Pyrimidin

Pyrimidin
Pyrimidin.svg
Pyrimidine.jpeg
Obecné
Systematický název1,3-diazin
Sumární vzorecC4H4N2
Identifikace
Registrační číslo CAS
Vlastnosti
Molární hmotnost80,08 g/mol
Bezpečnost
GHS02 – hořlavé látky
GHS02
GHS05 – korozivní a žíravé látky
GHS05
[1]
Nebezpečí[1]
Není-li uvedeno jinak, jsou použity
jednotky SI a STP (25 °C, 100 kPa).
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Pyrimidin je šestičlenná heterocyklická aromatická organická sloučenina podobná benzenu a pyridinu. Obsahuje dva atomy dusíku na pozicích 1 a 3 v šestičlenném kruhu. Název je odvozen od řeckého pyr (teplo, oheň) a sloučenin skupiny amidů. Podle systematického názvosloví je také nazýván 1,3-diazin.

Pyrimidin je izomerický se dvěma formami diazinu. Jsou to pyrazin (atomy dusíku na 1 a 4 pozici) a pyridazin (atomy dusíku na 1 a 2 pozici).

Deriváty pyrimidinu jsou tři nukleové báze, které se nacházející v nukleotidech nukleových kyselin. Jsou to cytosin (C), thymin (T) a uracil (U). Jsou to životně důležité látky, které se nalézají ve všech živých organismech a jsou nositeli jejich dědičných vlastností.

Vzorec pyrimidinu

Různé typy vzorců pyrimidinu

Deriváty pyrimidinu

Příklady některých derivátů pyrimidinu
VzorecJménoC2C4C5C6
C4H5N3Ocytosin=O–NH2–H–H
C4H4N2O2uracil=O=O–H–H
C4H3FN2O2fluorouracil=O=O–F–H
C5H6N2O2thymin=O=O–CH3–H
C4H4N2O3kyselina barbiturová=O=O–H=O
C5H4N2O4kyselina orotická=O=O–H-COOH

Nukleové báze

Nejdůležitějšími deriváty pyrimidinu jsou nukleové báze - cytosin, uracil, thymin. Dalšími nukleovými bázemi jsou deriváty odvozené z purinu - adenin, guanin.

Nukleové báze odvozené z pyrimidinu a purinu se v nukleových kyselinách obvykle vážou na ribózu (ribonukleová kyselina RNA) nebo na deoxyribózu (deoxyribonukleová kyselina DNA):

V nukleových kyselinách vytvářejí nukleové báze doplňkové dvojice (komplementární páry), v nichž se vždy jedna purinová a jedna pyrimidinová báze vzájemně vážou vodíkovými vazbami. Guanin se váže s cytosinem a adenin s thyminem nebo s uracilem. Tyto vazby tvoří kód k zápisu genetické informace v živých organismech. Komplementární párování pak umožňuje tuto informaci realizovat při procesech replikace, transkripce a translace.

Chemické vlastnosti

Chemické vlastnosti pyrimidinu se v mnohém shodují s pyridinem a benzenem. Jeho aromatický charakter způsobuje, že se snadno zúčastňuje elektrofilních a nukleofilních aromatických substitucí. Tedy reakcí, kdy elektrofil nebo nukleofil nahrazuje jinou skupinu navázanou na aromatické jádro. S narůstajícím počtem atomů dusíku v cyklu klesá energie pi elektronů a elektrofilní aromatická substituce se stává mnohem obtížnější, zatímco nukleofilní aromatická substituce se stává snadnější.

Reference

V tomto článku byl použit překlad textu z článku Pyrimidin na německé Wikipedii.

V tomto článku byl použit překlad textu z článku Pyrimidine na anglické Wikipedii.

  1. a b Pyrimidine. pubchem.ncbi.nlm.nih.gov [online]. PubChem [cit. 2021-05-23]. Dostupné online. (anglicky) 

Externí odkazy

Média použitá na této stránce

Pyrimidine chemical structure.svg
Různé typy vzorců pyrimidinu.
Uracil.svg
Chemical structure of uracil.
Pyrimidin.svg
Structure of pyrimidine
Cytosine chemical structure.png
Autor: Cacycle (diskuse), Licence: CC BY-SA 3.0
Chemical structure of Cytosine. High-resolution b/w PNG; ChemDraw / Photoshop.
Tymina.svg
thymine