SNARE

Trans-SNARE komplex

SNARE (zkratka ze sousloví SNAP receptor) je označení pro asi 20 proteinů, které hrají zásadní roli ve splývání membránových váčků v buňkách. Umožňují tedy (spolu např. s Rab proteiny) důležitou část tzv. vezikulárního transportu uvnitř buňky. Jednotlivé SNARE proteiny se specializují na konkrétní membránové organely. Existují dva základní typy SNARE bílkovin: v-SNARE (podle slova vezikul, tedy váček) a t-SNARE (z angl. „target“, tedy cíl).[1] Jsou to obvykle transmembránové proteiny a obsahují sadu alfa-helixů.[2]

Mechanismus

Podle tzv. SNARE hypotézy se zdá, že v-SNARE a t-SNARE proteiny se na sebe vážou, přičemž helikální doména jednoho proteinu se omotá kolem helixu druhého. Vzniká tím tzv. trans-SNARE komplex (SNAREpin).[1] Bylo zjištěno, že během vazby SNARE proteinů dochází k interakci argininu na jednom proteinu s glutaminem na druhém proteinu. Proto se také někdy SNARE proteiny dělí spíše na R-SNARE (R je arginin) a Q-SNARE (Q je glutamin).[2]

Po proběhnutí fúze membrán dochází k jakési recyklaci SNARE proteinů, aby mohly pracovat opakovaně. K tomu se využívá AAA ATPáza jménem NSF.[2]

SNARE na synapsích

Průběh exocytózy váčků do synaptické štěrbiny vyznačeny mj. SNARE proteiny

SNARE proteiny v nervové soustavě na tzv. synapsích (kde dochází k fúzi neurotransmiterového váčku s membránou buňky) jsou prozkoumány velmi dobře. V-SNARE protein se zde nazývá také synaptobrevin a nachází se na váčku. Na plazmatické membráně se nachází t-SNARE protein syntaxin. Konečně zde vystupuje ještě třetí protein, t-SNARE periferní protein Snap25, který oba zmíněné SNARE proteiny dále spojuje.[1]

Poškození SNARE proteinů v nervové soustavě může představovat v těle velký zdravotní problém. Bakterie, které způsobují tetanus či botulismus, jsou schopné vylučovat neurotoxiny, jež rozkládají SNARE proteiny a blokují přenos signálu na nervových synapsích.[1]

Reference

  1. ↑ a b c d Alberts, Bruce , et al. The Molecular Biology of the Cell. [s.l.]: Garland Science, 2002. (4th. ed). ISBN 0-8153-3218-1. 
  2. ↑ a b c POLLARD, Thomas D; EARNSHAW, William C. Cell Biology. 2. vyd. [s.l.]: Saunders, 2007. ISBN 1416022554. S. 928. 

Externí odkazy

Média použitá na této stránce

PDB 1sfc EBI.jpg
Cartoon representation of the molecular structure of protein registered with 1sfc code.
Exocytosis-machinery.jpg
Autor: Danko Dimchev Georgiev, M.D., Licence: CC-BY-SA-3.0
Molecular machinery engaged in synaptic transmitter release.
Also used in "Nano and Molecular Electronics Handbook". Lyshevski SE (editor), Nano and Microengineering Series, Boca Raton: CRC Press, 2007, pp. 17-11--17-41.