Rab (protein)

Rab7 z různých pohledů

Rab je rodina proteinů, jež se řadí do nadrodiny Ras monomerických G proteinů.^[1] U člověka bylo dosud identifikováno kolem 45 různých typů těchto proteinů.^[2] Vyskytují se však u všech eukaryotických organismů a pravděpodobně i u archebakterií.^[3] Rab GTPázy regulují mnoho kroků membránové přepravy včetně tvorby váčků, jejich pohybu po aktinových a tubulinových vláknech a splývání membrán. Umožňují, aby váčky putovaly buňkou přesně na místo svého určení.

Regulace

Rab proteiny jsou opatřené geranylgeranylovou skupinou, která umožňuje jejich asociaci s membránou. Pokud jsou v cytoplazmě, mají na sobě navázaný GDP, neboť výměnu GDP za GTP inhibuje protein GDI (guanine nucleotide dissociation inhibitor). Existují však i speciální faktory, které jsou schopné zablokovat GDI, načež Rab-specifický GEF vymění GDP za GTP. Tato změna aktivuje Rab proteiny, které následně plní svou funkci při vytváření, transportu a splývání váčku. Na cílové membráně je aktivována GTPázová aktivita, dochází k hydrolýze GTP na GDP, načež se v cytoplazmě opět může navázat GDI inhibitor a celý proces se může opakovat.^[1]

Zástupci

Jedná se o rozsáhlou skupinu proteinů, dělených na jednotlivé podrodiny označené čísly 1 – 45 s výjimkou 16 („Rab16“ je neplatný název).^[2] Databáze RabDB udává v lidském genomu 115 genů kódujících Rab proteiny (Ran proteiny nejsou zahrnuty).^[4]

Reference