Testování covidu-19

© Raimond Spekking / CC BY-SA 4.0 (via Wikimedia Commons)
Odebírání vzorku výtěrem z nosohltanu
© Raimond Spekking / CC BY-SA 4.0 (via Wikimedia Commons)
Odebírání vzorku výtěrem z hrdla

Testování covidu-19 zahrnuje především laboratorní metody, vedoucí k průkazu akutní či prodělané infekce virem SARS-CoV-2. Vyhledávání a testování potenciálních nakažených je jedním ze základních pilířů epidemiologické surveillance[1] (sledování výskytu nemoci) a je proto důrazně doporučováno Světovou zdravotnickou organizací (WHO).

Testovací metody

Průkaz virové RNA

Vyhodnocování real-time PCR testů
Termocykler na vyhodnocování PCR testů

K rutinnímu průkazu infekce se používají testy, detekující přímo genetickou informaci viru (ribonukleovou kyselinu – RNA) ve vzorku od pacienta. Za vhodný vzorek se považuje výtěr z hltanu, nosohltanu, případně z dolních cest dýchacích, odebraný například během bronchoskopie či intubace pacienta.[2] Virová RNA se prokazuje metodou kvantitativní polymerázové řetězové reakce (anglicky real-time PCR nebo zkratka qPCR)[3], která umožňuje přímo kvantifikovat množství virové RNA ve vzorku. Koncem března 2020 bylo v USA ve zrychleném procesu schvalování autorizováno použití tzv. point-of-care testů ke kvalitativní detekci virové RNA, které umožní prokázat infekci během 45 minut.[4] [5]

Antigenní testy

Podrobnější informace naleznete v článku Rychlý antigenní test na covid-19.

Antigenní testy patří do skupiny testů přímého průkazu viru. U nich se netestuje ribonukleová kyselina, nýbrž antigen, bílkovina, která se objeví na vzorku z dýchací soustavy, pokud se virus v dané chvíli aktivně replikuje. Proto je tento test vhodný k odhalení právě probíhající infekce. Provádí se výtěrem z nosohltanu. K vyhodnocení není potřeba laboratoř, výsledek je znám do 30 minut. Spolehlivost antigenního testu ale ovlivňuje například koncentrace viru či doba od nástupu nemoci. Některé nakažené tedy tento test nemusí odhalit.[6]

Pro testování SARS-CoV-2 jsou antigenní testy k dispozici od konce léta 2020.[7] Návod na používání a interpretaci výsledků antigenního testu a platné algoritmy publikovalo Ministerstvo zdravotnictví v listopadu.[8]

Průkaz protilátek

Průkaz protilátek v krvi (séru) pacienta je tzv. sérologickým testem. Infekce SARS-CoV-2 vyvolává obdobně jako jiné infekce produkci protilátek proti bílkovinám viru buňkami imunitního systému. Většina infikovaných jedinců vyvine protilátky do 5–10 dnů od počátku příznaků infekce.[9][10] Vzhledem k tomuto relativnímu zpoždění v tvorbě protilátek se sérologické testy nehodí k akutnímu testování nemocných. Význam mají ve zpětném průkazu infekce u jedinců s lehkými či žádnými příznaky onemocnění.[11] Z tohoto pohledu jsou důležité k posouzení celkového rozsahu epidemie a jsou nedílnou součástí epidemiologické surveillance.[1] Ovšem testují se jen protilátky IgG, někdy IgM, ale imunoglobulin A prakticky nikoli, což značně podceňuje odhady rozšíření nemoci.[12]

Zajímavosti

V noci, kdy je aktivita viru v těle nižší, jsou testy méně spolehlivé.[13]

Vývoj vlastních testů v AV ČR

Akademie věd České republiky spustila vlastní webový portál Laboratoře proti koronaviru, který slouží ke koordinaci práce laboratoří, které se podílejí na testování vzorků.

V České republice se do vývoje vlastních testovacích kitů zapojil tým z UOCHB AV ČR, který spolu vyvinul vlastní metodu izolace virové RNA ze vzorků odebraných pacientům. Metoda je založena na použití originálních magnetických nanočástic z dílny Radka Zbořila z olomouckého RCPTM.[14] Postupně je validována ve spolupráci s 2. LF UK, nemocnicí Na Bulovce a Státním zdravotním ústavem. V projektu je zapojen i Biocev, ÚMG AV ČR a CEITEC. 7 milionů korun na výzkum a vývoj nových diagnostických testů pro onemocnění covid-19 darovala firma IOCBTech, dceřiná společnost Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR.[15]

Akademie věd České republiky spolupracuje s Genomic Research Centre, Academia Sinica, Taipei, Tchaj-wan. Ten poskytuje vědecké obci zdarma vlastní rekombinantní a glykosylovaný spike protein viru propagovaný na lidských HEK 293 buňkách v rozpustné formě bez transmembránové domény.[16]

