, čís. 7690, s. 38–39. Dostupné online. Dostupné také na: [27]. Dále dostupné na: [28]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/d41586-018-00923-8. PMID 29388959. (anglicky)

[Mihulka_2018-85] MIHULKA, Stanislav. Nově objevené viry jsou lstiví zabijáci bakterií. OSEL.cz [online]. 27. leden 2018. Dostupné online. ISSN 1214-6307.

[STTV-86] NG, Terry Fei Fan; MANIRE, Charles; BORROWMAN, Kelly, LANGER, Tammy; EHRHART, Llewellyn; BREITBART, Mya. Discovery of a Novel Single-Stranded DNA Virus from a Sea Turtle Fibropapilloma by Using Viral Metagenomics. S. 2500–2509. Journal of Virology [online]. 30. prosinec 2008 [cit. 2020-05-11]. Svazek 83, čís. 6, s. 2500–2509. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2020-06-23. Dostupné také na: [29]. Dále dostupné na: [30]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.01946-08. PMID 19116258. (anglicky)

[Koonin_2018-87] KOONIN, Eugene V.; YUTIN, Natalya. Chapter Five - Evolution of the Large Nucleocytoplasmic DNA Viruses of Eukaryotes and Convergent Origins of Viral Gigantism. S. 167–202. Advances in Virus Research [online]. Elsevier Inc., 2018-11-10. Svazek 103, s. 167–202. Dostupné online. ISSN 0065-3527. DOI 10.1016/bs.aivir.2018.09.002. (anglicky)

[Koonin_2015-88] KOONIN, Eugene V.; DOLJA, Valerian V.; KRUPOVIC, Mart. Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. S. 2–25. Virology [online]. Elsevier Inc., 2015-03-12. Svazek 479–480, s. 2–25. Dostupné online. ISSN 0042-6822. DOI 10.1016/j.virol.2015.02.039. (anglicky)

[balt-90] BALTIMORE, D. Expression of animal virus genomes. Bacteriol Rev.. 1971, roč. 35, čís. 3, s. 235–41. Dostupné online. ISSN 0005-3678.

[Racaniello_2009-91] RACANIELLO, Vincent. Simplifying virus classification: The Baltimore system [online]. Virology Blog, 2009. Dostupné online.

[Krupovic_2015-92] KRUPOVIC, Mart; DOLJA, Valerian V.; KOONIN, Eugene V. Plant viruses of the Amalgaviridae family evolved via recombination between viruses with double-stranded and negative-strand RNA genomes. S. 1–7. Biology Direct [online]. 29. březen 2015. Svazek 10, čís. 12, s. 1–7. Dostupné online. PDF [31]. DOI 10.1186/s13062-015-0047-8. (anglicky)

[Bamford_2017-97] BAMFORD, Dennis H.; PIETILÄ, Maija K.; ROINE, Elina; ATANASOVA, Nina S.; DIENSTBIER, Ana; OKSANEN, Hanna M., a ICTV Report Consortium. The Online (10th) Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses [online]. 10. vyd. 2017-09-20, rev. 2017-09-21. Kapitola Pleolipoviridae. (anglicky)

[Turina_2020-98] Turina M. et al.: Taxonomy Proposal 2021.001F.R.Fusariviridae_1newfam, říjen 2020. Dostupné online Archivováno 28. 3. 2022 na Wayback Machine. v souboru ICTV Approved Proposals: Fungal and Protist Viruses

[Bunyaviridae_Study_Group_2016-100] Bunyaviridae Study Group: Create a new order, Bunyavirales, to accommodate nine families (eight new, one renamed) comprising thirteen genera. Proposal to ICTV, Nr. 2016.030a-vM, 2016. Dostupné online Archivováno 2. 12. 2016 na Wayback Machine. (anglicky)

[Lwoff_1962-101] LWOFF, André; HORNE, R. W.; TOURNIER, P. A system of viruses. S. 51–55. Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. [online]. 1962. Svazek 27, s. 51–55. PMID 13931895. (anglicky)

[pozn. 1]

[2]

[3]

[1]

[pozn. 2]

[9]

[4]

[10]

[11]

[12]

[pozn. 3]

[13]

[14]

[pozn. 4]

[18]

[pozn. 5]

[19]

[20]

[21]

[pozn. 6]

[pozn. 7]

[24]

[25]

[pozn. 8]

[27]

[pozn. 9]

[29]

[30]

[31]

[32]

[33]

[pozn. 10]

[34]

[pozn. 11]

[35]

[36]

[pozn. 12]

[pozn. 13]

[37]

[38]

[pozn. 14]

[pozn. 15]

[43]

[44]

[45]

[46]

[47]

[48]

[49]

[50]

[51]

[52]

[53]

[54]

[55]

[pozn. 16]

[56]

[57]

[58]

[59]

[60]

[61]

[62]

[63]

[64]

[pozn. 17]

[66]

[67]

[68]

[69]

[pozn. 18]

[72]

[73]

[pozn. 19]

[pozn. 20]

[pozn. 21]

[pozn. 22]

[pozn. 23]

[78]

[5]

[6]

[7]

[8]

[15]

[16]

[17]

[22]

[23]

[26]

[28]

[39]

[40]

[41]

[42]

[65]

[70]

[71]

[74]

[75]

[77]

Navigation

Navigace

Tématické portály