Proteom

Proteom je soubor proteinů, které jsou produkované z genomu daného organismu. Pojem proteom byl poprvé použit Marcem Wilkinsem [1] v roce 1995.

Proteom můžeme šířeji chápat buď jako buněčný, nebo jako kompletní:

  • Buněčný proteom je soubor proteinů, který se právě nachází v určité buňce, nebo buněčném typu, za daných podmínek. Např. proteom dělící se hematopoietické buňky v anafázi.
  • Kompletní proteom je potom proteom celého organismu, tedy suma proteomů všech buněčných typů. Do tohoto pojmu jsou zahrnuty i proteiny, které se v organismu pouze mohou vyskytovat, ale v danou chvíli syntetizovány nejsou.

Proteom je početnější než genom, zejména u eukaryot. Je to hlavně díky alternativnímu splicingu RNA a posttranslačním modifikacím proteinů, jako fosforylace nebo štěpení peptidového řetězce.

Reference

  1. WASINGER, Valerie C.; CORDWELL, Stuart J.; CERPA-POLJAK, Anne; YAN, Jun X.; GOOLEY, Andrew A.; WILKINS, Marc R.; DUNCAN, Mark W. Progress with gene-product mapping of the Mollicutes:Mycoplasma genitalium. S. 1090–1094. Electrophoresis [online]. 1995. Roč. 16, čís. 1, s. 1090–1094. Dostupné online. DOI 10.1002/elps.11501601185. PMID 7498152. (anglicky) 

Související články