Reference

  1. a b Protiepidemická opatření v ohnisku nákazy – WikiSkripta. www.wikiskripta.eu [online]. [cit. 2020-03-24]. Dostupné online. 
  2. Laboratory testing for coronavirus disease (COVID-19) in suspected human cases [online]. [cit. 2020-03-24]. Dostupné online. 
  3. SR, MEFANET, síť lékařských fakult ČR a. Polymerázová řetězová reakce – WikiSkripta. www.wikiskripta.eu [online]. [cit. 2020-03-24]. Dostupné online. 
  4. COMMISSIONER, Office of the. Coronavirus (COVID-19) Update: FDA Issues first Emergency Use Authorization for Point of Care Diagnostic. FDA [online]. 2020-03-21 [cit. 2020-03-24]. Dostupné online. (anglicky) 
  5. XPRSARS-COV2-10 - Instructions for Use [online]. [cit. 2020-03-24]. Dostupné online. [nedostupný zdroj]
  6. Jan Martinek, Právo: Antigenní testy nezachytí třetinu pacientů, 2. 11. 2020
  7. SVOBODA, Vít. Smejkal o antigenních testech: Fungují, když se provádí správně. Odběr by vás měl téměř rozbrečet. iROZHLAS [online]. Český rozhlas, 2020-11-10 [cit. 2020-12-20]. Dostupné online. 
  8. MZCR, Pro zdravotníky (cit. 11. 11. 2020)
  9. TO, Kelvin Kai-Wang; TSANG, Owen Tak-Yin; LEUNG, Wai-Shing. Temporal profiles of viral load in posterior oropharyngeal saliva samples and serum antibody responses during infection by SARS-CoV-2: an observational cohort study. The Lancet Infectious Diseases. 2020-03-23, roč. 0, čís. 0. Dostupné online [cit. 2020-03-24]. ISSN 1473-3099. DOI 10.1016/S1473-3099(20)30196-1. (English) 
  10. ZHANG, Wei; DU, Rong-Hui; LI, Bei. Molecular and serological investigation of 2019-nCoV infected patients: implication of multiple shedding routes. Emerging Microbes & Infections. 2020-01-01, roč. 9, čís. 1, s. 386–389. PMID: 32065057. Dostupné online [cit. 2020-03-24]. DOI 10.1080/22221751.2020.1729071. PMID 32065057. 
  11. SUBBARAMAN, Nidhi. Coronavirus tests: researchers chase new diagnostics to fight the pandemic. Nature. 2020-03-23. Dostupné online [cit. 2020-03-24]. DOI 10.1038/d41586-020-00827-6. (anglicky) 
  12. Are antibody tests underestimating the spread of COVID-19?. medicalxpress.com [online]. 2020-09-03 [cit. 2020-12-28]. Dostupné online. (anglicky) 
  13. SULLIVAN, Aran. COVID-19 virus test sensitivity varies with body's circadian rhythm, according to research. medicalxpress.com [online]. 2021-10-26 [cit. 2022-08-16]. Dostupné online. (anglicky) 
  14. Jan Konvalinka. www.facebook.com [online]. [cit. 2020-04-09]. Dostupné online. 
  15. PŘEHLEDNĚ: Jak Akademie věd ČR pomáhá v boji proti koronavirové nákaze - Akademie věd České republiky. www.avcr.cz [online]. [cit. 2020-04-09]. Dostupné online. 
  16. SARS-CoV-2 Free Research Materials. Ma Lab @中央研究院 Taiwan [online]. [cit. 2020-04-09]. Dostupné online. (anglicky) 

Externí odkazy

Wikipedie neručí za správnost lékařských informací v tomto článku. V případě potřeby vyhledejte lékaře!
Přečtěte si prosím pokyny pro využití článků o zdravotnictví.

Média použitá na této stránce

Star of life2.svg
Star of life, blue version. Represents the Rod of Asclepius, with a snake around it, on a 6-branch star shaped as the cross of 3 thick 3:1 rectangles.
Design:
The logo is basically unicolor, most often a slate or medium blue, but this design uses a slightly lighter shade of blue for the outer outline of the cross, and the outlines of the rod and of the snake. The background is transparent (but the star includes a small inner plain white outline). This makes this image usable and visible on any background, including blue. The light shade of color for the outlines makes the form more visible at smaller resolutions, so that the image can easily be used as an icon.

This SVG file was manually created to specify alignments, to use only integers at the core 192x192 size, to get smooth curves on connection points (without any angle), to make a perfect logo centered in a exact square, to use a more precise geometry for the star and to use slate blue color with slightly lighter outlines on the cross, the rod and snake.

Finally, the SVG file is clean and contains no unnecessary XML elements or attributes, CSS styles or transforms that are usually added silently by common SVG editors (like Sodipodi or Inkscape) and that just pollute the final document, so it just needs the core SVG elements for the rendering. This is why its file size is so small.
Infektionsschutzzentrum im Rautenstrauch-Joest-Museum, Köln-6313 (cropped).jpg
© Raimond Spekking / CC BY-SA 4.0 (via Wikimedia Commons)
A nasopharyngeal swab being used to test for SARS-CoV-2 virus and the associated COVID-19 illness.
Running the real time RT-PCR (05811026) (49868938548).jpg
Autor: IAEA Imagebank, Licence: CC BY 2.0
Running the real time RT-PCR (05811026)
Infektionsschutzzentrum im Rautenstrauch-Joest-Museum, Köln-6306 (cropped).jpg
© Raimond Spekking / CC BY-SA 4.0 (via Wikimedia Commons)
Infektionsschutzzentrum im Kulturquartier/Rautenstrauch-Joest-Museum, Köln. Getestet werden dort ausschließlich Personen, die in sogenannten kritischen Infrastrukturen tätig sind.
Mitarbeiter des Infektionsschutzzentrums demonstrieren an einem Feuerwehrmann, der sich als Testperson zur Verfügung stellt, wie ein Abstrich durchgeführt wird.
Cycler offen.JPG
Geöffneter Thermocycler mit 8 PCR-Reaktionen