Microbial interactions visualized through microbial co-occurrence networks
a) Microbial interactions are influenced by environmental factors and are separated into positive, neutral, and negative interactions types. b) Microbial co-occurrence and co-exclusion networks help visualizing microbial interactions. In such networks, nodes usually represent taxa of microorganisms, and edges represent statistically significant associations between nodes. Green edges usually stay for positive interactions, while red edges visualize negative interactions between the microorganisms. c) Testing of the hypotheses resulted from the network analyses in relevant model systems is required for a comprehensive study of microbial interactions
Relevantní obrázky
Relevantní články
MikrobiomMikrobiom (původně μικρός a βίος je organizované společenství mikroorganismů kolonizující jakýkoliv prostor. Přesněji ji definovali v roce 1988 Whipps et al. jako „mikrobiální společenství zabírající definované stanoviště, které má odlišné fyzikálně-chemické vlastnosti." Termín tedy odkazuje nejen na mikroorganismy přítomné v prostředí, ale také zahrnuje jejich prostředí. V roce 2020 zveřejnil mezinárodní panel odborníků výsledek svých diskusí o definici mikrobiomu. Navrhli definici mikrobiomu založenou na novém uvedení „kompaktního, jasného a komplexního popisu termínu“ původně uvedeného Whipps et al., avšak doplněné o dva hlouběji vysvětlující odstavce. První vysvětlující odstavec se věnuje popisu dynamického charakter mikrobiomu a druhý vysvětlující odstavec jasně odděluje pojem mikrobiota od pojmu mikrobiom. .. pokračovat ve čtení