Seznam botanických zahrad v Česku

Seznam botanických zahrad v Česku zahrnuje i arboreta a je řazený abecedně podle města (obce). Větší část je začleněna do Unie botanických zahrad České republiky, mnohé jsou součástí odborných středních škol.

• Bečov nad Teplou – Bečovská botanická zahrada, spravuje ZO ČSOP Berkut
• Benešov – Školní botanická zahrada Benešov, spravuje Vyšší odborná škola a Střední zemědělská škola v Benešově
• Bílá Lhota – Arboretum Bílá Lhota, pod Vlastivědným muzeem Olomouc
• Borotín – Arboretum Borotín
• Boskovice – Arboretum Šmelcovna
• Brno – Botanická zahrada a arboretum Mendelovy zemědělské a lesnické univerzity v Brně^[1]
• Brno – Botanická zahrada Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity v Brně^[2]
• Brno – Centrum léčivých rostlin Lékařské fakulty Masarykovy univerzity v Brně
• Březová-Oleško - Japonská zahrada Oleško^[3]
• Dalovice – Botanická zahrada při Střední zemědělské škole Dalovice
• Děčín, část Libverda – Botanická zahrada Děčín-Libverda, spravuje Střední škola zahradnická a zemědělská A. E. Komerse^[4]
• Děčín, část Libverda – Arboretum Děčín-Libverda
• Dubiny – Soukromá botanická zahrada v Dubinách^[3]
• Hejnice, část Ferdinandov – Arboretum Josefa Eberta
• Hradec Králové – Botanická zahrada léčivých rostlin Farmaceutické fakulty UK^[5]
• Hranice – Arboretum Střední lesnické školy v Hranicích
• Hrubá Skála – Arboretum Bukovina
• Chudenice – Americká zahrada
• Jablunkov – Park plicního sanatoria v Jablunkově, Odborný léčebný ústav tuberkulózy a respiračních nemocí
• Kostelec nad Černými lesy – Arboretum Kostelec nad Černými lesy,^[6] Česká zemědělská univerzita v Praze
• Košumberk – Hamzův park a arboretum^[7]
• Křtiny – Arboretum Křtiny
• Liberec – Botanická zahrada Liberec
• Mělník – Botanická zahrada při Vyšší odborné škole zahradnické a Střední zahradnické škole Mělník
• Nové Město na Moravě – Městské arboretum v Novém Městě na Moravě^[8]
• Olomouc – Botanická zahrada Univerzity Palackého^[9]
• Olomouc – Botanická zahrada Výstaviště Flora Olomouc
• Ondřejov – Hvězdárna a arboretum Ondřejov
• Opava – Arboretum Nový Dvůr, Slezské zemské muzeum^[10]
• Ostrava – Botanická zahrada Přírodovědecké fakulty Ostravské univerzity^[11]
• Ostrava – Zoologická zahrada Ostrava
• Ostrov – Botanická zahrada a arboretum Horní Hrad
• Paseka – Arboretum Makču Pikču
• Písek – Arboretum Lesnické školy v Písku
• Plzeň – Zoologická a botanická zahrada města Plzně
• Plzeň – Arboretum Sofronka,^[12] VÚLHM, Plzeň
• Praha – Botanická zahrada hl. m. Prahy
• Praha – Královská obora
• Praha – Botanická zahrada Univerzity Karlovy, Přírodovědecká fakulta
• Praha – Botanická zahrada SOŠ, SOU, OU a Učiliště, Praha 9-Malešice
• Praha – Botanická zahrada Fakulty tropického zemědělství v Praze, Česká zemědělská univerzita, Praha 6-Suchdol
• Prostějov – Botanická zahrada Petra Albrechta
• Průhonice – Průhonický park, Botanický ústav AV ČR^[13]
• Průhonice – Průhonická botanická zahrada na Chotobuzi, Botanický ústav AV ČR^[14]
• Průhonice – Dendrologická zahrada Průhonice, Výzkumný ústav Silva Taroucy pro krajinu a okrasné zahradnictví^[15]
• Rakovník – Botanická zahrada Střední zemědělské školy Rakovník^[16]
• Řícmanice – Arboretum Řícmanice
• Semetín - Arboretum Semetín, Městské lesy Vsetín^[3]
• Šluknov – Střední lesnická škola Šluknov,^[17] arboretum je na dvou rozdílných místech
• Štramberk – Botanická zahrada a arboretum Štramberk
• Tábor – Botanická zahrada při VOŠ a SZeŠ v Táboře^[18]
• Teplice – Botanická zahrada Teplice^[19]
• Třeboň – Sbírka vodních a mokřadních rostlin v areálu třeboňského pracoviště Botanického ústavu AV ČR
• Týn nad Vltavou – Přírodovědné muzeum Semenec
• Ústí nad Labem – Naučný botanický park, katedra biologie Přírodovědecké fakulty Univerzity J. E. Purkyně v Ústí nad Labem^[20]
• Vrahovice – Arboretum Vrahovice
• Vrchlabí – Genofondová zahrada Správy KRNAP
• Vysoké Chvojno – Arboretum Vysoké Chvojno
• Zákupy – Arboretum Nové Zákupy
• Zlín – Zoologická zahrada Zlín
• Žampach – Arboretum Žampach

• CHYTRÁ, Magdalena; HANZELKA, Petr; KACEROVSKÝ, Radoslav. Botanické zahrady a arboreta České republiky. Praha: Academia a Unie botanických zahrad České republiky, 2010. 
• ROUDNÁ, Milena; HANZELKA, Petr. Botanické zahrady České republiky. Historie, význam a přínos k plnění mezinárodních závazků. Praha: Ministerstvo životního prostředí, 2006. ISBN 80-7212-441-2. 

• Unie botanických zahrad České republiky
• Florius
• Arboretum
• Seznam botanických zahrad a arboret v Praze