Transferová-mediátorová RNA

tmRNA sdílí rysy tRNA a mRNA

Transferová-mediátorová RNA (tmRNA) je molekula RNA, která má rysy transferové RNA (tRNA) i mediátorové RNA (mRNA). Vyskytuje se u řady bakterií a v plastidech.[1] Slouží k záchraně ribozomu, který nerozpoznal stop kodon a nemůže ukončit translaci. K takovému ribozomu se tmRNA nejdříve naváže jako tRNA a následně je jím přeložena jako mRNA. tmRNA kóduje krátký polypeptid sloužící jako značka pro degradaci vznikajícího proteinu, zajišťuje degradaci poškozené mRNA a uvolňuje ribozom.[2]

tmRNA obsahuje řadu modifikovaných bází, například pseudouridin a ribothymidin, čímž tmRNA mimikuje strukturu tRNA.,[3]

Reference

  1. ↑ GUENEAU DE NOVOA, P.; WILLIAMS, KP. The tmRNA website: reductive evolution of tmRNA in plastids and other endosymbionts.. Nucleic Acids Res. Jan 2004, roč. 32, čís. Database issue, s. D104-8. DOI 10.1093/nar/gkh102. PMID 14681369. 
  2. ↑ KEILER, KC. Biology of trans-translation.. Annu Rev Microbiol. 2008, roč. 62, s. 133–51. Dostupné online. DOI 10.1146/annurev.micro.62.081307.162948. PMID 18557701. 
  3. ↑ FELDEN, B.; HANAWA, K.; ATKINS, JF., et al. Presence and location of modified nucleotides in Escherichia coli tmRNA: structural mimicry with tRNA acceptor branches.. EMBO J. Jun 1998, roč. 17, čís. 11, s. 3188–96. DOI 10.1093/emboj/17.11.3188. PMID 9606200. 

Média použitá na této stránce